124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1053 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1053  lysozyme  100 
 
 
165 aa  336  9e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.152359  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0912  lysozyme  86.25 
 
 
164 aa  281  2.0000000000000002e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1178  lysozyme  83.75 
 
 
164 aa  275  2e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1158  phage-related lysozyme  82.32 
 
 
166 aa  271  2.0000000000000002e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.901858  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1312  phage-related lysozyme  78.66 
 
 
166 aa  257  4e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0419  phage-related lysozyme  76.83 
 
 
166 aa  254  5e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1487  phage-related lysozyme  76.83 
 
 
166 aa  254  5e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0875  Lysozyme  51.05 
 
 
143 aa  136  1e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.225375  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2493  glycoside hydrolase family 24  49.33 
 
 
166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1065  phage lysozyme  53.06 
 
 
149 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000243456 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1402  phage lysozyme  53.06 
 
 
149 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000103436 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0702  phage-related lysozyme  46.15 
 
 
142 aa  127  6e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.513061  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2819  phage lysozyme  52.38 
 
 
149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559643  normal  0.149188 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1735  Lysozyme  50 
 
 
150 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0740685  normal  0.733452 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3388  lysozyme  47.86 
 
 
143 aa  120  9e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.836181  hitchhiker  0.000487886 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2043  Lysozyme  49.32 
 
 
150 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1032  putative bacteriophage lysozyme  47.92 
 
 
205 aa  115  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.326117  normal  0.312631 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2321  glycoside hydrolase family protein  48.97 
 
 
341 aa  115  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0580  Lysozyme  46.9 
 
 
153 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4784  lysozyme  48.59 
 
 
148 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.156327  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4258  lysozyme  47.89 
 
 
148 aa  108  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805915 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1185  glycoside hydrolase family 24  49.62 
 
 
175 aa  106  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0821  glycoside hydrolase family protein  47.86 
 
 
225 aa  105  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000529126  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0965  glycoside hydrolase family protein  47.86 
 
 
225 aa  105  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000238073  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1492  glycoside hydrolase family protein  44.85 
 
 
186 aa  105  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1057  lysozyme  44.76 
 
 
220 aa  103  7e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.738881  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0240  phage lysozyme  43.36 
 
 
220 aa  96.7  1e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0155947  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3178  glycoside hydrolase family 24  42.65 
 
 
169 aa  96.7  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.202337  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2648  Lysozyme  43.94 
 
 
158 aa  94  9e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.010454  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0394  phage lysozyme  40.31 
 
 
167 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.684429  decreased coverage  0.00000000000000176346 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0631  phage lysozyme  43.24 
 
 
145 aa  92.8  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000760504  normal  0.0607386 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0892  phage lysozyme  40.31 
 
 
165 aa  91.7  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01975  hypothetical protein  38.52 
 
 
159 aa  90.1  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2612  glycoside hydrolase family protein  38.56 
 
 
182 aa  90.1  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0934959  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2900  phage lysozyme  39.53 
 
 
165 aa  89  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.58341  hitchhiker  0.0000000713415 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3043  phage lysozyme  38.73 
 
 
170 aa  87.8  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146006 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0693  lysozyme  45.11 
 
 
153 aa  87.8  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5063  lysozyme  45.11 
 
 
153 aa  87.8  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0931  phage lysozyme  38.73 
 
 
170 aa  87.4  7e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1392  glycoside hydrolase family protein  42.86 
 
 
157 aa  87.4  8e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.9576  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2770  glycoside hydrolase family protein  39.29 
 
 
171 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.206287  decreased coverage  0.0000183318 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1733  glycoside hydrolase family 24  40.88 
 
 
391 aa  86.7  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.614452 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0629  phage lysozyme  39.53 
 
 
165 aa  87  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.194528  decreased coverage  0.000000266391 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3187  glycoside hydrolase family 24  38.93 
 
 
156 aa  85.9  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2180  lysozyme  38.69 
 
 
170 aa  85.5  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.233317 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00507  predicted lysozyme  37.98 
 
 
165 aa  85.1  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.69492  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3074  Lysozyme  37.98 
 
 
165 aa  85.1  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1388  lysozyme, phage-related lysozyme  34.75 
 
 
178 aa  85.1  4e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000577391  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0827  phage lysozyme  37.98 
 
 
165 aa  85.1  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.99177  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2861  phage lysozyme  38.57 
 
 
169 aa  85.1  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00513  hypothetical protein  37.98 
 
 
163 aa  84.7  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.770196  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0871  glycoside hydrolase family protein  37.23 
 
 
170 aa  81.3  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.718049  normal  0.102143 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4372  glycoside hydrolase, family 24  41.79 
 
 
169 aa  80.9  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  hitchhiker  0.0000000130314 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3158  glycoside hydrolase family protein  39.6 
 
 
417 aa  80.5  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3494  glycoside hydrolase family protein  40.3 
 
 
170 aa  79.7  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.161761 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5979  glycoside hydrolase family protein  41.61 
 
 
211 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.234335  normal  0.0785126 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0883  putative lysozyme (endolysin) protein  34 
 
 
153 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.650566 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2335  Phage-related lysozyme  39.86 
 
 
270 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1690  glycoside hydrolase family 24  42.65 
 
 
187 aa  77.8  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.332829  normal  0.645255 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3192  putative lysozyme (endolysin) protein  34 
 
 
153 aa  77.4  0.00000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.226496 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5913  glycoside hydrolase family 24  37.42 
 
 
165 aa  77.4  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160678  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3886  glycoside hydrolase family protein  36.36 
 
 
165 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.047713  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1416  glycoside hydrolase family protein  41.91 
 
 
187 aa  77.4  0.00000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  0.189394 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2680  prophage LambdaMc01, lysozyme  34.19 
 
 
152 aa  76.6  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.768997  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1312  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.56 
 
 
307 aa  76.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1797  glycoside hydrolase family protein  37.06 
 
 
165 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2309  glycoside hydrolase family protein  33.56 
 
 
154 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1445  glycoside hydrolase family protein  41.41 
 
 
184 aa  74.3  0.0000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3421  prophage LambdaMc01, lysozyme  35.92 
 
 
148 aa  73.9  0.0000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1875  glycoside hydrolase family 24  40.15 
 
 
179 aa  73.9  0.0000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0471339  normal  0.356094 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1695  hypothetical protein  37.76 
 
 
163 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182005  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1920  hypothetical protein  35.46 
 
 
165 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080974  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1293  glycoside hydrolase family protein  37.01 
 
 
163 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.616877  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0795  glycoside hydrolase family protein  37.14 
 
 
178 aa  71.6  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.509528  normal  0.0116417 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0875  glycoside hydrolase family protein  38.89 
 
 
178 aa  70.5  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1537  hypothetical protein  34.46 
 
 
583 aa  70.5  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1671  glycoside hydrolase family protein  34.81 
 
 
155 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6523  glycoside hydrolase family protein  34.94 
 
 
260 aa  68.2  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.532315  normal  0.204579 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02719  conserved hypothetical protein  35.66 
 
 
186 aa  65.9  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.30064 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3256  glycoside hydrolase family protein  33.57 
 
 
159 aa  63.9  0.0000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0715149  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2404  glycoside hydrolase family 24  37.5 
 
 
154 aa  63.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2239  glycoside hydrolase family protein  37.23 
 
 
165 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00579986  hitchhiker  0.0000000319845 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1046  lysozyme  32.41 
 
 
195 aa  61.2  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1412  glycoside hydrolase family 24  41.18 
 
 
209 aa  61.2  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.249747  normal  0.117742 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4421  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 
243 aa  60.8  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0625  Phage-related lysozyme (muraminidase)-like  33.56 
 
 
209 aa  58.9  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1644  phage lysozyme  36.97 
 
 
177 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000011957  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0567  lysozyme  46.27 
 
 
92 aa  58.5  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00527525  hitchhiker  0.00000000000000685681 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0944  phage lysozyme  36.13 
 
 
177 aa  58.5  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.330694  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1450  phage lysozyme  36.97 
 
 
177 aa  58.5  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01337  predicted lysozyme  36.97 
 
 
177 aa  58.2  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.343135  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01346  hypothetical protein  36.97 
 
 
177 aa  58.2  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.288512  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3143  lysozyme  35.34 
 
 
177 aa  57.4  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.60318  hitchhiker  0.000000000619176 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2785  phage lysozyme  37.07 
 
 
177 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.455094  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2254  phage lysozyme  34.48 
 
 
177 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000386881 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1529  phage lysozyme  34.48 
 
 
177 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1774  phage lysozyme  34.48 
 
 
177 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.175131  normal  0.015497 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2609  lysozyme  36.13 
 
 
178 aa  55.1  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.013223  normal  0.0317443 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1183  phage lysozyme  35.59 
 
 
177 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00117162  hitchhiker  0.0000000000363783 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2248  lysozyme  36.13 
 
 
178 aa  55.1  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.158229 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>