54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01999 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01999  hypothetical protein  100 
 
 		 997 aa  1988    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1298  phage tail tape measure protein, TP901 family  41.67 
 
 		 781 aa  217  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000950685 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01340  phage-related tail protein  27.76 
 
 		 956 aa  214  7e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.776722  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4475  tail protein  36.02 
 
 		 641 aa  209  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323148 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2253  tail protein  35.16 
 
 		 642 aa  207  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.725805  normal  0.182579 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2256  tail protein  35.73 
 
 		 642 aa  207  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000173389 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3865  phage tail protein, putative  34.52 
 
 		 651 aa  197  6e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0570  prophage P2W3, tail tape measure protein  28.12 
 
 		 680 aa  161  6e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2292  TP901 family phage tail tape measure protein  31.75 
 
 		 793 aa  158  4e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0268728  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0580  tail tape measure protein  31.73 
 
 		 714 aa  144  9e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.834112  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4592  Phage tail tape measure protein TP901, core region  30.49 
 
 		 719 aa  138  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0222  TP901 family tail tape measure protein  29.02 
 
 		 738 aa  122  3e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0394  hypothetical protein  25.15 
 
 		 739 aa  114  7.000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1133  hypothetical protein  25.15 
 
 		 739 aa  114  7.000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2844  phage tail tape measure protein  23.74 
 
 		 935 aa  111  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.581537  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3027  phage tail tape measure protein  23.78 
 
 		 935 aa  109  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000444183 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1155  TP901 family phage tail tape measure protein  24.16 
 
 		 739 aa  103  1e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0695  phage tail tape measure protein, TP901 family  26.98 
 
 		 762 aa  97.4  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2753  TP901 family phage tail tape measure protein  23.49 
 
 		 1025 aa  93.6  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000729903 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2489  phage tail tape measure protein  24.47 
 
 		 1025 aa  88.6  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0946  phage tail tape measure protein  24.47 
 
 		 1025 aa  87.4  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1148  Phage tail tape measure protein TP901, core region  24.44 
 
 		 826 aa  75.5  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1466  phage tail tape measure protein, TP901 family  22.38 
 
 		 1092 aa  75.1  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37360  Phage TMP domain-containing protein  22.5 
 
 		 1078 aa  67  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1914  phage-related tail transmembrane protein  23.79 
 
 		 887 aa  62.4  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.575173  normal  0.748507 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3313  TP901 family phage tail tape measure protein  29.05 
 
 		 863 aa  60.8  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.219365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1357  phage tail-like protein  26.45 
 
 		 550 aa  59.7  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2914  prophage MuMc02, TP901 family tail tape measure protein  20.72 
 
 		 993 aa  58.5  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3026  phage tail tape measure protein, TP901 family  25.13 
 
 		 815 aa  57.8  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0149182 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4790  phage tail tape measure protein, family  23.91 
 
 		 877 aa  55.8  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4349  TP901 family phage tail tape measure protein  25.67 
 
 		 815 aa  55.8  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1375  Phage tail tape measure protein TP901, core region  21.33 
 
 		 877 aa  55.5  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02660  phage tail tape measure protein, TP901 family  22.65 
 
 		 1095 aa  54.3  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000274947 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3478  TP901 family phage tail tape measure protein  25.67 
 
 		 809 aa  53.9  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.790573  normal  0.139413 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2350  TP901 family phage tail tape measure protein  23.9 
 
 		 971 aa  52  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.5162  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2303  TP901 family phage tail tape measure protein  23.9 
 
 		 971 aa  52  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.841337  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0855  hypothetical protein  34.69 
 
 		 1829 aa  51.6  0.00007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.890164  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4387  gp24  23.16 
 
 		 813 aa  50.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0182 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2178  phage tail tape measure protein, TP901 family  26.22 
 
 		 1342 aa  50.4  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0993  hypothetical protein  25.13 
 
 		 361 aa  49.7  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.600478  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2805  TP901 family phage tail tape measure protein  25.69 
 
 		 1183 aa  50.1  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2733  TP901 family phage tail tape measure protein  20.77 
 
 		 1183 aa  49.7  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.332181  hitchhiker  0.00107852 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2034  TP901 family phage tail tape measure protein  20.77 
 
 		 1183 aa  49.3  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.5433  normal  0.337313 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1327  phage-related tail transmembrane protein  19.34 
 
 		 986 aa  48.9  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4860  putative phage-related tail transmembrane protein  20.73 
 
 		 920 aa  48.9  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582054  normal  0.698632 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2562  TP901 family phage tail tape measure protein  20 
 
 		 1183 aa  48.9  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.881784  normal  0.265945 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1338  TP901 family phage tail tape measure protein  20 
 
 		 1183 aa  48.9  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413563 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0181  putative phage-related tail transmembrane protein  19.64 
 
 		 919 aa  48.5  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1272  TP901 family phage tail tape measure protein  24.77 
 
 		 1183 aa  48.5  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0574053 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0765  phage tail tape measure protein, TP901 family  25.79 
 
 		 1306 aa  48.1  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08120  putative tail length determinator protein  43.84 
 
 		 745 aa  47.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000076963  hitchhiker  0.000608309 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2891  TP901 family phage tail tape measure protein  21.26 
 
 		 1216 aa  46.6  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3322  Phage tail tape measure protein TP901, core region  21.04 
 
 		 743 aa  45.1  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.787637  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3196  phage tail tape measure protein, TP901 family  24.27 
 
 		 959 aa  44.7  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.112717  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>