82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3032 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_3032  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  305  1.0000000000000001e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18680  hypothetical protein  62.92 
 
 		 175 aa  113  8.999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.194491  normal  0.331564 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0600  hypothetical protein  47.97 
 
 		 143 aa  100  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0447  thioredoxin-related  56.63 
 
 		 146 aa  94.4  5e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0458  hypothetical protein  40.94 
 
 		 175 aa  93.6  8e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal  0.317587 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37690  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  41.1 
 
 		 145 aa  89.7  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2110  putative thioredoxin  45.76 
 
 		 152 aa  88.2  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0349096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0900  hypothetical protein  40.67 
 
 		 149 aa  87.4  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6171  thioredoxin domain-containing protein  57.83 
 
 		 206 aa  87  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4232  putative thioredoxin  46.15 
 
 		 170 aa  86.7  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.514509  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4352  Thioredoxin domain protein  55.7 
 
 		 112 aa  84.3  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.289078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4643  thioredoxin  47.37 
 
 		 120 aa  68.6  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.81878  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4375  hypothetical protein  48.15 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358603 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1559  putative thioredoxin  52.22 
 
 		 130 aa  64.7  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.832345  hitchhiker  0.00666422 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5099  thioredoxin domain-containing protein  31.08 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4527  thioredoxin domain-containing protein  31.76 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.509304  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4910  thioredoxin domain-containing protein  31.76 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4614  thioredoxin domain-containing protein  31.76 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1830  Thioredoxin domain protein  36.27 
 
 		 597 aa  54.3  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1648  thioredoxin domain-containing protein  37.04 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0259266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1200  Thioredoxin domain protein  37.04 
 
 		 98 aa  53.5  0.0000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5689  thioredoxin  36.71 
 
 		 124 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5399  thioredoxin  36.71 
 
 		 124 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.35358 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1832  thioredoxin  38.36 
 
 		 125 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247495 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10831  thioredoxin thiX  35 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220535 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5310  thioredoxin  36.71 
 
 		 124 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0987  thioredoxin  35.44 
 
 		 124 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  38.36 
 
 		 108 aa  50.4  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4021  thioredoxin  36.99 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0834665  normal  0.313604 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1133  thioredoxin  25.88 
 
 		 98 aa  48.1  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.114517  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3325  Thioredoxin domain protein  38.03 
 
 		 176 aa  48.1  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000131659 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1144  thioredoxin  34.52 
 
 		 421 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1430  Thioredoxin domain protein  33.7 
 
 		 597 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.823534  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl178  thioredoxin  28.4 
 
 		 102 aa  46.2  0.0002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1351  Thioredoxin domain protein  37.8 
 
 		 600 aa  45.1  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.53588  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2770  thioredoxin  31.76 
 
 		 125 aa  45.1  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3070  thioredoxin  35.71 
 
 		 105 aa  44.7  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.990711  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14280  thioredoxin  35.71 
 
 		 102 aa  44.3  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.978477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0031  thioredoxin  31.17 
 
 		 110 aa  44.3  0.0007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0261  thioredoxin, putative  30.77 
 
 		 108 aa  44.3  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689046 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0205  thioredoxin, putative  30.77 
 
 		 108 aa  44.3  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.513083  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0210  thioredoxin  28.05 
 
 		 108 aa  43.9  0.0008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2662  thioredoxin  27.78 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  6.93824e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0420  thioredoxin  33.33 
 
 		 142 aa  43.9  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2263  thioredoxin  38.03 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1129  thioredoxin  36.49 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1362  thioredoxin  38.57 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3354  glutaredoxin  38.81 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0202302  normal  0.01077 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2639  thioredoxin  29.81 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0886828  hitchhiker  0.00590655 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2026  thioredoxin  28.95 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.12861 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6826  hypothetical protein  32.1 
 
 		 140 aa  43.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3667  thioredoxin domain-containing protein  38.33 
 
 		 298 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1074  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.33 
 
 		 607 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0835  thioredoxin  24.42 
 
 		 102 aa  42.4  0.003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1252  thioredoxin domain-containing protein  25.27 
 
 		 106 aa  42  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000389642  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1024  Thioredoxin domain protein  26.19 
 
 		 91 aa  42  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  30.16 
 
 		 107 aa  42.4  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  33.8 
 
 		 133 aa  42  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52686  thioredoxin  28.26 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.540777  normal  0.0222325 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0311  hypothetical protein  28.57 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2323  thioredoxin  36.62 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2957  thioredoxin family protein  30.49 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0609  thioredoxin  32.89 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48539  thioredoxin h  31.65 
 
 		 165 aa  41.2  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3801  Thioredoxin domain protein  28.89 
 
 		 768 aa  41.2  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1855  thioredoxin  27.16 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2665  thioredoxin-related  34.62 
 
 		 303 aa  41.2  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31720  thioredoxin o  28.17 
 
 		 133 aa  41.2  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.998916  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0427  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  26.39 
 
 		 103 aa  40.8  0.007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.66857e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08920  thioredoxin  28.05 
 
 		 102 aa  40.8  0.007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000942681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3472  thioredoxin  38.16 
 
 		 246 aa  40.4  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.110554  normal  0.0143649 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  33.82 
 
 		 406 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1976  thioredoxin  30.97 
 
 		 109 aa  40.8  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0312  Thioredoxin domain protein  25.93 
 
 		 88 aa  40.4  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1878  Thioredoxin domain protein  29 
 
 		 125 aa  40.8  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2626  Thioredoxin domain protein  36.67 
 
 		 597 aa  40.4  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.118901  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1896  thioredoxin  35.29 
 
 		 102 aa  40.4  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00263225  hitchhiker  0.00000000000000449088 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0266  thioredoxin  33.87 
 
 		 301 aa  40.4  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4107  thioredoxin  33.75 
 
 		 141 aa  40.4  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000794835 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  30.95 
 
 		 110 aa  40.4  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6432  thioredoxin  37.33 
 
 		 160 aa  40.4  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.432921 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4637  thioredoxin reductase  36 
 
 		 456 aa  40.4  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000231293  normal  0.140967 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>