78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3893 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2914  phage terminase  71.17 
 
 		 489 aa  714    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3893  Terminase  100 
 
 		 489 aa  992    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2958  phage terminase  71.17 
 
 		 489 aa  714    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.911038 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3074  phage terminase  71.17 
 
 		 489 aa  710    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.218281  normal  1 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4250  Terminase  29.14 
 
 		 557 aa  122  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1642  phage terminase, large subunit, putative  26.87 
 
 		 529 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458906  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5155  phage terminase, large subunit  28.48 
 
 		 498 aa  104  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1289  terminase  25.71 
 
 		 521 aa  100  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1337  phage terminase  27.41 
 
 		 491 aa  97.1  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4385  putative phage terminase, large subunit  24.51 
 
 		 565 aa  91.3  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2020  phage terminase  24.32 
 
 		 542 aa  87.8  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1722  phage terminase  25.68 
 
 		 849 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.879362  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0333  phage terminase  24.51 
 
 		 542 aa  84.7  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0872  Phage terminase-like protein  25.57 
 
 		 530 aa  83.6  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0866597  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1088  terminase, large subunit, putative  24.07 
 
 		 535 aa  83.2  0.000000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0397  phage terminase, large subunit, putative  26.08 
 
 		 534 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2837  Terminase  26.08 
 
 		 534 aa  79  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0957  putative phage terminase, large subunit  24.09 
 
 		 553 aa  77.8  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7140  terminase  23.76 
 
 		 564 aa  77  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000516304 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3989  Terminase  23.55 
 
 		 540 aa  75.5  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0464  phage terminase, large subunit  24.62 
 
 		 581 aa  75.1  0.000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.281704 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1251  phage terminase  25.05 
 
 		 535 aa  71.2  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0443  prophage LambdaBa04, terminase, large subunit  27.97 
 
 		 562 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0465  prophage lambdaba04, terminase, large subunit  27.97 
 
 		 562 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08190  phage terminase-like protein, large subunit  31.02 
 
 		 546 aa  70.9  0.00000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.038355  hitchhiker  0.000322264 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1885  phage terminase  22.24 
 
 		 561 aa  70.1  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.421412  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0563  Terminase  21.74 
 
 		 584 aa  68.6  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126065  hitchhiker  0.00000000000223198 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2998  putative terminase large subunit  25.29 
 
 		 528 aa  68.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.353099  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1650  hypothetical protein  24.18 
 
 		 552 aa  68.2  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2967  phage terminase large subunit  26.06 
 
 		 581 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2596  Terminase  25.76 
 
 		 581 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.737156  normal  0.0814833 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2352  putative terminase large subunit / phage terminase  26.36 
 
 		 510 aa  67.8  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.769747  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1616  phage terminase  23.03 
 
 		 563 aa  67.4  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332385  normal  0.451204 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2480  phage terminase  24.09 
 
 		 545 aa  67.4  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4221  Terminase  28.25 
 
 		 526 aa  67  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.329871  normal  0.306119 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0547  Phage terminase protein large subunit-like protein  29.44 
 
 		 574 aa  65.1  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2471  Terminase  24.72 
 
 		 550 aa  64.7  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0623  Terminase  22.32 
 
 		 566 aa  65.1  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0870  phage terminase  23.03 
 
 		 556 aa  64.7  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1471  phage terminase, large subunit, putative  21.79 
 
 		 541 aa  64.3  0.000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1186  putative phage terminase, large subunit  28.04 
 
 		 585 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.619537  hitchhiker  0.0000000060413 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0670  phage terminase  22.15 
 
 		 569 aa  61.2  0.00000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0867  phage terminase, large subunit, putative  21.11 
 
 		 543 aa  60.8  0.00000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000215214  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1726  phage terminase  23.19 
 
 		 540 aa  59.3  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.18547  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1335  terminase  22.49 
 
 		 569 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.21157 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5620  Terminase  25 
 
 		 537 aa  59.7  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3431  terminase  25.67 
 
 		 562 aa  58.5  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511695  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3510  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit  25.67 
 
 		 562 aa  58.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3264  Terminase  28.39 
 
 		 546 aa  58.5  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.727886  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3787  prophage lambdaba01, terminase, large subunit  25.67 
 
 		 562 aa  58.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.26855  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1563  phage terminase, large subunit, putative  22.25 
 
 		 561 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446284  hitchhiker  0.000374969 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3806  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  27.98 
 
 		 590 aa  57  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0560358  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4094  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  27.98 
 
 		 562 aa  56.6  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0654332  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5836  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit, putative  24.18 
 
 		 561 aa  56.6  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2237  putative prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  27.98 
 
 		 591 aa  57  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0731538  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3973  phage terminase  21.5 
 
 		 568 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.230918 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1855  prophage LambdaSa2, terminase large subunit, putative  29.86 
 
 		 570 aa  55.5  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.526141  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1587  putative phage terminase, large subunit  21.21 
 
 		 579 aa  54.7  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0773483  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5505  Terminase  26.8 
 
 		 574 aa  55.1  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2165  hypothetical protein  24.89 
 
 		 593 aa  54.7  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.122295 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4462  putative phage terminase, large subunit  26.89 
 
 		 558 aa  54.3  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000365476 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1545  phage terminase  24.52 
 
 		 588 aa  52.4  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.512611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2271  putative phage terminase, large subunit  23.25 
 
 		 577 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.441488  hitchhiker  0.000000000000278373 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2596  phage terminase  21.85 
 
 		 565 aa  50.4  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1658  Terminase  23.4 
 
 		 565 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1302  Terminase  22.8 
 
 		 556 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3429  terminase large subunit, N-terminal region  26.62 
 
 		 215 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1315  Terminase  21.23 
 
 		 590 aa  48.9  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1699  Terminase  21.23 
 
 		 590 aa  48.9  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2275  Terminase  21.23 
 
 		 590 aa  48.9  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0149  phage terminase, large subunit, putative  26.96 
 
 		 229 aa  48.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0123294  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1404  terminase large subunit  26.79 
 
 		 169 aa  48.5  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2267  putative phage terminase, large subunit  21.76 
 
 		 577 aa  46.6  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1723  phage Terminase  22.31 
 
 		 587 aa  44.7  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1631  terminase  29.23 
 
 		 586 aa  44.7  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1616  phage terminase  29.82 
 
 		 537 aa  43.9  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.869159  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4005  putative phage terminase, large subunit  21.83 
 
 		 571 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7332  Terminase  26.95 
 
 		 581 aa  43.1  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.959431  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>