More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02551 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02551  hypothetical protein  100 
 
 
239 aa  490  9.999999999999999e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1471  alpha/beta hydrolase fold  36.44 
 
 
234 aa  148  6e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4141  Alpha/beta hydrolase protein  39.79 
 
 
233 aa  148  8e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6785  alpha/beta hydrolase fold protein  36.91 
 
 
235 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0874  putative hydrolase  35.19 
 
 
233 aa  143  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0961  alpha/beta hydrolase fold  38.02 
 
 
233 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0172489 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0327  alpha/beta hydrolase  35.27 
 
 
237 aa  126  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2089  alpha/beta hydrolase  35.84 
 
 
236 aa  125  5e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.500476  normal  0.419915 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4363  alpha/beta hydrolase fold protein  34.05 
 
 
239 aa  125  6e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0510  alpha/beta hydrolase fold  32.6 
 
 
237 aa  124  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1738  alpha/beta hydrolase fold  34.36 
 
 
241 aa  122  7e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.44874  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4297  alpha/beta hydrolase fold  34.52 
 
 
259 aa  121  8e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.32686  normal  0.261339 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5034  alpha/beta hydrolase fold  32.91 
 
 
245 aa  120  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.246074  normal  0.671643 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1360  alpha/beta hydrolase fold  36.89 
 
 
251 aa  116  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.266873  normal  0.613317 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3900  alpha/beta hydrolase fold  35.6 
 
 
235 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.479584 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2316  hypothetical protein  31.47 
 
 
227 aa  108  8.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0856  alpha/beta hydrolase fold  32.02 
 
 
237 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000204036 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3812  alpha/beta hydrolase fold  32.48 
 
 
239 aa  103  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.281797  normal  0.255747 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1149  alpha/beta hydrolase fold protein  33.7 
 
 
265 aa  100  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  33.72 
 
 
264 aa  96.3  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  35.59 
 
 
265 aa  95.9  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2122  alpha/beta hydrolase fold  35.71 
 
 
263 aa  95.5  7e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3423  thioesterase  30.09 
 
 
238 aa  95.5  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5341  alpha/beta hydrolase  30.09 
 
 
251 aa  95.1  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.383955  normal  0.0838777 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4945  thioesterase  30.09 
 
 
251 aa  95.1  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0002846 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
263 aa  93.6  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
263 aa  93.6  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0636  alpha/beta hydrolase fold protein  32.2 
 
 
237 aa  93.2  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.809032  normal  0.841425 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3365  Alpha/beta hydrolase  31.89 
 
 
264 aa  93.2  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1693  hydrolase, alpha/beta fold family  31.63 
 
 
263 aa  92.4  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0513  Alpha/beta hydrolase  28.51 
 
 
229 aa  92  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000581936  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1941  alpha/beta hydrolase fold  34.41 
 
 
261 aa  91.3  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3896  alpha/beta hydrolase fold protein  28.76 
 
 
263 aa  90.1  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.407554  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29320  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  33.93 
 
 
248 aa  89  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3959  alpha/beta hydrolase fold  32.58 
 
 
264 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.166818 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1718  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase  25.93 
 
 
267 aa  85.5  6e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  29.48 
 
 
263 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1627  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  32.18 
 
 
262 aa  82.8  0.000000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2549  alpha/beta hydrolase fold  32.16 
 
 
263 aa  82.4  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1152  alpha/beta hydrolase fold protein  28.63 
 
 
239 aa  82.4  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2174  alpha/beta hydrolase fold  30.64 
 
 
261 aa  82.4  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  34.71 
 
 
265 aa  81.6  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0914  alpha/beta hydrolase fold protein  30.1 
 
 
255 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6107  alpha/beta hydrolase fold protein  28.09 
 
 
231 aa  79.3  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.519556  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  26.48 
 
 
273 aa  77.4  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  26.97 
 
 
280 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6262  alpha/beta hydrolase  28.76 
 
 
230 aa  76.6  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  26.7 
 
 
277 aa  76.6  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0670  alpha/beta hydrolase fold  27.55 
 
 
254 aa  76.3  0.0000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  29.55 
 
 
263 aa  75.9  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1989  alpha/beta hydrolase fold  32.31 
 
 
235 aa  75.5  0.0000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.512291  normal  0.434462 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  30.29 
 
 
276 aa  73.2  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1087  alpha/beta hydrolase fold protein  28.02 
 
 
245 aa  73.2  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0523898  normal  0.954451 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5083  3-oxoadipate enol-lactonase  31.79 
 
 
260 aa  72.4  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3642  alpha/beta fold family hydrolase  28.28 
 
 
262 aa  72.8  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2276  alpha/beta hydrolase fold  29.71 
 
 
264 aa  72.8  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.253162  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0077  alpha/beta hydrolase fold  22.94 
 
 
243 aa  70.9  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1222  Alpha/beta hydrolase fold  25.12 
 
 
262 aa  70.5  0.00000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00281  putative hydrolase  27.31 
 
 
232 aa  70.1  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.210482  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5939  3-oxoadipate enol-lactonase  29.95 
 
 
275 aa  70.1  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.178478 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7077  3-oxoadipate enol-lactonase  27.85 
 
 
269 aa  69.7  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335255  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  28.72 
 
 
273 aa  69.3  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1900  alpha/beta hydrolase fold  27.62 
 
 
271 aa  68.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  25.67 
 
 
283 aa  68.2  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1981  alpha/beta hydrolase fold  30.51 
 
 
287 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1842  alpha/beta hydrolase fold  28.96 
 
 
267 aa  67  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.384608 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0285  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  30.29 
 
 
259 aa  66.6  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  33.91 
 
 
271 aa  66.2  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2165  alpha/beta hydrolase fold protein  22.22 
 
 
255 aa  66.2  0.0000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  28.28 
 
 
300 aa  66.2  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10250  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.86 
 
 
289 aa  65.9  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2323  putative 2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase (MhpC)  29.78 
 
 
289 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00853  hypothetical protein  31.05 
 
 
275 aa  66.2  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001619  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  30.6 
 
 
271 aa  65.9  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00597314  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  28.64 
 
 
288 aa  65.5  0.0000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2691  3-oxoadipate enol-lactonase  29.89 
 
 
266 aa  64.7  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000109702  normal  0.164043 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2426  alpha/beta hydrolase fold protein  31.14 
 
 
267 aa  64.7  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.423437  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3157  alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 
262 aa  63.9  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000343409 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  26 
 
 
279 aa  63.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2893  alpha/beta fold family hydrolase  29.32 
 
 
273 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511984  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3974  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  29.32 
 
 
273 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1528  alpha/beta hydrolase fold  29.55 
 
 
278 aa  62.8  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.241032 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0415  alpha/beta hydrolase fold protein  26.61 
 
 
253 aa  62.8  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  29.5 
 
 
251 aa  62.8  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2314  alpha/beta hydrolase fold  26.46 
 
 
270 aa  62.8  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.75454  normal  0.0695894 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  29.17 
 
 
261 aa  62.8  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  28.32 
 
 
282 aa  62.4  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06565  Alpha/beta hydrolase  25.6 
 
 
254 aa  62.4  0.000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  26.51 
 
 
264 aa  62  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0208  alpha/beta hydrolase fold  27.51 
 
 
291 aa  62.4  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3250  alpha/beta hydrolase fold protein  22.82 
 
 
247 aa  62  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.176315 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0111  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  29.32 
 
 
372 aa  62  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  29.08 
 
 
270 aa  62  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3470  alpha/beta fold family hydrolase  29.32 
 
 
328 aa  62  0.000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3893  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  29.32 
 
 
328 aa  62  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.28749  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  23.86 
 
 
266 aa  61.6  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  25.73 
 
 
263 aa  61.6  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1326  alpha/beta hydrolase fold protein  25.79 
 
 
279 aa  61.6  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  28.9 
 
 
294 aa  60.5  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  24.1 
 
 
265 aa  60.5  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>