More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1656 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  100 
 
 
152 aa  302  1.0000000000000001e-81  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1301  MutT/nudix family protein  42.98 
 
 
163 aa  90.5  7e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308038  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
154 aa  89.4  1e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2529  NUDIX hydrolase  38.02 
 
 
143 aa  86.7  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412332  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  44.54 
 
 
136 aa  85.1  3e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3984  NUDIX hydrolase  40.16 
 
 
167 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.99462  decreased coverage  0.00100111 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4817  NUDIX hydrolase  40.65 
 
 
159 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688995  normal  0.147337 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4299  NUDIX hydrolase  40.65 
 
 
165 aa  84  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.687324  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0598  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 
162 aa  84  6e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0963  NUDIX hydrolase  39.82 
 
 
139 aa  83.6  9e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1477  ADP-ribose pyrophosphatase  41.23 
 
 
158 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0066  NUDIX family hydrolase  41.23 
 
 
158 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156967  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1565  ADP-ribose pyrophosphatase  41.23 
 
 
158 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  37.7 
 
 
153 aa  81.3  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1291  NUDIX hydrolase  38.4 
 
 
161 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.327149 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4668  NUDIX hydrolase  39.84 
 
 
161 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  35.34 
 
 
146 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2097  NUDIX hydrolase  39.83 
 
 
151 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0651329  normal  0.043835 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  41.07 
 
 
136 aa  79.7  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  39.5 
 
 
144 aa  79.7  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2004  NUDIX hydrolase  38.58 
 
 
162 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2381  putative Nudix hydrolase family protein  37.5 
 
 
139 aa  79  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  42.16 
 
 
137 aa  78.2  0.00000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1203  NUDIX hydrolase  37.07 
 
 
149 aa  77.8  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  36.75 
 
 
147 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1065  NUDIX hydrolase  39.5 
 
 
151 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.595183  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  38.6 
 
 
171 aa  76.6  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5292  NUDIX hydrolase  38.4 
 
 
163 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0621231 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  34.75 
 
 
155 aa  75.1  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  36.97 
 
 
146 aa  75.1  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  38.74 
 
 
171 aa  75.5  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3208  NUDIX hydrolase  41.53 
 
 
168 aa  75.1  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135414  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  36.52 
 
 
141 aa  74.7  0.0000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  41.51 
 
 
139 aa  74.7  0.0000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2044  NUDIX hydrolase  39.47 
 
 
147 aa  73.9  0.0000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490099 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6097  NUDIX hydrolase  36.22 
 
 
167 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  40.52 
 
 
153 aa  72.8  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1980  NUDIX hydrolase  36.22 
 
 
167 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2614  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 
152 aa  72.4  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.349258  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0672  MutT/nudix family protein  39.09 
 
 
147 aa  72  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.959271  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0666  MutT/nudix family protein  38.18 
 
 
147 aa  71.2  0.000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.613905  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2023  NUDIX hydrolase  30 
 
 
148 aa  71.2  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.296194  normal  0.0882034 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  38.98 
 
 
141 aa  70.9  0.000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1466  ADP-Ribose Pyrophosphatase  38.98 
 
 
146 aa  70.1  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1243  NUDIX hydrolase  36.75 
 
 
141 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01132  bifunctional thiamin pyrimidine pyrophosphate hydrolase/ thiamin pyrophosphate hydrolase  32.33 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01140  hypothetical protein  32.33 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1089  NUDIX hydrolase  37.07 
 
 
155 aa  69.3  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2513  NUDIX hydrolase  32.33 
 
 
153 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00897802  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1297  NUDIX family hydrolase  32.33 
 
 
153 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2469  NUDIX hydrolase  32.33 
 
 
153 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  38.94 
 
 
141 aa  68.2  0.00000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1312  hydrolase, NUDIX family  34.07 
 
 
153 aa  68.2  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.869507  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1991  NUDIX family hydrolase  32.33 
 
 
153 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1595  hydrolase, NUDIX family  32.33 
 
 
153 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000876504 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1254  NUDIX family hydrolase  32.33 
 
 
153 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.440982  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  37.84 
 
 
171 aa  67.8  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4015  NUDIX hydrolase  36.79 
 
 
143 aa  67  0.00000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2700  NUDIX hydrolase  36.28 
 
 
138 aa  66.6  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0600757  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1128  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 
141 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0349929  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
179 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1314  NUDIX family hydrolase  30.28 
 
 
153 aa  64.7  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.137933 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  34.75 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  30.4 
 
 
158 aa  64.3  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1194  NUDIX hydrolase  39.81 
 
 
126 aa  64.3  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.317663  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2062  NUDIX hydrolase  32.06 
 
 
150 aa  63.2  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.894699  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0716  NUDIX hydrolase  36.45 
 
 
196 aa  63.5  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.343449 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  32.43 
 
 
137 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1352  NUDIX family hydrolase  30.08 
 
 
153 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.468385 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2850  NUDIX family hydrolase  30.08 
 
 
148 aa  63.5  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.482932 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2131  NUDIX family hydrolase  30.08 
 
 
153 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00480915 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4263  NUDIX hydrolase  54.1 
 
 
147 aa  63.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  35.78 
 
 
236 aa  63.5  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1336  NUDIX family hydrolase  30.08 
 
 
153 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0415939 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1949  hydrolase, NUDIX family  30.08 
 
 
153 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1613  NUDIX family hydrolase  30.08 
 
 
148 aa  63.5  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0380  NUDIX hydrolase  34.91 
 
 
199 aa  62.8  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000301987  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1721  NUDIX hydrolase  30.08 
 
 
148 aa  63.5  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4327  NUDIX hydrolase  31.62 
 
 
145 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.356422 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  36.61 
 
 
135 aa  62.4  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0710  NUDIX hydrolase  33.63 
 
 
154 aa  61.6  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4267  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  35.38 
 
 
346 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178343  normal  0.0602888 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1943  NUDIX hydrolase  30.6 
 
 
152 aa  61.6  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.639742  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1169  NUDIX hydrolase  35.38 
 
 
138 aa  61.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25540  ADP-ribose pyrophosphatase  52.83 
 
 
224 aa  61.6  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.237744  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2061  MutT/nudix family protein  45.31 
 
 
157 aa  61.2  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000668178  normal  0.862843 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4793  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  34.62 
 
 
346 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0447007  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2080  NUDIX hydrolase  30.36 
 
 
187 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  32.46 
 
 
147 aa  60.8  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3650  NUDIX hydrolase  30.36 
 
 
187 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1851  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  34.68 
 
 
362 aa  60.5  0.000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000289338 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1647  NUDIX hydrolase  29.32 
 
 
157 aa  60.5  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.654975  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1017  NUDIX hydrolase  36.52 
 
 
144 aa  60.5  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.803103  normal  0.224803 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3935  NUDIX hydrolase  35.65 
 
 
180 aa  60.5  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445815  hitchhiker  0.00928201 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5399  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  34.62 
 
 
346 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1870  NUDIX hydrolase  27.86 
 
 
148 aa  60.1  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0662124  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1913  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  34.13 
 
 
355 aa  60.1  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.680637  decreased coverage  0.0000316043 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  36.13 
 
 
155 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0922  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
136 aa  60.1  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  36.13 
 
 
155 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>