More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3403 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3403  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 236 aa  474  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1587  two component transcriptional regulator  56.47 
 
 		 261 aa  257  1e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.367759  normal  0.752499 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6216  two component transcriptional regulator  55.56 
 
 		 246 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2107  two-component response regulator  53.53 
 
 		 245 aa  251  9.000000000000001e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0079  transcriptional regulatory protein  53.53 
 
 		 245 aa  251  1e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.747625  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1278  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.46 
 
 		 239 aa  248  5e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.638511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1961  two component transcriptional regulator  53.45 
 
 		 240 aa  247  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2179  two component transcriptional regulator  55.98 
 
 		 262 aa  247  1e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134486  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1375  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  51.53 
 
 		 236 aa  245  4e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0474  transcriptional regulatory protein OmpR, putative  52.52 
 
 		 238 aa  243  9.999999999999999e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558106  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1971  two component transcriptional regulator  53.68 
 
 		 232 aa  241  6e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.999465  normal  0.0504331 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1631  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.11 
 
 		 275 aa  240  1e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4089  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.16 
 
 		 240 aa  238  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3286  two component transcriptional regulator  51.68 
 
 		 239 aa  238  8e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0994211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1245  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.26 
 
 		 256 aa  237  1e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0649443  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0413  putative transcriptional regulatory protein OmpR  52.1 
 
 		 238 aa  236  2e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16231  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6320  two component transcriptional regulator  52.32 
 
 		 239 aa  236  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0994  two-component response regulator  52.34 
 
 		 246 aa  234  6e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0852  two component transcriptional regulator  52.99 
 
 		 241 aa  235  6e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5704  two component transcriptional regulator  52.92 
 
 		 246 aa  234  7e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.140603  normal  0.300283 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3646  two component transcriptional regulator  51.46 
 
 		 243 aa  234  7e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1374  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.77 
 
 		 251 aa  234  8e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287257  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3772  response regulator receiver  50.21 
 
 		 241 aa  234  9e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0950932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4066  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.21 
 
 		 241 aa  234  9e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2155  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 		 261 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102637  normal  0.128892 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.34 
 
 		 246 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0474711  normal  0.959624 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4027  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.15 
 
 		 240 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886848  normal  0.528233 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2086  two component transcriptional regulator  52.5 
 
 		 246 aa  232  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4123  two component transcriptional regulator  48.94 
 
 		 242 aa  232  4.0000000000000004e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1082  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.85 
 
 		 239 aa  231  6e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00181983  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3303  two component transcriptional regulator  52.92 
 
 		 245 aa  231  6e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0516  response regulator receiver  52.77 
 
 		 247 aa  231  6e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.62167  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0772  DNA-binding response regulator  49.37 
 
 		 243 aa  231  7.000000000000001e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0815  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.77 
 
 		 246 aa  231  8.000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.404408  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2619  two component transcriptional regulator  50.85 
 
 		 240 aa  230  1e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2473  two component transcriptional regulator  49.14 
 
 		 251 aa  230  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2092  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.18 
 
 		 263 aa  229  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.187111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2589  two component transcriptional regulator  51.28 
 
 		 237 aa  229  2e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.521157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04421  two-component system regulatory protein  49.34 
 
 		 230 aa  229  2e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2703  two component transcriptional regulator  50.21 
 
 		 241 aa  229  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.790666  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2739  two component transcriptional regulator  48.32 
 
 		 241 aa  229  3e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.107521 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1909  two component transcriptional regulator  51.06 
 
 		 246 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.596265  normal  0.171962 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2008  two component transcriptional regulator  50.42 
 
 		 246 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574198  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2403  winged helix family two component transcriptional regulator  51.06 
 
 		 246 aa  228  5e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3292  two component transcriptional regulator  51.06 
 
 		 246 aa  228  5e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2275  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.9 
 
 		 246 aa  228  7e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0529078  normal  0.301367 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3029  two component transcriptional regulator  51.09 
 
 		 238 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3382  two component transcriptional regulator  47.28 
 
 		 241 aa  225  4e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98781 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5018  two component transcriptional regulator  51.46 
 
 		 246 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.259334  normal  0.450101 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4076  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.28 
 
 		 253 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.31516 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3112  two component transcriptional regulator  52.14 
 
 		 246 aa  225  6e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2272  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.92 
 
 		 240 aa  225  6e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.543841  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3909  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  50.64 
 
 		 247 aa  224  8e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4429  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.62 
 
 		 247 aa  224  8e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23129  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4654  two component transcriptional regulator  52.14 
 
 		 249 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.651298 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2423  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 240 aa  223  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5142  two component transcriptional regulator  51.28 
 
 		 246 aa  222  3e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0161802  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2387  DNA-binding response regulator  49.57 
 
 		 236 aa  223  3e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3459  two component transcriptional regulator  51.05 
 
 		 246 aa  223  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4604  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.71 
 
 		 246 aa  223  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4614  two component transcriptional regulator  51.28 
 
 		 246 aa  222  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0398  two component transcriptional regulator  50.63 
 
 		 246 aa  221  6e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3907  two component transcriptional regulator  51.06 
 
 		 245 aa  221  7e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2235  two component transcriptional regulator  49.36 
 
 		 236 aa  221  8e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3025  two component transcriptional regulator  47.83 
 
 		 270 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2418  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 		 237 aa  220  9.999999999999999e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3772  two component transcriptional regulator  49.58 
 
 		 240 aa  218  5e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.83932 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4048  two component transcriptional regulator  49.58 
 
 		 240 aa  218  5e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.507063  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1190  two component transcriptional regulator  50.21 
 
 		 248 aa  216  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.882993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1813  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.22 
 
 		 236 aa  217  2e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.106078  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3326  two component transcriptional regulator  49.36 
 
 		 243 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.236846  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0758  two component transcriptional regulator  49.35 
 
 		 244 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.885545  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2223  DNA-binding response regulator  49.33 
 
 		 230 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375792  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  49.33 
 
 		 259 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.42 
 
 		 244 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.710276 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1511  two component transcriptional regulator  46.41 
 
 		 250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030435  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4197  two component transcriptional regulator  48.88 
 
 		 242 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.865203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3477  two component transcriptional regulator  49.14 
 
 		 261 aa  212  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2546  osmolarity response regulator  48.5 
 
 		 245 aa  210  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6165  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.13 
 
 		 245 aa  209  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.362427  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5579  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.18 
 
 		 248 aa  209  4e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00126537  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0373  two component transcriptional regulator  49.15 
 
 		 238 aa  208  5e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873901 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7106  two component transcriptional regulator  46.32 
 
 		 237 aa  208  8e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.323714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2374  two component transcriptional regulator  48.93 
 
 		 245 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.348064  normal  0.588953 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0441  two component transcriptional regulator  45.22 
 
 		 245 aa  207  1e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.270311  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5286  two component transcriptional regulator  45.83 
 
 		 240 aa  206  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.498861 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1980  osmolarity response regulator  48.92 
 
 		 243 aa  206  4e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.431202  normal  0.459947 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2713  osmolarity response regulator  48.07 
 
 		 245 aa  205  5e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.394419  normal  0.0259821 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2121  osmolarity response regulator  47.44 
 
 		 248 aa  205  5e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.201602  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1895  osmolarity response regulator  47.41 
 
 		 244 aa  204  9e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0546897 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1299  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.66 
 
 		 242 aa  204  9e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0317425  normal  0.569469 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4357  two component transcriptional regulator  48.89 
 
 		 252 aa  204  9e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4633  osmolarity response regulator  46.09 
 
 		 241 aa  203  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3637  osmolarity response regulator  44.78 
 
 		 241 aa  202  3e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2852  osmolarity response regulator  47.84 
 
 		 243 aa  202  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2732  osmolarity response regulator  48.07 
 
 		 243 aa  202  3e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.744063  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2582  osmolarity response regulator  46.55 
 
 		 243 aa  202  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121294  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4017  osmolarity response regulator  44.78 
 
 		 241 aa  202  4e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2345  two component transcriptional regulator  46.41 
 
 		 252 aa  202  4e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000474063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4017  osmolarity response regulator  45.65 
 
 		 241 aa  202  4e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>