More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1752 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1752  TonB system transport protein ExbB1  100 
 
 
226 aa  452  1.0000000000000001e-126  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00726097  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05243  biopolymer transport protein  58.65 
 
 
232 aa  252  4.0000000000000004e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001354  ferric siderophore transport system biopolymer transport protein ExbB  57.69 
 
 
232 aa  247  1e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0024242  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0326  TonB system transport protein ExbB1  60.82 
 
 
228 aa  218  7.999999999999999e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000984448  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3671  TonB system transport protein ExbB1  42.92 
 
 
260 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4006  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.87 
 
 
244 aa  143  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0964  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.35 
 
 
244 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3237  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.45 
 
 
243 aa  138  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.123497  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3329  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.35 
 
 
258 aa  137  8.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.770263  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0788  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.57 
 
 
264 aa  138  8.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00466749  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0950  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.72 
 
 
251 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.213402  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3340  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.39 
 
 
251 aa  135  4e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000191011  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1052  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.26 
 
 
249 aa  135  5e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.171459  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1019  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.04 
 
 
251 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0155072  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1464  hypothetical protein  34.34 
 
 
229 aa  77.8  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2890  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.74 
 
 
257 aa  73.6  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000981257 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11810  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.65 
 
 
216 aa  71.6  0.000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1731  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.18 
 
 
207 aa  71.6  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  33.93 
 
 
204 aa  70.9  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.55 
 
 
208 aa  70.5  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.162411  normal  0.347505 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0561  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.15 
 
 
199 aa  70.9  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.305166 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0580  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.37 
 
 
235 aa  69.7  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00547042  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.27 
 
 
206 aa  68.9  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000013307  unclonable  0.0000000588107 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0349  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.95 
 
 
226 aa  68.2  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.931428  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1438  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.25 
 
 
232 aa  67.4  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2130  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.07 
 
 
228 aa  65.9  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0769434  normal  0.602608 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.72 
 
 
208 aa  65.5  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0904  Biopolymer transport protein TolR  34.82 
 
 
453 aa  65.5  0.0000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0591  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.76 
 
 
214 aa  65.5  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0990686 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2279  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.28 
 
 
233 aa  65.5  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0525667  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0010  biopolymer transport ExbB protein  36.29 
 
 
254 aa  65.1  0.0000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2528  biopolymer transport EXBB-like transmembrane protein  29.19 
 
 
206 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0033963  normal  0.0481325 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0569  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.58 
 
 
230 aa  64.7  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.728472  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0010  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.59 
 
 
254 aa  64.3  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.686858  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2393  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.76 
 
 
197 aa  64.3  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2553  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.59 
 
 
192 aa  63.9  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158299 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2399  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.87 
 
 
206 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0433367  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000847  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  39.78 
 
 
455 aa  63.9  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3572  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.94 
 
 
210 aa  63.9  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0594941  decreased coverage  0.0034613 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.73 
 
 
209 aa  63.2  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2805  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.16 
 
 
206 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00166663  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2391  biopolymer transport protein  29.57 
 
 
234 aa  62.8  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3807  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.62 
 
 
324 aa  62.8  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3906  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.93 
 
 
196 aa  63.2  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.286845  normal  0.293846 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2673  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.33 
 
 
253 aa  62.4  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06759  hypothetical protein  38.71 
 
 
455 aa  62.8  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4891  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.94 
 
 
216 aa  62  0.000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0286  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.86 
 
 
212 aa  61.2  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2566  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.54 
 
 
208 aa  60.8  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.11709  decreased coverage  0.00204386 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3210  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.12 
 
 
201 aa  61.6  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000028591  normal  0.177382 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1153  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  33.93 
 
 
457 aa  61.2  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1521  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.44 
 
 
238 aa  61.2  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.565129  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0112  biopolymer transport protein TolR  36.26 
 
 
451 aa  60.5  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0595  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.08 
 
 
231 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000000225479  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0746  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30 
 
 
339 aa  60.5  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1152  TonB system transport protein ExbB2  37.36 
 
 
180 aa  60.5  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0809  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.43 
 
 
227 aa  60.1  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2482  TonB system transport protein ExbB  27.94 
 
 
242 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378751  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02500  transport protein ExbB  36.78 
 
 
239 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0102562  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2815  biopolymer transport proteins-like  32.67 
 
 
464 aa  59.7  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00525326  hitchhiker  0.00000294383 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03475  biopolymer transport ExbB protein  36.11 
 
 
253 aa  59.7  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0280  transport protein ExbB  36.78 
 
 
239 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0009  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.54 
 
 
253 aa  59.7  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00486785 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3174  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.87 
 
 
243 aa  59.3  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6479  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.13 
 
 
237 aa  58.9  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.691155  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2643  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.42 
 
 
210 aa  58.9  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.232186  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21700  ExbB proton channel  35.63 
 
 
236 aa  58.9  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.798679  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1925  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.74 
 
 
207 aa  58.5  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21820  ExbB proton channel  35.63 
 
 
236 aa  58.9  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.129559  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08070  ExbB proton channel  35.63 
 
 
236 aa  58.9  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1510  exbB-like biopolymer transport  47.14 
 
 
201 aa  58.5  0.00000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.232406  normal  0.284557 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4455  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.4 
 
 
226 aa  58.5  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0113  TonB system transport protein ExbB2  27.59 
 
 
169 aa  58.2  0.00000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2288  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.21 
 
 
255 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.018697  decreased coverage  0.0000321635 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0219  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.47 
 
 
241 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.748984  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0848  TolR-like transport protein  33.33 
 
 
470 aa  58.2  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.638917  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0869  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.86 
 
 
462 aa  57.8  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2483  putative biopolymer transport exbB-like transmembrane protein  30.54 
 
 
213 aa  58.2  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0658113  normal  0.425168 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02770  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  24.73 
 
 
246 aa  57  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06758  hypothetical protein  32.38 
 
 
184 aa  57.4  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1029  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.23 
 
 
203 aa  57.4  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000146441  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1369  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.95 
 
 
206 aa  57.4  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4332  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.63 
 
 
238 aa  56.6  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.236556  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3217  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.29 
 
 
202 aa  57  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.581955  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.03 
 
 
209 aa  56.6  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.475045  hitchhiker  0.0000283851 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1226  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.4 
 
 
217 aa  57  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1848  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.13 
 
 
239 aa  56.6  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.775268  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.84 
 
 
210 aa  57  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1436  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.94 
 
 
218 aa  56.6  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.726638 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5123  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.17 
 
 
234 aa  56.2  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0287  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.03 
 
 
216 aa  56.2  0.0000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0754216  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0147  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.63 
 
 
238 aa  56.2  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0454  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.48 
 
 
227 aa  55.8  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0157661  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6006  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.75 
 
 
244 aa  55.8  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.819621 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0136  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36 
 
 
235 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.638399  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4481  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.3 
 
 
230 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0607  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.2 
 
 
478 aa  55.8  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00882438  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1616  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.34 
 
 
469 aa  55.8  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0673  TonB system transport protein ExbB  30.43 
 
 
230 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.649257  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1401  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.41 
 
 
188 aa  55.5  0.0000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.471919  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>