More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_2265 on replicon NC_010579
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010579  XfasM23_2265  conjugal transfer ATPase TrbB  100 
 
 		 320 aa  653    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000000182151  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0047  conjugal transfer ATPase TrbB  69.69 
 
 		 366 aa  465  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.435739  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6502  conjugal transfer ATPase TrbB  66.25 
 
 		 320 aa  440  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000848029  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6635  conjugal transfer ATPase TrbB  66.25 
 
 		 320 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000001277  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4274  conjugal transfer ATPase TrbB  66.67 
 
 		 321 aa  435  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  1.39641e-17  normal  0.780952 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5376  conjugal transfer protein TrbB  49.34 
 
 		 325 aa  277  2e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.873553  normal  0.169831 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4569  conjugal transfer protein TrbB  48.37 
 
 		 329 aa  269  5e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4690  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  45.08 
 
 		 310 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2497  type II secretion system protein E  47.33 
 
 		 321 aa  264  2e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8334  conjugal transfer protein TrbB  47.39 
 
 		 323 aa  263  4e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222514  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9269  conjugal transfer protein TrbB  46.58 
 
 		 323 aa  261  8.999999999999999e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9661  conjugal transfer protein TrbB  49.51 
 
 		 320 aa  261  1e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5330  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  45.08 
 
 		 320 aa  258  1e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.548363 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5482  conjugal transfer protein TrbB  45.36 
 
 		 321 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1334  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  45.82 
 
 		 322 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0908976 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0244  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  46.18 
 
 		 322 aa  251  8.000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3851  type II secretion system protein E  44.79 
 
 		 327 aa  250  2e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.296178  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1634  P-type conjugative transfer protein TrbB  45.51 
 
 		 322 aa  249  6e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0899884  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5159  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  46.18 
 
 		 318 aa  248  7e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1622  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  39.29 
 
 		 346 aa  248  8e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3827  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  45.33 
 
 		 321 aa  248  1e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3364  conjugal transfer protein trbB  45.28 
 
 		 326 aa  244  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.538744 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7440  conjugal transfer protein trbB  45.51 
 
 		 305 aa  243  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7741  conjugal transfer protein trbB  45.03 
 
 		 327 aa  243  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.685768 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3691  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  44.48 
 
 		 328 aa  241  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0966  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  45.02 
 
 		 334 aa  241  1e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2878  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  44.59 
 
 		 327 aa  240  2.9999999999999997e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0715794 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0749  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  44.59 
 
 		 327 aa  239  4e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.641602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3004  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  43.61 
 
 		 342 aa  239  5e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.803505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1013  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  45.33 
 
 		 322 aa  239  5e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3212  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  44.09 
 
 		 332 aa  239  5e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0166332  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0808  type II secretion system protein E  45.42 
 
 		 326 aa  238  8e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0595  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  44.12 
 
 		 328 aa  237  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0699  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  44.79 
 
 		 326 aa  237  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3194  type II secretion system protein E  44.26 
 
 		 334 aa  237  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.653362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3541  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  44.59 
 
 		 327 aa  236  4e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1194  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  44.59 
 
 		 327 aa  236  4e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.442732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3901  type II secretion system protein E  43.81 
 
 		 322 aa  235  6e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0509  type II secretion system protein E  43 
 
 		 329 aa  235  7e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.77324  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4000  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  44.44 
 
 		 328 aa  235  7e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1835  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  45.18 
 
 		 325 aa  234  1.0000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1484  type II secretion system protein E  44.48 
 
 		 332 aa  234  2.0000000000000002e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.307277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0156  type II secretion system protein E  44.26 
 
 		 334 aa  233  5e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3086  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  43.62 
 
 		 343 aa  231  9e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3541  type II secretion system protein E  43.96 
 
 		 322 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0478777  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2324  type II secretion system protein E  44.26 
 
 		 327 aa  230  3e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0161  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  45.19 
 
 		 323 aa  229  4e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.654674 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1500  conjugal transfer protein trbB  43.41 
 
 		 327 aa  229  6e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4195  type II secretion system protein E  42.01 
 
 		 343 aa  228  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2027  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  43.71 
 
 		 333 aa  226  4e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2584  conjugal transfer protein TrbB  43.75 
 
 		 355 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0438  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  43.09 
 
 		 353 aa  224  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0726  type II secretion system protein E  41.9 
 
 		 349 aa  223  3e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.687032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1341  type II secretion system protein E  43.09 
 
 		 354 aa  223  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.120888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1550  type II secretion system protein E  43.09 
 
 		 358 aa  223  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00260971  normal  0.700306 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2004  type II secretion system protein E  42.43 
 
 		 348 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2645  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  42.11 
 
 		 345 aa  222  8e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3506  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  42.76 
 
 		 344 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.19636  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2268  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  41.18 
 
 		 325 aa  221  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2351  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  47.93 
 
 		 325 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0318  type II secretion system protein E  44.52 
 
 		 327 aa  221  1.9999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0504933  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2699  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  42.76 
 
 		 344 aa  219  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.183128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1895  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  42.43 
 
 		 356 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1282  type II secretion system protein E  41.59 
 
 		 356 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3706  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  42.43 
 
 		 350 aa  219  6e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.557258  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2614  type II secretion system protein E  44.77 
 
 		 327 aa  218  7.999999999999999e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35720  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  42.11 
 
 		 350 aa  218  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.469898  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30940  putative conjugal transfer protein  42.43 
 
 		 356 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000128533  unclonable  3.72388e-22 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2350  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  42.11 
 
 		 351 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.526616 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2911  type II secretion system protein E  41.78 
 
 		 344 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2485  type II secretion system protein E  43.81 
 
 		 327 aa  211  2e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.3274 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2824  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  47.53 
 
 		 329 aa  207  1e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1183  type II secretion system protein E  38.49 
 
 		 319 aa  196  3e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1720  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  43 
 
 		 329 aa  196  4.0000000000000005e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00147948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0892  type II secretion system protein E  37.46 
 
 		 319 aa  194  2e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  38 
 
 		 412 aa  183  4.0000000000000006e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0688  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  42.11 
 
 		 309 aa  181  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2346  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  40.4 
 
 		 325 aa  178  1e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  36.01 
 
 		 464 aa  169  4e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  37.54 
 
 		 454 aa  169  5e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  36.52 
 
 		 453 aa  168  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  36.52 
 
 		 455 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  36.52 
 
 		 455 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  36.52 
 
 		 455 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0072  type II secretion system protein E  36.42 
 
 		 408 aa  166  4e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.928138  normal  0.608061 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  36.18 
 
 		 455 aa  166  5e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  36.09 
 
 		 484 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0503  type II secretion system protein E  36.03 
 
 		 411 aa  166  5.9999999999999996e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.731601  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  35.43 
 
 		 482 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  37.42 
 
 		 441 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  35.79 
 
 		 455 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  37.58 
 
 		 483 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  35.76 
 
 		 467 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  36.09 
 
 		 433 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  35.81 
 
 		 444 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  36.75 
 
 		 482 aa  163  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1815  type II secretion system protein E  35.69 
 
 		 449 aa  163  3e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  36.54 
 
 		 460 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0298  type II secretion system protein E  35.76 
 
 		 488 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  36.88 
 
 		 462 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>