More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1907 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1907  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 		 200 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1847  riboflavin synthase subunit alpha  99.5 
 
 		 200 aa  402  1e-111  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0581  riboflavin synthase subunit alpha  77.61 
 
 		 208 aa  310  9e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04399  riboflavin synthase subunit alpha  78.06 
 
 		 200 aa  309  2e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  54.04 
 
 		 219 aa  212  1.9999999999999998e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  55.84 
 
 		 220 aa  208  5e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1868  riboflavin synthase, alpha subunit  54.64 
 
 		 216 aa  207  8e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0165858  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  52.58 
 
 		 221 aa  204  9e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0691  riboflavin synthase, alpha subunit  52.26 
 
 		 220 aa  202  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  54.36 
 
 		 227 aa  202  2e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  53.27 
 
 		 220 aa  201  4e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3457  riboflavin synthase subunit alpha  52.26 
 
 		 220 aa  200  9.999999999999999e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766476 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  52.26 
 
 		 219 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  51.76 
 
 		 221 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  51.76 
 
 		 221 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4461  riboflavin synthase subunit alpha  51.76 
 
 		 220 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  51.76 
 
 		 221 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  52.76 
 
 		 220 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0376  riboflavin synthase subunit alpha  54.31 
 
 		 221 aa  199  1.9999999999999998e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0815037 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  52.26 
 
 		 219 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  51.76 
 
 		 221 aa  198  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  51.76 
 
 		 219 aa  197  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  48.21 
 
 		 220 aa  195  4.0000000000000005e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  50 
 
 		 217 aa  194  7e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0474  riboflavin synthase, alpha subunit  50.25 
 
 		 218 aa  193  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0298  riboflavin synthase, alpha subunit  50.25 
 
 		 218 aa  193  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  49.48 
 
 		 217 aa  191  4e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  49.75 
 
 		 220 aa  191  8e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  48.5 
 
 		 217 aa  190  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0923  riboflavin synthase subunit alpha  47 
 
 		 218 aa  187  7e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2384  riboflavin synthase subunit alpha  51.03 
 
 		 200 aa  186  2e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.599759  normal  0.02171 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1017  riboflavin synthase subunit alpha  48.5 
 
 		 217 aa  182  3e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.743536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2140  riboflavin synthase subunit alpha  47.69 
 
 		 223 aa  182  4.0000000000000006e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256216 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  47.74 
 
 		 221 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2469  riboflavin synthase subunit alpha  47.69 
 
 		 223 aa  181  7e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.032999 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1145  riboflavin synthase subunit alpha  46.91 
 
 		 217 aa  180  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000276723  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1097  riboflavin synthase subunit alpha  48 
 
 		 218 aa  179  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107827  normal  0.803042 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1163  riboflavin synthase subunit alpha  48 
 
 		 218 aa  179  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.166605  normal  0.121939 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1097  riboflavin synthase subunit alpha  48 
 
 		 218 aa  179  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146706  normal  0.608902 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3468  riboflavin synthase subunit alpha  47.5 
 
 		 218 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0899  riboflavin synthase subunit alpha  50.52 
 
 		 219 aa  179  4e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.484781  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2777  riboflavin synthase subunit alpha  48.45 
 
 		 218 aa  176  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0829317  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3158  riboflavin synthase subunit alpha  47.94 
 
 		 218 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00280959  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1163  riboflavin synthase subunit alpha  46 
 
 		 221 aa  176  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000497127  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3302  riboflavin synthase subunit alpha  48.45 
 
 		 218 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.121431  decreased coverage  0.000098078 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1212  riboflavin synthase subunit alpha  48.45 
 
 		 218 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.254692 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3159  riboflavin synthase subunit alpha  48.45 
 
 		 218 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00317838  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  45 
 
 		 216 aa  176  3e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2189  riboflavin synthase subunit alpha  50.78 
 
 		 201 aa  175  4e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000572802 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1188  riboflavin synthase subunit alpha  47.94 
 
 		 221 aa  175  4e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0484679  normal  0.881373 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2024  riboflavin synthase subunit alpha  50.52 
 
 		 218 aa  174  9e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1383  riboflavin synthase subunit alpha  47.42 
 
 		 220 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00417649  hitchhiker  0.000000386622 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1036  riboflavin synthase subunit alpha  45.88 
 
 		 219 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00015592  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  44.67 
 
 		 217 aa  170  1e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  43.3 
 
 		 218 aa  170  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2097  riboflavin synthase subunit alpha  48.22 
 
 		 199 aa  170  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0312217  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0731  riboflavin synthase subunit alpha  41.75 
 
 		 232 aa  169  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  48.72 
 
 		 200 aa  170  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4095  riboflavin synthase subunit alpha  47.94 
 
 		 197 aa  168  6e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  45.41 
 
 		 216 aa  167  7e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1274  riboflavin synthase subunit alpha  46.91 
 
 		 220 aa  167  7e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000236102  hitchhiker  0.00000000155009 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  41.24 
 
 		 215 aa  166  2.9999999999999998e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1379  riboflavin synthase subunit alpha  48.48 
 
 		 220 aa  164  5.9999999999999996e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1824  riboflavin synthase subunit alpha  47.94 
 
 		 196 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.326708  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0061  riboflavin synthase subunit alpha  45.36 
 
 		 218 aa  161  6e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.201459  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2120  riboflavin synthase subunit alpha  47.29 
 
 		 204 aa  161  7e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1675  riboflavin synthase subunit alpha  48.5 
 
 		 222 aa  161  7e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.420891  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0009  riboflavin synthase subunit alpha  46.15 
 
 		 208 aa  161  8.000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2946  riboflavin synthase subunit alpha  49.51 
 
 		 205 aa  160  9e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.175022  normal  0.644585 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3916  riboflavin synthase subunit alpha  45.96 
 
 		 202 aa  160  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  47.18 
 
 		 216 aa  160  1e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01560  riboflavin synthase, alpha subunit  47.06 
 
 		 204 aa  160  2e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.913253 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  46.11 
 
 		 202 aa  160  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0937  riboflavin synthase, alpha subunit  46.94 
 
 		 217 aa  159  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  45.36 
 
 		 223 aa  159  2e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4221  riboflavin synthase subunit alpha  41 
 
 		 214 aa  159  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  47.42 
 
 		 220 aa  158  5e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1866  riboflavin synthase subunit alpha  47.06 
 
 		 205 aa  158  5e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0707  riboflavin synthase subunit alpha  47.03 
 
 		 217 aa  158  6e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0752596  normal  0.720466 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0663  riboflavin synthase subunit alpha  47.03 
 
 		 217 aa  158  6e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.197144 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3707  riboflavin synthase, alpha subunit  45.36 
 
 		 196 aa  157  7e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0239  riboflavin synthase subunit alpha  39.49 
 
 		 202 aa  157  8e-38  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  45.36 
 
 		 215 aa  157  9e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2602  riboflavin synthase, alpha subunit  43.56 
 
 		 205 aa  157  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  43.59 
 
 		 213 aa  157  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3100  riboflavin synthase subunit alpha  46.53 
 
 		 204 aa  156  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.592205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  46.91 
 
 		 215 aa  156  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1016  riboflavin synthase subunit alpha  41 
 
 		 214 aa  156  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  42 
 
 		 226 aa  156  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  47.42 
 
 		 199 aa  155  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  46.39 
 
 		 202 aa  155  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  45.81 
 
 		 216 aa  155  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3417  riboflavin synthase subunit alpha  46.11 
 
 		 196 aa  155  3e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1670  riboflavin synthase subunit alpha  46.5 
 
 		 226 aa  155  4e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.57182e-16 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2925  riboflavin synthase subunit alpha  46.11 
 
 		 215 aa  154  6e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2667  riboflavin synthase subunit alpha  49.02 
 
 		 214 aa  154  6e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  46.91 
 
 		 221 aa  153  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0620  riboflavin synthase subunit alpha  46.31 
 
 		 204 aa  153  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2689  riboflavin synthase subunit alpha  46.53 
 
 		 210 aa  153  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2597  riboflavin synthase subunit alpha  44.85 
 
 		 193 aa  153  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.195355  normal  0.238083 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>