More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06349 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06349  hypothetical protein  100 
 
 		 314 aa  647    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000918  2-dehydro-3-deoxygluconate kinase  47.4 
 
 		 309 aa  285  8e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4750  ribokinase-like domain-containing protein  49.19 
 
 		 310 aa  280  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0082  PfkB domain protein  47.74 
 
 		 310 aa  278  8e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3887  PfkB domain protein  47.56 
 
 		 310 aa  274  1.0000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4075  PfkB domain protein  47.56 
 
 		 310 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4070  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  47.92 
 
 		 314 aa  273  2.0000000000000002e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.254909 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0101  ribokinase-like domain-containing protein  47.92 
 
 		 314 aa  273  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4062  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  47.92 
 
 		 314 aa  273  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0086  PfkB domain protein  46.77 
 
 		 310 aa  273  3e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3923  2-keto-3-deoxygluconate kinase  49.03 
 
 		 309 aa  273  3e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03374  ketodeoxygluconokinase  47.56 
 
 		 309 aa  268  1e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03327  hypothetical protein  47.56 
 
 		 309 aa  268  1e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4890  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  47.23 
 
 		 309 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.327816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4014  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  47.23 
 
 		 309 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0187  PfkB domain protein  47.23 
 
 		 309 aa  266  4e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0191  ribokinase-like domain-containing protein  47.23 
 
 		 309 aa  266  4e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3831  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  47.23 
 
 		 309 aa  266  4e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.15496 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3729  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  47.23 
 
 		 309 aa  266  4e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2510  carbohydrate kinase, PfkB  47.12 
 
 		 307 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3932  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  46.91 
 
 		 309 aa  264  2e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2782  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  46.3 
 
 		 307 aa  258  1e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.191154  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3085  2-keto-3-deoxygluconate kinase  45.1 
 
 		 311 aa  251  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2876  ribokinase-like domain-containing protein  46.01 
 
 		 312 aa  251  1e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.421827  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0130  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  42.21 
 
 		 322 aa  236  4e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.760619 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3280  2-keto-3-deoxygluconate kinase  42.45 
 
 		 312 aa  232  6e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3989  normal  0.0530742 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4546  PfkB domain protein  42.63 
 
 		 311 aa  228  8e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00872695  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3070  ribokinase-like domain-containing protein  41.85 
 
 		 312 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2125  2-keto-3-deoxygluconate kinase  41.61 
 
 		 298 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1308  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  38.85 
 
 		 331 aa  205  8e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000271255  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1269  2-keto-3-deoxygluconate kinase  41.12 
 
 		 296 aa  202  4e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0299866 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1367  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  38.96 
 
 		 309 aa  201  9e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000226917  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0399  ribokinase-like domain-containing protein  37.82 
 
 		 326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0392221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0939  2-keto-3-deoxygluconate kinase  36.62 
 
 		 318 aa  195  7e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170609  hitchhiker  0.00670311 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1665  ribokinase-like domain-containing protein  41.37 
 
 		 311 aa  191  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.304244  normal  0.0158043 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1890  2-keto-3-deoxygluconate kinase  38.19 
 
 		 309 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0103461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3006  ribokinase-like domain-containing protein  38.24 
 
 		 325 aa  189  7e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0260  2-keto-3-deoxygluconate kinase  36.86 
 
 		 325 aa  182  5.0000000000000004e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2656  2-keto-3-deoxygluconate kinase  36.74 
 
 		 312 aa  178  9e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000013903  normal  0.883759 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04804  sugar kinase  38.4 
 
 		 258 aa  177  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3657  PfkB  35.06 
 
 		 307 aa  175  7e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3673  2-keto-3-deoxygluconate kinase  36.96 
 
 		 290 aa  173  3.9999999999999995e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.151137  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0836  PfkB  35.69 
 
 		 315 aa  170  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.252584  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3107  ribokinase-like domain-containing protein  33 
 
 		 313 aa  166  5e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0858  2-dehydro-3-deoxygluconokinase, putative  38.28 
 
 		 305 aa  165  8e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.341435  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0849  putative 2-dehydro-3-deoxygluconokinase  37.95 
 
 		 305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2368  ribokinase-like domain-containing protein  38.28 
 
 		 305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3109  PfkB domain protein  34.9 
 
 		 306 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5084  ribokinase-like domain-containing protein  36.93 
 
 		 311 aa  157  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.599555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2477  ribokinase-like domain-containing protein  32.79 
 
 		 325 aa  156  4e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000321874 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2321  ribokinase-like domain-containing protein  34.09 
 
 		 310 aa  154  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.96044 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1969  PfkB  32 
 
 		 318 aa  151  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.151768  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2840  PfkB domain protein  34.65 
 
 		 306 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3864  2-keto-3-deoxygluconate kinase  32.9 
 
 		 295 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0735701 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2141  ribokinase-like domain-containing protein  33.66 
 
 		 302 aa  136  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.117677  normal  0.398688 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3890  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  32.69 
 
 		 304 aa  135  9e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.413281  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2414  ribokinase-like domain-containing protein  35.92 
 
 		 302 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.322028  normal  0.348643 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4495  2-keto-3-deoxygluconate kinase  32.91 
 
 		 304 aa  133  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.964854  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2574  2-keto-3-deoxygluconate kinase  33.33 
 
 		 299 aa  133  3.9999999999999996e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.751635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5059  ribokinase-like domain-containing protein  31.35 
 
 		 305 aa  122  8e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.542139 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0275  PfkB domain-containing protein  31.72 
 
 		 312 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1857  ribokinase-like domain-containing protein  32.01 
 
 		 297 aa  109  6e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.96427  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0490  2-keto-3-deoxygluconate kinase  31.92 
 
 		 250 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4769  2-Keto-3-deoxygluconate kinase  31.02 
 
 		 311 aa  96.7  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4023  PfkB  29.3 
 
 		 311 aa  95.9  9e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102186  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  27.66 
 
 		 324 aa  95.9  9e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  26.28 
 
 		 339 aa  93.6  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  30.51 
 
 		 323 aa  93.2  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  26.52 
 
 		 317 aa  93.2  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01471  putative ketodeoxygluconokinase  39.01 
 
 		 153 aa  92.4  8e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  29.68 
 
 		 308 aa  92  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  26.76 
 
 		 312 aa  91.3  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3887  PfkB domain-containing protein  25.74 
 
 		 314 aa  91.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.316925  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1865  ribokinase-like domain-containing protein  28.33 
 
 		 320 aa  90.5  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.314409  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5091  PfkB  29.76 
 
 		 309 aa  90.1  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5479  PfkB domain protein  27.52 
 
 		 321 aa  89.7  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2132  PfkB domain protein  26.02 
 
 		 344 aa  87.4  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0936  PfkB  29.02 
 
 		 308 aa  86.3  7e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0963  PfkB  29.02 
 
 		 308 aa  86.3  7e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.371081  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1654  ribokinase-like domain-containing protein  27.05 
 
 		 330 aa  86.3  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  28.18 
 
 		 308 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  25.95 
 
 		 319 aa  84.3  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1382  PfkB domain protein  26.56 
 
 		 326 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.299274 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1654  ribokinase-like domain-containing protein  26.69 
 
 		 330 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.290792  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1746  ribokinase-like domain-containing protein  26.69 
 
 		 330 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1849  PfkB domain protein  27.93 
 
 		 316 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541004  normal  0.0446674 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1806  ribokinase-like domain-containing protein  28.12 
 
 		 308 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6298  PfkB  28.12 
 
 		 308 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1781  ribokinase-like domain-containing protein  28.12 
 
 		 308 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630486  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6346  PfkB  26.33 
 
 		 330 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1733  ribokinase-like domain-containing protein  26.33 
 
 		 330 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4308  PfkB domain protein  28.21 
 
 		 308 aa  83.2  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.600778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4198  PfkB domain protein  28.21 
 
 		 308 aa  83.2  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  26.15 
 
 		 320 aa  83.2  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05074  putative fructokinase-like protein (sugar kinase)  27.86 
 
 		 309 aa  82.8  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5029  ribokinase family sugar kinase  26.69 
 
 		 330 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.351369 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  27.09 
 
 		 323 aa  81.3  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2291  PfkB domain protein  27.21 
 
 		 329 aa  80.5  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4957  carbohydrate kinase, PfkB family  25 
 
 		 338 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  26.47 
 
 		 301 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>