More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0547 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2748  4-aminobutyrate aminotransferase  74.67 
 
 		 468 aa  716    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04875  4-aminobutyrate aminotransferase  74.17 
 
 		 459 aa  739    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0547  4-aminobutyrate aminotransferase  100 
 
 		 465 aa  968    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000207209  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0813  4-aminobutyrate aminotransferase  76.89 
 
 		 459 aa  714    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.908317  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000768  putative aminotransferase in phosphonate-related cluster  74.17 
 
 		 459 aa  741    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3092  4-aminobutyrate aminotransferase  63.72 
 
 		 452 aa  600  1e-170  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.625534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3420  aminotransferase class-III  47.84 
 
 		 458 aa  433  1e-120  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2754  4-aminobutyrate aminotransferase  36.83 
 
 		 445 aa  234  3e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1705  hypothetical protein  33.94 
 
 		 447 aa  218  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0167541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  33.5 
 
 		 436 aa  215  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1870  aminotransferase class-III  30 
 
 		 444 aa  216  9.999999999999999e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1120  aminotransferase class-III  29.86 
 
 		 446 aa  214  1.9999999999999998e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.020832  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2159  4-aminobutyrate aminotransferase  30.54 
 
 		 445 aa  212  1e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  33.17 
 
 		 441 aa  211  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004322  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  33.89 
 
 		 443 aa  210  4e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2680  4-aminobutyrate aminotransferase  30.3 
 
 		 445 aa  210  4e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2626  4-aminobutyrate aminotransferase  30.3 
 
 		 445 aa  210  4e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.805613  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4297  hypothetical protein  32.75 
 
 		 448 aa  210  5e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90094  normal  0.321538 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4978  hypothetical protein  32.75 
 
 		 448 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3182  hypothetical protein  32.75 
 
 		 448 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0379  aminotransferase class-III  30.16 
 
 		 443 aa  209  7e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4056  Acetylornithine transaminase  33.09 
 
 		 446 aa  208  2e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0161  hypothetical protein  36.6 
 
 		 442 aa  207  2e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00079  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  32.41 
 
 		 403 aa  208  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3362  aminotransferase class-III  32.59 
 
 		 433 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4582  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  33.76 
 
 		 405 aa  205  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5005  aminotransferase class-III  32.59 
 
 		 433 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1287  hypothetical protein  33.33 
 
 		 459 aa  206  1e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0354138  normal  0.112297 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  31.71 
 
 		 444 aa  205  2e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5114  aminotransferase class-III  32.1 
 
 		 436 aa  205  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14780  4-aminobutyrate aminotransferase  31.21 
 
 		 437 aa  205  2e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2275  hypothetical protein  31.63 
 
 		 436 aa  204  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2195  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  33.41 
 
 		 403 aa  203  4e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0176  hypothetical protein  34.91 
 
 		 440 aa  203  5e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2112  hypothetical protein  31.38 
 
 		 436 aa  203  6e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177398  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3668  hypothetical protein  35.38 
 
 		 451 aa  202  7e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002275  acetylornithine aminotransferase/N-succinyl-L,L-diaminopimelate aminotransferase/succinylornithine transaminase  32.22 
 
 		 403 aa  202  7e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0368  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  33.5 
 
 		 406 aa  202  8e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1957  4-aminobutyrate aminotransferase  33.1 
 
 		 427 aa  202  8e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3602  hypothetical protein  32.35 
 
 		 444 aa  202  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0673474  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0665  aminotransferase  32.59 
 
 		 433 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.459907 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4418  aminotransferase class-III  32.43 
 
 		 433 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0107565 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0082  hypothetical protein  35.16 
 
 		 450 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0798772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4862  hypothetical protein  35.31 
 
 		 462 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.843286  normal  0.0653436 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2139  hypothetical protein  31.16 
 
 		 436 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2077  hypothetical protein  31.16 
 
 		 436 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2073  hypothetical protein  31.16 
 
 		 436 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2319  hypothetical protein  31.16 
 
 		 436 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2294  hypothetical protein  31.16 
 
 		 436 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3048  hypothetical protein  31.15 
 
 		 436 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4936  aminotransferase class-III  32.43 
 
 		 433 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.875817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2402  hypothetical protein  31.16 
 
 		 436 aa  201  3e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1519  hypothetical protein  35.17 
 
 		 464 aa  201  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0346179  hitchhiker  0.000407941 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2328  hypothetical protein  31.16 
 
 		 436 aa  201  3e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000223994  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4285  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  33.65 
 
 		 406 aa  201  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0950  hypothetical protein  33.41 
 
 		 448 aa  201  3e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.927487  normal  0.694624 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1142  hypothetical protein  34.98 
 
 		 442 aa  201  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0809653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5220  hypothetical protein  35.01 
 
 		 445 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.275374 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  31.51 
 
 		 428 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  28.64 
 
 		 452 aa  200  5e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  30.02 
 
 		 396 aa  200  5e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0532  aminotransferase class-III  30.53 
 
 		 444 aa  199  6e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410218  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3345  hypothetical protein  34.15 
 
 		 451 aa  199  6e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2218  aminotransferase  30.73 
 
 		 450 aa  199  7e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3225  hypothetical protein  34.11 
 
 		 456 aa  199  7e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210609  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1446  hypothetical protein  35.62 
 
 		 444 aa  199  7.999999999999999e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0289166  normal  0.430384 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0218  aminotransferase class-III  30.96 
 
 		 452 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  30.32 
 
 		 466 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2925  aminotransferase class-III  33.17 
 
 		 474 aa  199  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4687  hypothetical protein  31.33 
 
 		 446 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2046  aminotransferase class-III  32.67 
 
 		 433 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000254153 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  31.74 
 
 		 454 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1570  hypothetical protein  34.44 
 
 		 461 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  0.698819 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2675  aminotransferase  32.59 
 
 		 433 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4042  aminotransferase class-III  30.86 
 
 		 448 aa  198  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.690945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3443  aminotransferase class-III  30.73 
 
 		 450 aa  197  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000605746  normal  0.17806 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2668  aminotransferase  31.89 
 
 		 457 aa  197  3e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4500  hypothetical protein  35.45 
 
 		 444 aa  197  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.747245  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4481  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  30.75 
 
 		 406 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.593317 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3821  hypothetical protein  31.57 
 
 		 446 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000353101 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1434  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  30.25 
 
 		 406 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.845656 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3989  4-aminobutyrate aminotransferase  30.31 
 
 		 461 aa  197  4.0000000000000005e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2911  hypothetical protein  30.12 
 
 		 454 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  30.36 
 
 		 460 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5282  aminotransferase class-III  31.84 
 
 		 433 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596714  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07656  conserved hypothetical protein  31.93 
 
 		 452 aa  196  5.000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.346872  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  31.11 
 
 		 454 aa  196  9e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  31.11 
 
 		 478 aa  196  9e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  31.11 
 
 		 454 aa  196  9e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4033  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  31.11 
 
 		 408 aa  196  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.327701  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  30.89 
 
 		 454 aa  196  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5803  aminotransferase class-III  31.54 
 
 		 433 aa  195  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.413013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1041  hypothetical protein  33.71 
 
 		 446 aa  195  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1896  aminotransferase class-III  31.34 
 
 		 432 aa  195  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0311328 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0285  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  33.76 
 
 		 413 aa  195  1e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1245  hypothetical protein  33.57 
 
 		 461 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  31.28 
 
 		 454 aa  195  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0533  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  32.67 
 
 		 394 aa  195  2e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7651  aminotransferase class-III  31.91 
 
 		 451 aa  195  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.681629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  29.93 
 
 		 456 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>