More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001783 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_001783  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system ATPase component  100 
 
 		 217 aa  444  1.0000000000000001e-124  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5954  ABC transporter related protein  58.49 
 
 		 218 aa  261  6.999999999999999e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0712  cell surface polysaccharide export ABC-2 transporter ATP-binding protein  53.92 
 
 		 217 aa  255  5e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.517356  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2582  ABC transporter related  53.99 
 
 		 221 aa  250  1e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000122652 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2730  ABC transporter related  56.6 
 
 		 216 aa  246  2e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2758  ABC transporter related  52.53 
 
 		 229 aa  246  2e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.557326  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3811  ABC transporter related  54.72 
 
 		 218 aa  243  1.9999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.545174  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02776  hypothetical protein  52.56 
 
 		 225 aa  240  1e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000456764  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3234  polysialic acid capsule biosynthesis transport protein KpsT  55.35 
 
 		 219 aa  239  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.953201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5580  ABC transporter related  51.85 
 
 		 217 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.819808 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1152  ABC transporter related  51.89 
 
 		 217 aa  237  8e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0623  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system ATPase component-like protein  50.7 
 
 		 286 aa  237  1e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.563302 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02827  Polysialic acid transport ATP-binding KpsT  52.63 
 
 		 219 aa  234  9e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1335  BexA  50.94 
 
 		 217 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1505  ABC transporter related protein  52.2 
 
 		 224 aa  232  3e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3903  ABC transporter related  46.51 
 
 		 217 aa  232  3e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.106958 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4084  ABC transporter related  50.69 
 
 		 269 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.185467  normal  0.229237 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3839  ABC polysaccharide export transporter, ATPase subunit  50.69 
 
 		 273 aa  231  5e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00536302  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0720  ABC transporter related  47.44 
 
 		 215 aa  230  1e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0774  ABC transporter related  48.61 
 
 		 217 aa  229  3e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  hitchhiker  0.00137592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0745  ABC transporter related  50 
 
 		 222 aa  229  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0815  ABC transporter related  48.61 
 
 		 217 aa  229  3e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.392518 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0292  ABC transporter related  49.31 
 
 		 218 aa  229  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0776  ABC transporter related  49.31 
 
 		 218 aa  229  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4995  ABC transporter related  50.97 
 
 		 219 aa  228  6e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0209263 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0736  ABC transporter related  48.15 
 
 		 233 aa  227  1e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0841853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2077  ABC transporter related  49.05 
 
 		 220 aa  226  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.475401 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1524  ABC transporter related  49.06 
 
 		 216 aa  224  6e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1659  ABC transporter related  47.93 
 
 		 217 aa  223  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3493  ABC transporter related  46.3 
 
 		 220 aa  222  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4077  ABC transporter related  48.11 
 
 		 219 aa  221  9e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0433978 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1305  polysialic acid transport ATP-binding protein  52.8 
 
 		 220 aa  220  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2304  capsule polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  47 
 
 		 218 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3251  capsular polysaccharide export ABC transporter, ATP-binding protein  47 
 
 		 218 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2182  capsular polysaccharide export ABC transporter, ATP-binding protein  47 
 
 		 218 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1075  capsular polysaccharide export ABC transporter, ATP-binding protein  47 
 
 		 218 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.460756  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0434  ABC transporter related  46.54 
 
 		 217 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.554012  decreased coverage  0.00307291 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3867  ABC transporter, ATPase subunit  47.17 
 
 		 217 aa  219  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3239  ABC transporter related  47.22 
 
 		 216 aa  219  3e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2344  ABC transporter related  48.11 
 
 		 217 aa  215  5e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.268315  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2607  ABC transporter related  46.33 
 
 		 218 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2127  ABC transporter related  50.24 
 
 		 225 aa  212  2.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5037  ABC transporter related  50.24 
 
 		 225 aa  213  2.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0748  ABC transporter related  46.51 
 
 		 232 aa  211  7e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2963  capsule polysaccharide exporter, ATP-binding protein  46.79 
 
 		 217 aa  210  1e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.382388  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2576  ABC transporter related  46.79 
 
 		 217 aa  210  1e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.502206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0660  ABC transporter related  44.81 
 
 		 215 aa  209  2e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.188715  normal  0.0364209 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1620  capsular polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  47.69 
 
 		 220 aa  208  4e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1781  capsular polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  47.69 
 
 		 220 aa  208  4e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1440  capsular polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  47.69 
 
 		 220 aa  208  4e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03060  KpsT protein  44.13 
 
 		 224 aa  200  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5731  polysialic acid transport ATP-binding protein KpsT  47.91 
 
 		 221 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0291  capsular polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  44.44 
 
 		 223 aa  196  2.0000000000000003e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3995  hypothetical protein  50.33 
 
 		 179 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.67953  normal  0.524106 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1235  ABC transporter related  39.91 
 
 		 217 aa  171  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000953894  normal  0.730254 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0585  capsule polysaccharide export  40.19 
 
 		 219 aa  169  3e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4940  ATPase component ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system  40.47 
 
 		 230 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.687059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0655  ABC transporter related  38.97 
 
 		 219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0524  capsular polysaccharide export ABC transporter, ATP-binding protein  46.1 
 
 		 157 aa  161  6e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.216602  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3656  ABC transporter related  36.62 
 
 		 219 aa  149  5e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.340001  normal  0.381344 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3643  ABC transporter related  37.31 
 
 		 443 aa  142  4e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000162695  decreased coverage  0.0000834131 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0848  ABC transporter related  38.78 
 
 		 249 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.174284 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1362  ABC transporter related  33.9 
 
 		 472 aa  140  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0452028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0395  ABC transporter related  37.76 
 
 		 250 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0877  ABC transporter related  37.76 
 
 		 250 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14680  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  36.15 
 
 		 264 aa  138  7e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.21715  hitchhiker  0.00000227338 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2409  ABC transporter related protein  38.31 
 
 		 415 aa  137  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0276  ABC transporter related  36.32 
 
 		 392 aa  137  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1387  ABC transporter related  35.61 
 
 		 402 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.928113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6710  ABC transporter related  37.76 
 
 		 254 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0564  ABC transporter related  36.14 
 
 		 406 aa  136  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3976  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, ATPase subunit  39.44 
 
 		 435 aa  135  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0264  ABC transporter, ATP-binding protein  36.24 
 
 		 390 aa  135  6.0000000000000005e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0255  teichoic acid translocation ATP-binding protein  37.56 
 
 		 390 aa  135  6.0000000000000005e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0421  ABC transporter related  36.68 
 
 		 424 aa  134  9e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4203  ABC transporter related  36.22 
 
 		 429 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2200  ABC transporter related  35.15 
 
 		 498 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.206971  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0745  ABC transporter related  35.16 
 
 		 249 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.751265  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0053  ABC transporter related  38.78 
 
 		 244 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3546  ABC transporter related  37.57 
 
 		 247 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1244  ATPase  35.32 
 
 		 432 aa  133  1.9999999999999998e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000485389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2398  ABC transporter related  34 
 
 		 488 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0848  polysaccharide ABC transporter, ATPase component  39.59 
 
 		 418 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.105464  normal  0.234564 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5670  ABC transporter related protein  36.22 
 
 		 253 aa  133  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0408186 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4904  ABC transporter-like protein protein  36.53 
 
 		 418 aa  133  1.9999999999999998e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0325  ABC transporter related  37.19 
 
 		 422 aa  133  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123997  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4620  ABC transporter related  36.87 
 
 		 411 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.065306 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2515  ABC transporter related  36.11 
 
 		 424 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.780644 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4048  ABC transporter-like  34.34 
 
 		 438 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192199  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1725  ABC transporter related  35.48 
 
 		 420 aa  132  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.047923 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0371  putative ABC-2 type transport system ATP-binding protein  36.77 
 
 		 410 aa  132  5e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3964  ABC transporter related  35.47 
 
 		 416 aa  132  5e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3813  ABC transporter related  34.86 
 
 		 711 aa  132  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.396147  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71940  ABC subunit of A-band LPS efflux transporter  34.1 
 
 		 421 aa  132  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0319  ABC transporter related  35 
 
 		 455 aa  132  6e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.746089  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4204  ABC transporter related  37.88 
 
 		 424 aa  131  6.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.257703 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0767  ABC transporter related  35.53 
 
 		 406 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3694  ABC transporter related  35.79 
 
 		 429 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2537  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system ATPase component  37.06 
 
 		 261 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.481808  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1747  ABC transporter related  37.31 
 
 		 400 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>