68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0854 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0854  hypothetical protein  100 
 
 		 589 aa  1150    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.254625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2065  hypothetical protein  29.9 
 
 		 543 aa  196  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1559  hypothetical protein  29.65 
 
 		 544 aa  189  9e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.545989  normal  0.355299 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18780  hypothetical protein  30.24 
 
 		 544 aa  189  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.374717  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24380  hypothetical protein  29.83 
 
 		 543 aa  188  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00155106  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2027  hypothetical protein  29.72 
 
 		 543 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.379068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3715  hypothetical protein  29.55 
 
 		 543 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3213  hypothetical protein  27.55 
 
 		 546 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338113 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3764  hypothetical protein  28 
 
 		 551 aa  182  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.137041  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2934  hypothetical protein  27.42 
 
 		 546 aa  176  8e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.707413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1716  hypothetical protein  30.55 
 
 		 552 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0987625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1587  hypothetical protein  27.63 
 
 		 541 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00091604 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3087  hypothetical protein  29.85 
 
 		 595 aa  169  1e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.232406  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1731  hypothetical protein  24.73 
 
 		 611 aa  147  6e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.187494  normal  0.124659 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1454  hypothetical protein  26 
 
 		 553 aa  139  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000118146 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1657  BatD protein  25.54 
 
 		 584 aa  138  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0760039  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1401  hypothetical protein  24.54 
 
 		 552 aa  138  4e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.559389  hitchhiker  0.00000222203 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2765  hypothetical protein  24.66 
 
 		 549 aa  137  6.0000000000000005e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2911  hypothetical protein  24.49 
 
 		 549 aa  136  9e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2432  hypothetical protein  25.8 
 
 		 546 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0142229 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3095  hypothetical protein  26.37 
 
 		 555 aa  134  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2683  hypothetical protein  25.26 
 
 		 544 aa  134  5e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.382096  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2787  hypothetical protein  26.82 
 
 		 564 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.352279  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0071  hypothetical protein  24.38 
 
 		 566 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2466  hypothetical protein  26.33 
 
 		 547 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.837829  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1591  hypothetical protein  25.45 
 
 		 564 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0414272  unclonable  0.00000000000672446 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1466  hypothetical protein  26.74 
 
 		 553 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.661911  hitchhiker  0.00237644 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2862  hypothetical protein  26.61 
 
 		 564 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.307874 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2767  hypothetical protein  26.7 
 
 		 569 aa  127  5e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.170207  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3033  hypothetical protein  24.79 
 
 		 548 aa  124  5e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0228432  normal  0.0454069 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3164  batD protein  23.03 
 
 		 581 aa  124  6e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00886751  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1950  hypothetical protein  27.5 
 
 		 580 aa  124  7e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.673108  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2605  hypothetical protein  27.9 
 
 		 544 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.634238  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02707  batD protein  22.81 
 
 		 586 aa  120  4.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1523  hypothetical protein  26.34 
 
 		 586 aa  118  3e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02343  hypothetical protein  27.42 
 
 		 585 aa  117  5e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1742  forkhead-associated  21.83 
 
 		 570 aa  111  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.607903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0522  hypothetical protein  22.74 
 
 		 568 aa  105  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2174  hypothetical protein  25.53 
 
 		 540 aa  103  6e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0809716 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1622  hypothetical protein  26.32 
 
 		 544 aa  103  7e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.652102  hitchhiker  0.00000525013 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001267  BatD  21.13 
 
 		 548 aa  100  8e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2817  hypothetical protein  20.38 
 
 		 555 aa  99  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.683396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3230  hypothetical protein  26.74 
 
 		 571 aa  97.8  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05142  hypothetical protein  22.45 
 
 		 548 aa  95.5  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1108  hypothetical protein  21.22 
 
 		 550 aa  88.2  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1207  hypothetical protein  31.82 
 
 		 424 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2140  hypothetical protein  26.96 
 
 		 458 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.582958  normal  0.0551076 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5136  hypothetical protein  27.45 
 
 		 430 aa  55.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.136835  normal  0.601622 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2466  hypothetical protein  29.85 
 
 		 431 aa  56.2  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.662294 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0462  hypothetical protein  24.17 
 
 		 398 aa  55.5  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3118  hypothetical protein  26.7 
 
 		 414 aa  52  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0457389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000304  BatD  23.6 
 
 		 438 aa  52  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1010  hypothetical protein  29.84 
 
 		 432 aa  52.4  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.456603  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1389  hypothetical protein  28.29 
 
 		 399 aa  51.6  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.202962  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3053  hypothetical protein  23.58 
 
 		 436 aa  50.8  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0216691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3803  hypothetical protein  28.93 
 
 		 447 aa  51.2  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.853464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0569  hypothetical protein  25.47 
 
 		 476 aa  50.1  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4014  hypothetical protein  24.12 
 
 		 386 aa  49.7  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.244675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3384  hypothetical protein  25.23 
 
 		 475 aa  48.5  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.75671 
 
 
-
 
NC_002950  PG1585  batD protein  24.9 
 
 		 600 aa  48.1  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4302  hypothetical protein  28.87 
 
 		 430 aa  48.1  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.916619  normal  0.0727326 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3282  hypothetical protein  23.14 
 
 		 389 aa  47.8  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.366164  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0794  hypothetical protein  25.17 
 
 		 426 aa  47  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0490203 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1536  aerotolerance-related protein BatD  20.62 
 
 		 584 aa  45.1  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0248061  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0439  hypothetical protein  25.84 
 
 		 572 aa  45.4  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00635902  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3554  hypothetical protein  25.91 
 
 		 472 aa  44.7  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0828  hypothetical protein  25.87 
 
 		 438 aa  43.9  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.236177  normal  0.39315 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2886  hypothetical protein  31.33 
 
 		 451 aa  43.5  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.669839  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>