More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_04824 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001087  glycosidase  86.06 
 
 		 537 aa  976    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04824  glycosidease  100 
 
 		 540 aa  1122    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3073  alpha amylase catalytic region  29.8 
 
 		 477 aa  155  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  27.25 
 
 		 588 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  30.83 
 
 		 582 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  27.57 
 
 		 574 aa  138  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0693  alpha amylase catalytic region  25.14 
 
 		 589 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.544256  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2715  alpha amylase catalytic region  25.44 
 
 		 586 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.783965  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1502  alpha amylase  24.8 
 
 		 610 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  24.8 
 
 		 510 aa  126  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0209  alpha amylase catalytic region  28.51 
 
 		 587 aa  126  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214929  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3419  hypothetical protein  26.92 
 
 		 481 aa  125  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  24.56 
 
 		 586 aa  125  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  23.77 
 
 		 586 aa  123  7e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  23.77 
 
 		 586 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0795  alpha amylase, catalytic region  23.74 
 
 		 575 aa  120  7e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  23.97 
 
 		 511 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0802  glycosy hydrolase family protein  24.22 
 
 		 610 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.124248  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  25.3 
 
 		 524 aa  118  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0789  cymH protein  25.74 
 
 		 610 aa  116  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2916  Alpha-amylase  25.96 
 
 		 472 aa  116  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1428  alpha amylase catalytic region  27.55 
 
 		 838 aa  114  5e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000263704  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4065  alpha-amylase  23.33 
 
 		 586 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00857502  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3923  alpha-amylase  23.18 
 
 		 586 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.077221  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3771  neopullulanase  23.38 
 
 		 586 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00823842  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4033  alpha-amylase  22.99 
 
 		 586 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1431  alpha amylase catalytic region  26.47 
 
 		 663 aa  112  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.246388  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4230  alpha-amylase  23.18 
 
 		 586 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.300485  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.32 
 
 		 1891 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3755  neopullulanase  22.99 
 
 		 586 aa  110  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000420185  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4139  alpha-amylase  23.14 
 
 		 586 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00110847  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2771  alpha amylase, catalytic region  27.68 
 
 		 433 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.473519  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05100  alpha-amylase  26.44 
 
 		 762 aa  108  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.443393  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2815  alpha amylase, catalytic region  27.68 
 
 		 433 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.896664  normal  0.115274 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3333  alpha amylase, catalytic region  25.06 
 
 		 434 aa  108  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.320284  normal  0.0371883 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0611  alpha amylase, catalytic region  27 
 
 		 496 aa  108  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.132901 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4392  alpha amylase, catalytic region  24.81 
 
 		 493 aa  108  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.47907 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  26.1 
 
 		 2068 aa  107  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2798  alpha amylase, catalytic region  25.96 
 
 		 433 aa  107  7e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.242606  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  25.38 
 
 		 1847 aa  106  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1944  alpha amylase catalytic region  25.38 
 
 		 486 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2874  alpha amylase catalytic region  26.54 
 
 		 1299 aa  105  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5089  alpha amylase catalytic region  24.29 
 
 		 619 aa  105  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000712833  normal  0.235138 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1971  alpha amylase catalytic region  26.08 
 
 		 486 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.0160527 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  25.05 
 
 		 499 aa  103  6e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4625  alpha amylase catalytic region  24.78 
 
 		 481 aa  103  7e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0867  alpha amylase catalytic region  24.59 
 
 		 558 aa  102  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2869  alpha amylase catalytic region  26.21 
 
 		 578 aa  103  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1998  alpha amylase catalytic region  29.86 
 
 		 481 aa  102  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.722533  normal  0.515841 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4269  alpha amylase catalytic region  23.02 
 
 		 528 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1785  alpha amylase, catalytic region  26.11 
 
 		 639 aa  102  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.48062  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0534  alpha amylase catalytic region  24.25 
 
 		 487 aa  101  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  0.941542 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3146  alpha amylase catalytic region  23.85 
 
 		 622 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.476414 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1318  alpha amylase catalytic region  24.24 
 
 		 486 aa  100  6e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.844059  normal  0.130735 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  23.63 
 
 		 836 aa  100  6e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0252  alpha amylase catalytic region  23.71 
 
 		 436 aa  100  9e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.795564  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4291  alpha amylase catalytic region  23.21 
 
 		 528 aa  100  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.57141  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0985  putative alpha amylase  22.67 
 
 		 604 aa  99.8  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1712  alpha amylase, catalytic region  28.51 
 
 		 481 aa  99.4  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2344  alpha amylase catalytic region  24.48 
 
 		 575 aa  98.2  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.520603  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2327  alpha amylase catalytic region  23.69 
 
 		 1401 aa  97.8  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.775797  normal  0.294215 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0347  alpha amylase catalytic region  26.26 
 
 		 522 aa  97.8  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.242051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2452  alpha amylase, catalytic region  23.17 
 
 		 1401 aa  98.2  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0187956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1856  Alpha amylase, catalytic region  23.95 
 
 		 586 aa  97.4  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4343  alpha amylase catalytic region  23.12 
 
 		 481 aa  97.8  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1852  neopullulanase  27.54 
 
 		 584 aa  97.8  5e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.496782  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0953  alpha amylase, catalytic region  24.36 
 
 		 814 aa  97.4  6e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0761659  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1613  alpha amylase, catalytic region  25.92 
 
 		 589 aa  97.4  6e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.050548  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2350  alpha amylase catalytic region  29.02 
 
 		 583 aa  97.1  8e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2017  Alpha amylase, catalytic region  24.55 
 
 		 488 aa  96.7  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00107336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  25.32 
 
 		 620 aa  95.9  2e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1746  alpha amylase, catalytic region  26.7 
 
 		 1021 aa  95.5  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0173524 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1660  alpha amylase, catalytic region  27.37 
 
 		 683 aa  94.4  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.500771 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  24.77 
 
 		 515 aa  93.6  9e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0215  neopullulanase  29.12 
 
 		 574 aa  92.8  1e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0425343  hitchhiker  0.000179088 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4138  Alpha amylase  23.66 
 
 		 533 aa  92  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.244711  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2859  trehalose synthase  26.65 
 
 		 577 aa  92.4  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3059  alpha amylase, catalytic region  25.23 
 
 		 434 aa  92  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50616 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2207  alpha amylase catalytic region  23.88 
 
 		 631 aa  91.3  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.247913  hitchhiker  0.0000287119 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21691  glycoside hydrolase family protein  30.41 
 
 		 483 aa  90.9  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0470032 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0362  alpha amylase catalytic region  23.58 
 
 		 623 aa  90.9  6e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000617875  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1887  alpha amylase, catalytic region  25.05 
 
 		 654 aa  90.1  8e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8141  trehalose synthase  26.01 
 
 		 567 aa  89.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2092  alpha amylase catalytic subunit  25.97 
 
 		 484 aa  89.4  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0253645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1313  alpha amylase, catalytic domain protein  25.86 
 
 		 459 aa  89.4  1e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24550  glycosidase  26.97 
 
 		 464 aa  89  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.665242 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0874  trehalose synthase  25.1 
 
 		 591 aa  89.4  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0794  alpha amylase catalytic region  22.91 
 
 		 562 aa  88.6  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1060  alpha amylase catalytic region  21.72 
 
 		 453 aa  88.6  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000151261  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1834  alpha amylase domain-containing protein  30.88 
 
 		 480 aa  88.6  3e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.108338  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0501  alpha amylase domain-containing protein  28.57 
 
 		 476 aa  88.6  3e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.259034  normal  0.140596 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0256  alpha amylase, catalytic region  34.62 
 
 		 1005 aa  88.6  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001132  glycosyl hydrolase family 13  23.87 
 
 		 885 aa  88.2  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0810  alpha amylase, catalytic region  29 
 
 		 540 aa  87.8  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.553058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0817  alpha amylase, catalytic region  33.88 
 
 		 599 aa  88.2  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001107  periplasmic alpha-amylase  35.53 
 
 		 686 aa  87.8  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0600503  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09700  alpha amylase  27.16 
 
 		 426 aa  87  7e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23200  alpha amylase  22.83 
 
 		 654 aa  86.7  9e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000149088  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1630  trehalose synthase  24.33 
 
 		 562 aa  86.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2031  alpha amylase, catalytic region  22.98 
 
 		 641 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>