More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1172 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1172  signal peptidase I  100 
 
 
267 aa  531  1e-150  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0990  signal peptidase I  63.6 
 
 
284 aa  288  7e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000142727  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23700  signal peptidase I  60.67 
 
 
279 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.412828  normal  0.215042 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1475  signal peptidase I  54.26 
 
 
290 aa  257  2e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.393591  normal  0.0414721 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2535  signal peptidase I  57.51 
 
 
247 aa  238  5.999999999999999e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.699875  normal  0.317865 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2477  signal peptidase I  47.89 
 
 
304 aa  213  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0881706  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1404  signal peptidase I  55.56 
 
 
254 aa  212  5.999999999999999e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.012571 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2217  signal peptidase I  46.64 
 
 
290 aa  211  1e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000553626 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2890  signal peptidase I  56.63 
 
 
251 aa  205  8e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.527092  normal  0.396669 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0984  signal peptidase I  47.28 
 
 
291 aa  199  3e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.376271 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11110  signal peptidase I  44.6 
 
 
268 aa  192  6e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.056722  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0229  signal peptidase I  45.75 
 
 
291 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1518  signal peptidase I  50.75 
 
 
469 aa  177  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.87268  normal  0.0182553 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1832  Signal peptidase I-like protein  50.25 
 
 
289 aa  175  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0647051 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4540  signal peptidase I  47.6 
 
 
243 aa  172  5e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0613872  normal  0.498524 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9015  Signal peptidase I-like protein  47.85 
 
 
269 aa  170  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10040  signal peptidase I  43.2 
 
 
266 aa  167  2e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.17522  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3418  signal peptidase I  46.41 
 
 
360 aa  166  4e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0509  signal peptidase I  41.7 
 
 
216 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.82955  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0667  signal peptidase I  44.34 
 
 
338 aa  157  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.607468  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1023  signal peptidase I  42.33 
 
 
285 aa  156  3e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.114866  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2218  signal peptidase I  45.73 
 
 
225 aa  153  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000177112 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1403  signal peptidase I  46.7 
 
 
219 aa  151  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.880656  normal  0.0120837 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1517  signal peptidase I  43.33 
 
 
298 aa  151  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489263  normal  0.0166712 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1199  signal peptidase I  43.1 
 
 
290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.526786  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2478  signal peptidase I  46.77 
 
 
225 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0470838  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1310  signal peptidase I  42.79 
 
 
289 aa  145  8.000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0985  signal peptidase I  37.08 
 
 
209 aa  142  5e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60179  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09210  signal peptidase I  40.93 
 
 
199 aa  142  5e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0732618  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0349  signal peptidase I  37.69 
 
 
262 aa  142  8e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2186  signal peptidase I  39.55 
 
 
304 aa  139  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100122  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1556  signal peptidase I  42.03 
 
 
311 aa  137  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.329256  normal  0.0665058 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3254  signal peptidase I  39.06 
 
 
267 aa  137  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4002  signal peptidase I  41.9 
 
 
313 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1311  signal peptidase I  38.5 
 
 
213 aa  135  8e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1833  signal peptidase I  40.8 
 
 
220 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0351614 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1200  signal peptidase I  38.03 
 
 
213 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.167613  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1153  signal peptidase I  41.38 
 
 
434 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.573938  normal  0.0315154 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0179  signal peptidase I  42.59 
 
 
342 aa  126  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5920  signal peptidase I  38.07 
 
 
299 aa  126  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0083042  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3589  signal peptidase I  41 
 
 
352 aa  125  6e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10030  signal peptidase I  40.98 
 
 
192 aa  120  3e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.328546  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2091  signal peptidase I  35.81 
 
 
309 aa  115  5e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.367241  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2193  signal peptidase I  35.8 
 
 
286 aa  116  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.107001  normal  0.241649 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09800  signal peptidase I  34.91 
 
 
341 aa  116  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599041  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5921  signal peptidase I  37.26 
 
 
288 aa  112  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0282682  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2187  signal peptidase I  35.55 
 
 
261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0439967  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12917  signal peptidase I lepB (leader peptidase I)  36.55 
 
 
294 aa  110  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.710177 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1951  signal peptidase I  35.5 
 
 
284 aa  109  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.743818 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1971  signal peptidase I  35.5 
 
 
284 aa  109  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0145685  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3131  signal peptidase I  36.77 
 
 
272 aa  109  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000239425  normal  0.113898 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2017  signal peptidase I  35.5 
 
 
284 aa  109  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4169  signal peptidase I  34.42 
 
 
284 aa  106  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09200  signal peptidase I  40.64 
 
 
247 aa  105  8e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.537704  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0250  signal peptidase I  38.65 
 
 
197 aa  104  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.904614  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1226  signal peptidase I  34.1 
 
 
190 aa  100  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2188  signal peptidase I  34.76 
 
 
230 aa  99.8  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0349531  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  33.81 
 
 
190 aa  99  8e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1836  signal peptidase I  35.98 
 
 
215 aa  97.4  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387891  normal  0.998113 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3677  signal peptidase I  36.45 
 
 
208 aa  96.3  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4839  signal peptidase I  35.64 
 
 
209 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  32.24 
 
 
214 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3289  signal peptidase I  32.21 
 
 
173 aa  93.6  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000862301  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2330  signal peptidase I  30.08 
 
 
221 aa  93.6  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000787918  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  33.64 
 
 
199 aa  92.8  5e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0530  signal peptidase I  32.09 
 
 
197 aa  92.8  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3501  signal peptidase I  29.96 
 
 
216 aa  92.8  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00001185  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1659  peptidase S26A, signal peptidase I  37.11 
 
 
221 aa  92.4  7e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0195  signal peptidase I  33.33 
 
 
192 aa  92.4  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.597616  normal  0.0662896 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1310  thylakoidal processing peptidase  33.17 
 
 
198 aa  92.4  7e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0200  signal peptidase I  33.33 
 
 
193 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1383  signal peptidase I  34.47 
 
 
188 aa  91.7  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00010466  normal  0.416306 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05711  Signal peptidase I  32.82 
 
 
230 aa  91.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.818825  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0699  peptidase S26A, signal peptidase I  37.19 
 
 
235 aa  91.7  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0691424  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  33.03 
 
 
200 aa  92  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4420  signal peptidase I  33.68 
 
 
200 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1846  Signal peptidase I  32.82 
 
 
231 aa  91.3  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.10731  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4484  signal peptidase I  33.68 
 
 
200 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.130088 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  35.29 
 
 
171 aa  90.5  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2722  signal peptidase I  31.38 
 
 
189 aa  90.1  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0745119  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0662  signal peptidase I  33.17 
 
 
174 aa  89.7  5e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00185516  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2504  signal peptidase I  31.25 
 
 
219 aa  89.4  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000062636  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1149  Signal peptidase I  33.83 
 
 
181 aa  89.4  6e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.867763  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1382  signal peptidase I  31.42 
 
 
188 aa  88.6  9e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000813945  normal  0.891342 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1532  signal peptidase I  34.54 
 
 
187 aa  88.6  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00110114  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1631  signal peptidase I  31.53 
 
 
288 aa  88.2  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0312  signal peptidase I  29.9 
 
 
169 aa  88.2  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.531917  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  33.33 
 
 
220 aa  87.8  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3026  signal peptidase I  32.13 
 
 
262 aa  87  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.102101  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1335  peptidase S26A, signal peptidase I  34.42 
 
 
217 aa  87  3e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0446505  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05490  signal peptidase I  35.38 
 
 
250 aa  86.3  5e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1621  signal peptidase I  32.57 
 
 
216 aa  86.3  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.617556  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  34.26 
 
 
198 aa  86.3  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0972  signal peptidase I  34.74 
 
 
184 aa  85.9  6e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000604372  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  29.39 
 
 
225 aa  85.5  8e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0514  Signal peptidase I  28.44 
 
 
219 aa  85.5  8e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.299023  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0598  signal peptidase I  34.09 
 
 
214 aa  85.5  8e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06621  leader peptidase I  31.08 
 
 
188 aa  84.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.186965  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0042  leader peptidase I  31.53 
 
 
188 aa  84.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.643112  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1882  signal peptidase I  29.39 
 
 
225 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>