More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2662 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0267  TonB-dependent siderophore receptor  51.15 
 
 		 689 aa  643    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0216741 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0283  TonB-dependent siderophore receptor  48.63 
 
 		 689 aa  638    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0293  TonB-dependent siderophore receptor  48.33 
 
 		 700 aa  639    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2662  TonB system receptor  100 
 
 		 680 aa  1399    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0618091  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0293  TonB-dependent siderophore receptor  49.56 
 
 		 698 aa  645    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1629  TonB-dependent siderophore receptor  44.65 
 
 		 712 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385709 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1175  TonB-dependent siderophore receptor  43.42 
 
 		 749 aa  511  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1655  TonB-dependent siderophore receptor  43.27 
 
 		 656 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4786  TonB-dependent siderophore receptor  36.5 
 
 		 712 aa  385  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.789588  normal  0.608467 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  31.48 
 
 		 727 aa  301  2e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  30.72 
 
 		 770 aa  300  6e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  30.6 
 
 		 710 aa  300  8e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  32.68 
 
 		 707 aa  300  8e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  32.14 
 
 		 706 aa  295  1e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  32.14 
 
 		 706 aa  295  1e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  29.87 
 
 		 710 aa  293  5e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  33.54 
 
 		 694 aa  291  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  33.69 
 
 		 715 aa  291  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  33.19 
 
 		 695 aa  291  4e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1439  TonB-dependent receptor protein  30.54 
 
 		 688 aa  291  4e-77  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  32.12 
 
 		 719 aa  290  7e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  31.96 
 
 		 792 aa  281  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5373  TonB-dependent siderophore receptor  30.85 
 
 		 745 aa  274  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.834495  normal  0.604125 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  30.8 
 
 		 732 aa  270  5e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  30.69 
 
 		 703 aa  269  2e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7101  TonB-dependent siderophore receptor  30.3 
 
 		 732 aa  264  4e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2053  TonB-dependent siderophore receptor  31.34 
 
 		 719 aa  263  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  31.38 
 
 		 860 aa  259  9e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  30.13 
 
 		 708 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  28.89 
 
 		 757 aa  250  7e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  28.89 
 
 		 709 aa  249  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1260  TonB-dependent siderophore receptor  29.97 
 
 		 755 aa  248  3e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  30.44 
 
 		 701 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  29.53 
 
 		 692 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  29.83 
 
 		 689 aa  242  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  30.27 
 
 		 709 aa  241  2e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02662  putative TonB-dependent receptor  29.28 
 
 		 693 aa  242  2e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.196813  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3915  TonB-dependent siderophore receptor  28.86 
 
 		 742 aa  241  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  30.8 
 
 		 850 aa  241  2.9999999999999997e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3802  TonB-dependent siderophore receptor  28.86 
 
 		 742 aa  241  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.799699  normal  0.136718 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3292  TonB-dependent siderophore receptor  28.42 
 
 		 771 aa  241  2.9999999999999997e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3077  TonB-dependent siderophore receptor  27.88 
 
 		 753 aa  241  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2005  TonB-dependent siderophore receptor  30.2 
 
 		 724 aa  240  8e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.22147  normal  0.931942 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  29.95 
 
 		 696 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  29.8 
 
 		 696 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2282  TonB-dependent siderophore receptor  29.53 
 
 		 724 aa  238  3e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.217728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3574  TonB-dependent siderophore receptor  28.94 
 
 		 734 aa  237  4e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.647008 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  28.48 
 
 		 736 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1961  TonB-dependent siderophore receptor  30.06 
 
 		 705 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.353089 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  29.05 
 
 		 837 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001067  ferric siderophore receptor PsuA  27.71 
 
 		 678 aa  232  2e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  29.67 
 
 		 701 aa  232  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  28.28 
 
 		 722 aa  232  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  29.32 
 
 		 757 aa  230  7e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  28.42 
 
 		 689 aa  229  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  30.52 
 
 		 703 aa  229  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  28.42 
 
 		 734 aa  228  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1281  TonB-dependent siderophore receptor  29.29 
 
 		 699 aa  228  3e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2395  TonB-dependent siderophore receptor  29.36 
 
 		 812 aa  227  6e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5005  TonB-dependent siderophore receptor  28.76 
 
 		 736 aa  227  6e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4480  TonB-dependent siderophore receptor  28.76 
 
 		 734 aa  226  7e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.938344  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  28.64 
 
 		 722 aa  226  8e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3773  TonB-dependent siderophore receptor  28.94 
 
 		 701 aa  226  2e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3280  TonB-dependent siderophore receptor  30.59 
 
 		 707 aa  224  3e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0713327  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  27.52 
 
 		 714 aa  224  4e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  29.22 
 
 		 701 aa  224  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  29.07 
 
 		 701 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2876  TonB-dependent siderophore receptor  27.22 
 
 		 751 aa  222  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  28.96 
 
 		 701 aa  220  6e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  28.53 
 
 		 702 aa  220  6e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  28.53 
 
 		 702 aa  220  6e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  28.96 
 
 		 701 aa  220  6e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  27.62 
 
 		 732 aa  220  7.999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  27.51 
 
 		 738 aa  219  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  28.82 
 
 		 701 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2091  TonB-dependent siderophore receptor  29.64 
 
 		 735 aa  219  1e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.761777  normal  0.724468 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  28.44 
 
 		 710 aa  219  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  29.53 
 
 		 703 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  27.17 
 
 		 729 aa  218  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0395  ferrichrome-iron receptor  27.75 
 
 		 696 aa  217  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.458077  hitchhiker  0.000000000000143872 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0416  ferrichrome-iron receptor  27.65 
 
 		 696 aa  217  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345861 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2861  ferrichrome-iron receptor  28.63 
 
 		 808 aa  216  8e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331625  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  26.88 
 
 		 864 aa  216  9.999999999999999e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0458  TonB-dependent siderophore receptor  27.57 
 
 		 705 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0688  TonB-dependent receptor protein  29.49 
 
 		 716 aa  214  4.9999999999999996e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3741  TonB-dependent siderophore receptor  28.34 
 
 		 723 aa  212  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0398  ferrichrome-iron receptor  27.23 
 
 		 698 aa  213  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0458  ferrichrome-iron receptor  27.37 
 
 		 696 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000766311 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3724  TonB-dependent receptor for iron transport  27.48 
 
 		 765 aa  211  3e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0404  ferrichrome-iron receptor  27.37 
 
 		 696 aa  211  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000262521 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  29.22 
 
 		 741 aa  210  6e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  29.64 
 
 		 817 aa  210  7e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3526  TonB-dependent siderophore receptor  27.7 
 
 		 722 aa  210  8e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  28.51 
 
 		 689 aa  209  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  26.2 
 
 		 825 aa  208  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4026  TonB-dependent siderophore receptor  30.12 
 
 		 755 aa  207  6e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.865466  normal  0.196913 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0493  TonB-dependent siderophore receptor  27.22 
 
 		 696 aa  207  6e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  28.53 
 
 		 703 aa  207  7e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  27.21 
 
 		 859 aa  206  8e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  25.79 
 
 		 825 aa  206  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>