More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0983 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0983  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  100 
 
 		 517 aa  1051    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3431  GntR family transcriptional regulator  66.88 
 
 		 492 aa  658    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.875541  normal  0.885014 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0599  putative transcription regulator protein  59.62 
 
 		 504 aa  588  1e-167  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0558391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2661  GntR family transcriptional regulator  59.87 
 
 		 483 aa  588  1e-167  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0327795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0528  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  59.87 
 
 		 487 aa  570  1e-161  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0515  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  59.66 
 
 		 487 aa  571  1e-161  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.663704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0868  GntR family transcriptional regulator  59.11 
 
 		 606 aa  553  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2460  GntR family transcriptional regulator  58.07 
 
 		 478 aa  543  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3121  transcriptional regulator  55.22 
 
 		 495 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1880  GntR family transcriptional regulator  51.99 
 
 		 494 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.208633 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4436  transcriptional regulator  51.75 
 
 		 514 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0313734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4039  transcriptional regulator  51.22 
 
 		 494 aa  504  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.185178 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3558  GntR family transcriptional regulator  51.22 
 
 		 497 aa  503  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3430  GntR family transcriptional regulator  52.72 
 
 		 521 aa  498  1e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.527841  normal  0.3063 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1930  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  54.45 
 
 		 498 aa  496  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.199389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5367  transcriptional regulator  47.92 
 
 		 494 aa  418  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336445 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1184  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.56 
 
 		 479 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.823264 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1725  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 483 aa  342  1e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.809338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4183  transcriptional regulator  40.37 
 
 		 492 aa  342  1e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1487  GntR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 477 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.539495  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1582  transcriptional regulator  37.53 
 
 		 483 aa  333  6e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2639  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.78 
 
 		 477 aa  331  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1940  transcriptional regulator  38.48 
 
 		 469 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494484 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3059  GntR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 473 aa  330  4e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0865812  hitchhiker  0.000973023 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0018  GntR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 478 aa  329  7e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.422778  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0195  transcriptional regulator  39.21 
 
 		 476 aa  326  6e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.344664  hitchhiker  0.000191089 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1173  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  38.38 
 
 		 486 aa  326  6e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.914694  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2096  GntR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 471 aa  324  2e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.698776  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0959  hypothetical protein  37.63 
 
 		 500 aa  323  3e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5185  GntR family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 496 aa  323  5e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0411857 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2230  GntR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 469 aa  323  5e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.630416 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5275  GntR family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 496 aa  323  7e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.187277  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3544  GntR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 469 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.384624  normal  0.66471 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2379  transcriptional regulator  38.05 
 
 		 469 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.228366  normal  0.534962 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10530  GntR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 471 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2529  GntR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 487 aa  321  3e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0850  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.69 
 
 		 492 aa  318  1e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0803  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.82 
 
 		 480 aa  318  1e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.284256  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2921  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37 
 
 		 475 aa  316  5e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.542365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5327  transcriptional regulator  37.94 
 
 		 496 aa  316  6e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.898471  normal  0.06298 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0726  transcriptional regulator  41.13 
 
 		 482 aa  313  3.9999999999999997e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3939  GntR family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 482 aa  312  9e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3095  GntR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 491 aa  312  1e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2226  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.88 
 
 		 470 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.84 
 
 		 479 aa  310  4e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.892437  normal  0.704953 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3656  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.74 
 
 		 470 aa  309  6.999999999999999e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2446  GntR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 489 aa  309  6.999999999999999e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0494  GntR family transcriptional regulator  37.34 
 
 		 471 aa  308  2.0000000000000002e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0230  transcriptional regulator GntR  36.8 
 
 		 473 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3105  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.38 
 
 		 486 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3723  transcriptional regulator  36.53 
 
 		 470 aa  307  3e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01894  hypothetical protein  35.96 
 
 		 463 aa  307  3e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5854  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, classes I and II  36.4 
 
 		 470 aa  307  3e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.491083 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4886  GntR family transcriptional regulator  36.53 
 
 		 470 aa  307  3e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.344602  normal  0.838171 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003147  GntR-family regulatory protein  35.36 
 
 		 468 aa  306  4.0000000000000004e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00323958  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3253  putative transcriptional regulator  38.56 
 
 		 474 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0471959  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0096  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I  36.59 
 
 		 473 aa  306  6e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4568  GntR family transcriptional regulator  36.53 
 
 		 470 aa  306  6e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4479  GntR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 477 aa  306  7e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0367  GntR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 473 aa  305  1.0000000000000001e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0240  GntR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 473 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4761  aminotransferase, classes I and II superfamily  37.02 
 
 		 471 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4651  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.34 
 
 		 484 aa  304  3.0000000000000004e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1440  transcriptional regulator  38.03 
 
 		 482 aa  303  7.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2858  transcriptional regulator  37.08 
 
 		 472 aa  302  8.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.640766 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1932  GntR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 476 aa  302  1e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00018992  normal  0.474146 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2093  GntR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 473 aa  302  1e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.132381  normal  0.73636 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5531  GntR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 473 aa  300  4e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0752  GntR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 476 aa  300  6e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.743264  normal  0.0151878 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4467  transcriptional regulator  35.79 
 
 		 473 aa  300  6e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.652401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4005  GntR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 473 aa  299  8e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38250  putative transcriptional regulator  38.14 
 
 		 474 aa  299  8e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293552 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1450  GntR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 504 aa  299  9e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00080879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0145  GntR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 472 aa  297  3e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.434271  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1425  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.38 
 
 		 472 aa  297  3e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2450  GntR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 469 aa  297  3e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00121397  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3795  regulatory protein GntR HTH  34.03 
 
 		 471 aa  297  4e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1266  GntR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 473 aa  296  6e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0592211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0076  transcriptional regulator  39.04 
 
 		 488 aa  295  1e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2122  GntR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 473 aa  295  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1618  GntR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 468 aa  294  2e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.29 
 
 		 473 aa  294  2e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0126986  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2454  transcriptional regulator  38.84 
 
 		 481 aa  294  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.201497  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01396  fused predicted DNA-binding transcriptional regulator/predicted amino transferase  35.82 
 
 		 468 aa  294  3e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2207  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.82 
 
 		 468 aa  294  3e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2220  transcriptional regulator  35.82 
 
 		 468 aa  294  3e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.94237 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01407  hypothetical protein  35.82 
 
 		 468 aa  294  3e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3927  GntR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 477 aa  294  3e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.510298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4810  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.05 
 
 		 474 aa  293  4e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0244404  hitchhiker  0.0000000000137556 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2044  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, classes I and II  35.17 
 
 		 468 aa  293  7e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00402201  hitchhiker  0.0000000000000583102 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4066  transcriptional regulator  36.38 
 
 		 478 aa  291  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.974396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3052  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  35.1 
 
 		 477 aa  292  1e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.383361  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2257  putative transcriptional regulator  33.27 
 
 		 479 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26590  GntR family transcriptional regulator  33.27 
 
 		 479 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.079349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2129  GntR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 469 aa  290  3e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.98832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1063  GntR family transcriptional regulator  37 
 
 		 470 aa  290  3e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1337  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.5 
 
 		 487 aa  290  3e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3836  GntR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 474 aa  290  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3087  transcriptional regulator GntR  36.31 
 
 		 472 aa  290  4e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4094  GntR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 479 aa  290  4e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.541503  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>