More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0213 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011374  UUR10_0212  ammonium transporter  75.55 
 
 
507 aa  729    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0213  ammonium transporter  100 
 
 
520 aa  1050    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0157  ammonium transporter  42.11 
 
 
405 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1566  ammonium transporter  40.09 
 
 
432 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436096  normal  0.0257715 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1461  ammonium transporter  44.38 
 
 
412 aa  270  4e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1299  ammonium transporter  44.38 
 
 
412 aa  270  4e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.421181  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0749  ammonium transporter  41.15 
 
 
405 aa  268  2e-70  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000261873  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5122  ammonium transporter  43.54 
 
 
412 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.484556 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31514  Amt family transporter: ammonium  39.24 
 
 
418 aa  267  4e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0422  ammonium transporter  39.4 
 
 
429 aa  260  5.0000000000000005e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0294  ammonium transporter  39.25 
 
 
436 aa  258  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3048  ammonium transporter  39.07 
 
 
405 aa  259  1e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2065  ammonium transporter  39.91 
 
 
431 aa  257  4e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000790161  normal  0.636143 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  38.67 
 
 
467 aa  255  2.0000000000000002e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  37.59 
 
 
451 aa  255  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  39.67 
 
 
449 aa  255  2.0000000000000002e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  38.53 
 
 
444 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  38.53 
 
 
478 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  38.53 
 
 
500 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  38.07 
 
 
469 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  38.53 
 
 
466 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  38.53 
 
 
466 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  38.53 
 
 
466 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  38.53 
 
 
500 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1006  ammonium transporter  36.87 
 
 
453 aa  253  7e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.732511  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1182  ammonium transporter  36.75 
 
 
432 aa  253  7e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000100846 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2267  ammonium transporter  38.62 
 
 
405 aa  252  1e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.828522  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0276  ammonium transporter  36.65 
 
 
443 aa  250  3e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1298  ammonium transporter  36.85 
 
 
456 aa  251  3e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.270535  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3728  ammonium transporter  37.67 
 
 
437 aa  249  6e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2068  ammonium transporter  35.99 
 
 
406 aa  249  7e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000438744  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1187  ammonium transporter  37.98 
 
 
478 aa  248  1e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.569583  hitchhiker  0.00412014 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3605  ammonium transporter  37.44 
 
 
437 aa  247  4e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3537  ammonium transporter  37.44 
 
 
437 aa  247  4e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.945825  decreased coverage  0.00000925998 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0706  ammonium transporter  37.44 
 
 
437 aa  247  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  37.7 
 
 
504 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0032  ammonium transporter  38.94 
 
 
462 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6204  ammonium transporter  37.67 
 
 
427 aa  246  4.9999999999999997e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442016  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0565  ammonium transporter  37.99 
 
 
428 aa  246  6e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000907445  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  36.34 
 
 
444 aa  246  6.999999999999999e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1269  ammonium transporter  37.16 
 
 
411 aa  246  8e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000200287  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1059  ammonium transporter  36.47 
 
 
410 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000580155  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  36.93 
 
 
457 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1508  ammonium transporter  36.99 
 
 
515 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1078  ammonium transporter  37.01 
 
 
410 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000106824  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1056  ammonium transporter  37.16 
 
 
410 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000003226  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3160  ammonium transporter  36.61 
 
 
466 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0807  ammonium transporter  36.61 
 
 
466 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0849  ammonium transporter  36.08 
 
 
474 aa  244  3.9999999999999997e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1059  ammonium transporter  36.93 
 
 
410 aa  243  6e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.498340000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2708  ammonium transporter  36.76 
 
 
515 aa  243  6e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000035421 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1237  ammonium transporter  36.93 
 
 
410 aa  243  7e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1313  ammonium transporter  36.26 
 
 
410 aa  243  7e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000021179  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0778  ammonium transporter  37.78 
 
 
466 aa  243  7e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  37.47 
 
 
500 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  37.47 
 
 
500 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  37.47 
 
 
500 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  36.97 
 
 
434 aa  242  1e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1210  ammonium transporter  36.26 
 
 
410 aa  242  1e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000809734  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06675  ammonium transporter  39.67 
 
 
427 aa  242  1e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3995  ammonium transporter  37.35 
 
 
445 aa  241  2e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  37.47 
 
 
500 aa  241  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1061  ammonium transporter  36.95 
 
 
461 aa  241  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4131  ammonium transporter  36.41 
 
 
410 aa  240  4e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000588768  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0588  ammonium transporter  36.29 
 
 
435 aa  239  6.999999999999999e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3314  ammonium transporter  37.2 
 
 
442 aa  239  8e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0659  ammonium transporter  35.91 
 
 
439 aa  239  1e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2547  ammonium transporter  35.94 
 
 
434 aa  238  1e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.916988  normal  0.19301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0541  ammonium transporter  36.32 
 
 
462 aa  237  4e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0695  ammonium transporter  36.76 
 
 
488 aa  237  4e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7335  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0257  ammonium transporter  36.09 
 
 
501 aa  237  4e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0959  ammonium transporter  37.89 
 
 
433 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0598  ammonium transporter  37.79 
 
 
463 aa  236  1.0000000000000001e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419594 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3149  ammonium transporter  37.83 
 
 
459 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000753064  hitchhiker  0.00186594 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0142  ammonium transporter  36.24 
 
 
464 aa  234  3e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000211671  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2272  ammonium transporter  36.24 
 
 
467 aa  234  4.0000000000000004e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.220314  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0046  ammonium transporter  35.27 
 
 
429 aa  233  5e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000652471  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0776  ammonium transporter  36.44 
 
 
431 aa  233  6e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000446987  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0940  ammonium transporter  37.61 
 
 
489 aa  233  6e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0292  ammonium transporter  35.84 
 
 
513 aa  233  6e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2309  ammonium transporter  36.84 
 
 
437 aa  233  7.000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0936  ammonium transporter  37.64 
 
 
433 aa  233  7.000000000000001e-60  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0741  ammonium transporter  35.85 
 
 
397 aa  232  1e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0796039  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2311  ammonium transporter  37.35 
 
 
401 aa  231  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.191525  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0471  ammonium transporter  35.08 
 
 
496 aa  231  3e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.122427  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  36.6 
 
 
438 aa  230  4e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  36.6 
 
 
438 aa  230  4e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0241  ammonium transporter  35.6 
 
 
510 aa  230  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.60924  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1490  ammonium transporter  35.65 
 
 
472 aa  230  4e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1896  ammonium transporter  36.3 
 
 
433 aa  229  7e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.786334  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0221  ammonium transporter  35.07 
 
 
446 aa  229  7e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0531  ammonia permease  37.93 
 
 
411 aa  229  7e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000144186  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0343  ammonium transporter  35.18 
 
 
436 aa  229  8e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2356  ammonium transporter  36.49 
 
 
435 aa  229  8e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0566  ammonium transporter  35.85 
 
 
427 aa  229  1e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0404362  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2782  ammonium transporter  38.16 
 
 
503 aa  229  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0900246  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2920  ammonium transporter  38.16 
 
 
497 aa  229  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617737  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0526  ammonium transporter  39.34 
 
 
502 aa  229  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0177  ammonium transporter  37.36 
 
 
436 aa  228  1e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000694522  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0487  ammonium transporter  35.21 
 
 
507 aa  228  1e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>