More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003302 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003302  alanyl-tRNA synthetase domain protein  100 
 
 		 213 aa  440  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2298  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  58.49 
 
 		 212 aa  270  9e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.231148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1334  putative alanyl-tRNA synthetase  54.03 
 
 		 213 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2987  metal-dependent hydrolase  52.36 
 
 		 226 aa  247  8e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42325 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2969  alanyl-tRNA synthetase related protein  50.23 
 
 		 214 aa  231  5e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.160659  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4713  alanyl tRNA synthetase-related protein  51.67 
 
 		 212 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.601356  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0660  hypothetical protein  47.14 
 
 		 214 aa  208  4e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0644  hypothetical protein  47.37 
 
 		 221 aa  207  8e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0131  hypothetical protein  47.62 
 
 		 224 aa  197  7e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0641212  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0220  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  44.81 
 
 		 218 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.8521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4712  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  31.72 
 
 		 403 aa  103  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0289109  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4302  synthetase, putative  31.62 
 
 		 262 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.646666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4323  synthetase, putative  32.19 
 
 		 263 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1150  synthetase, putative  30.9 
 
 		 262 aa  98.2  7e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0599146  normal  0.802365 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1606  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  30.3 
 
 		 232 aa  96.3  3e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.877653  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0478  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  27 
 
 		 238 aa  96.3  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1111  synthetase, putative  30.47 
 
 		 262 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32124  normal  0.176588 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1395  alanyl-tRNA synthetase  31.88 
 
 		 892 aa  95.5  5e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1241  alanyl-tRNA synthetase  32.31 
 
 		 892 aa  94.4  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.243126  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0621  alanyl-tRNA synthetase  29.49 
 
 		 910 aa  93.6  2e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0513  alanyl-tRNA synthetase  31.44 
 
 		 892 aa  90.9  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007355  Mbar_A2092  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  29.22 
 
 		 243 aa  90.9  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1428  Alanyl-tRNA synthetase, class IIc-like protein  28.99 
 
 		 236 aa  89  5e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1468  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  28.33 
 
 		 238 aa  89  5e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4632  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  29.05 
 
 		 387 aa  87  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1030  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  29.71 
 
 		 240 aa  87  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.08615  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1034  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  28.33 
 
 		 238 aa  87  2e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000000152795 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2571  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  28.98 
 
 		 236 aa  85.9  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.613801  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1384  alanyl-tRNA synthetase  28.51 
 
 		 892 aa  85.5  5e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0988  hypothetical protein  30.04 
 
 		 245 aa  85.5  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0169723  normal  0.0507155 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2509  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  29.78 
 
 		 238 aa  85.1  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1597  alanyl-tRNA synthetase domain-containing protein  28.51 
 
 		 236 aa  85.1  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1720  alanyl-tRNA synthetase domain-containing protein  28.51 
 
 		 236 aa  85.1  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.996643  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0918  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  28.51 
 
 		 239 aa  84.7  8e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.523038  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1549  alanine--tRNA ligase  28.09 
 
 		 236 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0332631  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2228  alanyl-tRNA synthetase  30 
 
 		 892 aa  84.3  0.000000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1995  metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase  28.92 
 
 		 246 aa  84  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0849  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  28.64 
 
 		 239 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.201539  normal  0.867542 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0039  alanyl-tRNA synthetase  30.93 
 
 		 916 aa  83.6  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4224  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  26.91 
 
 		 236 aa  84  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119037  normal  0.17727 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1534  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  27.47 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.11001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2345  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  28.32 
 
 		 237 aa  82.4  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011989  Avi_1878  alanyl-tRNA synthetase  30.17 
 
 		 245 aa  82.4  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0209  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  29.26 
 
 		 390 aa  82.4  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.468608 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2149  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  29.1 
 
 		 239 aa  82  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.287127  n/a   
 
 
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NC_009049  Rsph17029_0823  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  29.1 
 
 		 239 aa  81.6  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0624764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1661  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  26.61 
 
 		 238 aa  80.9  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0175002 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1041  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  28.26 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000448232  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1770  alanyl-tRNA synthetase domain protein  28.09 
 
 		 236 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3604  alanyl-tRNA synthetase domain protein  28.09 
 
 		 236 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1739  alanyl-tRNA synthetase domain protein  27.66 
 
 		 236 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2431  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  29.87 
 
 		 389 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1993  alanyl-tRNA synthetase  31.17 
 
 		 896 aa  79.3  0.00000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
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NC_013922  Nmag_1156  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  32.56 
 
 		 446 aa  79.3  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0609715  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1793  alanyl-tRNA synthetase domain-containing protein  27.66 
 
 		 236 aa  79  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1257  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  27.12 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.018938  hitchhiker  0.0000000057233 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1560  alanine--tRNA ligase  27.66 
 
 		 236 aa  79  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1616  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  30.97 
 
 		 245 aa  78.6  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.128558  normal  0.455534 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1136  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  27.12 
 
 		 233 aa  78.6  0.00000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000475056  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1848  alanyl-tRNA synthetase domain protein  27.66 
 
 		 236 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2181  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  26.18 
 
 		 235 aa  77.8  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.290102  hitchhiker  0.0000501949 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2035  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  24.57 
 
 		 243 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1437  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  29.65 
 
 		 245 aa  77.4  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.422716 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3635  alanyl-tRNA synthetase family protein  27.44 
 
 		 400 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.9277 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0730  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  27.9 
 
 		 398 aa  76.6  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00140336 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0821  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  27.05 
 
 		 239 aa  77  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.35351  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3415  alanyl-tRNA synthetase family protein  26.51 
 
 		 411 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3684  alanyl-tRNA synthetase family protein  26.51 
 
 		 411 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1929  alanyl-tRNA synthetase  27.93 
 
 		 926 aa  76.6  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1513  alanyl-tRNA synthetase  28.63 
 
 		 915 aa  76.3  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3376  alanine--tRNA ligase (alanyl-tRNA synthetase)  26.98 
 
 		 411 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3326  alanine--tRNA ligase (alanyl-tRNA synthetase)  26.98 
 
 		 411 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2498  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  27.91 
 
 		 432 aa  75.5  0.0000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0615615  normal  0.305601 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0657  alanyl-tRNA synthetase  28.27 
 
 		 913 aa  75.5  0.0000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.459969  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4220  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  27.43 
 
 		 408 aa  75.1  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.147338  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0731  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  24.79 
 
 		 249 aa  74.7  0.0000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1313  alanyl-tRNA synthetase  27.31 
 
 		 900 aa  74.7  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3643  alanyl-tRNA synthetase family protein  27.19 
 
 		 400 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1287  alanyl-tRNA synthetase  27.92 
 
 		 913 aa  74.7  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.460274  normal  0.758822 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1898  alanyl-tRNA synthetase  28 
 
 		 899 aa  74.7  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0295948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1255  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  23.28 
 
 		 243 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4831  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  28.1 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0107612  normal  1 
 
 
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NC_011658  BCAH187_A3652  alanyl-tRNA synthetase family protein  28.11 
 
 		 400 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008782  Ajs_3853  metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase  27.87 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3029  alanyl-tRNA synthetase  30.47 
 
 		 876 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0315037  decreased coverage  0.0000367228 
 
 
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NC_007434  BURPS1710b_1402  alanyl-tRNA synthetase  22.84 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011083  SeHA_C3013  alanyl-tRNA synthetase  30.47 
 
 		 876 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.627309  decreased coverage  0.00000132365 
 
 
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NC_010084  Bmul_1000  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  24.26 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.332977  normal  1 
 
 
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NC_011205  SeD_A3136  alanyl-tRNA synthetase  30.47 
 
 		 876 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299814  hitchhiker  0.000378627 
 
 
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NC_008390  Bamb_2316  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  24.57 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011094  SeSA_A2978  alanyl-tRNA synthetase  30.47 
 
 		 876 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.471212  decreased coverage  0.000181445 
 
 
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NC_010551  BamMC406_2194  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  24.57 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011149  SeAg_B2946  alanyl-tRNA synthetase  30.47 
 
 		 876 aa  72.8  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00651312  n/a   
 
 
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NC_009712  Mboo_1267  alanyl-tRNA synthetase  27.98 
 
 		 914 aa  72.8  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.837647  normal  0.239203 
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_1263  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  23.91 
 
 		 243 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.857416  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_3310  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  26.17 
 
 		 411 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.463207  n/a   
 
 
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NC_011992  Dtpsy_3126  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  27.87 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A3732  alanyl-tRNA synthetase family protein  26.51 
 
 		 400 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.499023  n/a   
 
 
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NC_007355  Mbar_A1361  alanyl-tRNA synthetase  29.46 
 
 		 923 aa  72  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009440  Msed_1638  alanyl-tRNA synthetase  26.94 
 
 		 904 aa  72  0.000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
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