More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0650 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5700  dihydroorotase  81.56 
 
 		 424 aa  709    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187758  hitchhiker  0.00402648 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0650  dihydroorotase  100 
 
 		 425 aa  862    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.775356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5828  dihydroorotase  81.99 
 
 		 427 aa  716    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000105478 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4546  dihydroorotase  63.64 
 
 		 420 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.225827 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1052  dihydroorotase  62.77 
 
 		 420 aa  533  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0770373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4254  dihydroorotase  34.13 
 
 		 395 aa  212  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0916  dihydroorotase  34.29 
 
 		 395 aa  209  9e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2448  aminohydrolase domain-containing protein  29.23 
 
 		 426 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0558  amidohydrolase 3  29.95 
 
 		 425 aa  160  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.577589 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4696  dihydroorotase  31.3 
 
 		 377 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.531695 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0675  amidohydrolase  28.92 
 
 		 370 aa  158  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3349  dihydroorotase  30.95 
 
 		 412 aa  157  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000206965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3969  amidohydrolase  32.84 
 
 		 427 aa  157  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.209336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4371  dihydroorotase  30.2 
 
 		 379 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4846  dihydroorotase  31.05 
 
 		 377 aa  156  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4727  dihydroorotase  31.05 
 
 		 377 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4825  dihydroorotase  30.81 
 
 		 377 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4791  dihydroorotase  31.05 
 
 		 377 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0429  dihydroorotase  30.07 
 
 		 377 aa  154  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.634096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0177  amidohydrolase  31.85 
 
 		 383 aa  153  5.9999999999999996e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3928  dihydroorotase  29.61 
 
 		 379 aa  152  8e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0785792  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3350  dihydroorotase  29.43 
 
 		 431 aa  152  8.999999999999999e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000731035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2987  dihydroorotase  26.61 
 
 		 402 aa  152  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6703  dihydroorotase  25.45 
 
 		 402 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.235788 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3134  amidohydrolase  30.53 
 
 		 399 aa  146  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5090  dihydroorotase  27.51 
 
 		 403 aa  145  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3154  dihydroorotase  31.78 
 
 		 377 aa  145  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5803  dihydroorotase  25.97 
 
 		 404 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.306417  normal  0.050491 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2453  dihydroorotase  29.3 
 
 		 423 aa  144  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0512688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0919  dihydroorotase  29.93 
 
 		 377 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0106  dihydroorotase  28.75 
 
 		 378 aa  141  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4376  dihydroorotase  30.61 
 
 		 379 aa  140  3.9999999999999997e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.430681  normal  0.791891 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3965  amidohydrolase  27.79 
 
 		 414 aa  137  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.690591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4812  putative metallo-dependent hydrolase  25.74 
 
 		 387 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4833  putative metallo-dependent hydrolase  25.74 
 
 		 387 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.489997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4693  putative metallo-dependent hydrolase  25.74 
 
 		 387 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4778  putative metallo-dependent hydrolase  25.74 
 
 		 387 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.336327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4682  putative metallo-dependent hydrolase  25.74 
 
 		 387 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0195401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6462  dihydroorotase  28.47 
 
 		 412 aa  133  6.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.815548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2441  dihydroorotase  28.74 
 
 		 417 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.214517  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5003  dihydroorotase  26.13 
 
 		 366 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4975  dihydroorotase  25.73 
 
 		 366 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4960  dihydroorotase  25.99 
 
 		 366 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4740  dihydroorotase  25.99 
 
 		 366 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.185439  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5100  dihydroorotase  25.99 
 
 		 366 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0260  dihydroorotase  26.26 
 
 		 366 aa  117  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0312532  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4580  dihydroorotase  25.99 
 
 		 366 aa  117  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4988  dihydroorotase  25.73 
 
 		 366 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4599  dihydroorotase  25.46 
 
 		 366 aa  114  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.231727  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4689  dihydroorotase  25.73 
 
 		 366 aa  111  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  27.46 
 
 		 425 aa  72.4  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  24.83 
 
 		 425 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  24.94 
 
 		 425 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  26.6 
 
 		 427 aa  60.8  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0261  dihydropyrimidinase  38.3 
 
 		 474 aa  60.8  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.62 
 
 		 429 aa  60.1  0.00000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.03 
 
 		 432 aa  59.3  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1042  hypothetical protein  50 
 
 		 451 aa  59.3  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.289988  normal  0.0665058 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1320  dihydroorotase  39.34 
 
 		 423 aa  58.2  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6703  D-glutamate deacylase  38.89 
 
 		 497 aa  57  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.103433 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0356  amidohydrolase 3  39.56 
 
 		 577 aa  56.2  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2899  amidohydrolase  41.67 
 
 		 482 aa  55.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996179  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6769  allantoinase  21.98 
 
 		 448 aa  55.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.75 
 
 		 433 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3603  amidohydrolase 3  41.03 
 
 		 432 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.893721  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07850  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.31 
 
 		 430 aa  55.5  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0172955  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5093  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.04 
 
 		 494 aa  55.1  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00480971  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1188  amidohydrolase 3  51.56 
 
 		 566 aa  54.7  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  40.62 
 
 		 428 aa  54.3  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1504  amidohydrolase  22.76 
 
 		 1005 aa  54.3  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000736153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  42.19 
 
 		 436 aa  54.3  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  24.88 
 
 		 422 aa  54.3  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0955  amidohydrolase  24.46 
 
 		 470 aa  53.9  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1326  amidohydrolase  24.09 
 
 		 475 aa  53.9  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.551422 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2329  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.06 
 
 		 433 aa  53.5  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  23.8 
 
 		 424 aa  53.5  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2241  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.06 
 
 		 433 aa  53.5  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7944  amidohydrolase  42.19 
 
 		 479 aa  53.5  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4149  dihydroorotase  43.08 
 
 		 429 aa  53.1  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.171454 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2624  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  45 
 
 		 561 aa  53.1  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.117622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0613  dihydroorotase, multifunctional complex type  23.71 
 
 		 428 aa  53.1  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.958192  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5803  dihydroorotase  50 
 
 		 439 aa  53.1  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.356381  normal  0.871974 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0358  dihydropyrimidinase  43.48 
 
 		 483 aa  53.1  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  23.58 
 
 		 425 aa  52.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1997  dihydropyrimidinase  40.4 
 
 		 454 aa  52.8  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1619  dihydroorotase  39.06 
 
 		 433 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3245  dihydroorotase  44 
 
 		 534 aa  53.1  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325053  normal  0.0340031 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0206  hypothetical protein  41.49 
 
 		 466 aa  52.4  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.166385  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1479  dihydroorotase  41.54 
 
 		 436 aa  52.4  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0284276  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2239  putative amidohydrolase  22.39 
 
 		 385 aa  52.8  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0161054  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1641  amidohydrolase 3  37.08 
 
 		 590 aa  52.8  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0757893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11860  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.26 
 
 		 430 aa  52.4  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0270101  normal  0.0379723 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0202  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  48.44 
 
 		 569 aa  52  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.58786  normal  0.082487 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  22.61 
 
 		 425 aa  51.6  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0075  hypothetical protein  38.95 
 
 		 700 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.319032  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  24.76 
 
 		 434 aa  52.4  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1177  allantoinase  41.54 
 
 		 449 aa  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1951  amidohydrolase, putative  23.27 
 
 		 385 aa  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.140573  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0338  amidohydrolase  33.33 
 
 		 386 aa  52  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0599299  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  40.32 
 
 		 426 aa  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>