More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1465 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_9185  ABC transporter related protein  65.37 
 
 		 536 aa  721    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1338  ABC transporter related protein  66.48 
 
 		 539 aa  680    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.113682  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1583  ABC transporter related  62.43 
 
 		 542 aa  635    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0969  ABC transporter related  63.16 
 
 		 553 aa  670    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.350056  normal  0.122999 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1465  ABC transporter related protein  100 
 
 		 544 aa  1082    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0719  ABC transporter related  62.37 
 
 		 569 aa  649    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2749  ABC transporter related protein  63.77 
 
 		 561 aa  668    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.308133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29380  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  60.5 
 
 		 562 aa  664    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.186742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0525  ABC transporter related  60.54 
 
 		 560 aa  638    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1325  ABC transporter related  61.83 
 
 		 572 aa  649    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0938  ABC transporter related protein  75.14 
 
 		 539 aa  781    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4144  ABC transporter related  59.11 
 
 		 560 aa  642    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0882  ABC transporter related  62.87 
 
 		 574 aa  679    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.743322  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02910  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  59.72 
 
 		 571 aa  634  1e-180  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3918  ABC transporter related  59.82 
 
 		 564 aa  630  1e-179  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7235  ABC transporter related protein  62.02 
 
 		 543 aa  608  1e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.602341  normal  0.0775512 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3891  ABC transporter related  59.64 
 
 		 554 aa  607  9.999999999999999e-173  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2614  ABC transporter related protein  62.19 
 
 		 558 aa  606  9.999999999999999e-173  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0902  ABC transporter related protein  56.29 
 
 		 555 aa  598  1e-170  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103036  normal  0.118594 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4282  ABC transporter related  58.08 
 
 		 559 aa  591  1e-167  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184754  hitchhiker  0.00727726 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0413  ABC transporter related protein  44.14 
 
 		 488 aa  340  4e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.630834  normal  0.476223 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  32.1 
 
 		 645 aa  211  3e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  31.4 
 
 		 767 aa  209  1e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  32.6 
 
 		 668 aa  204  3e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0954  ABC transporter related  31.94 
 
 		 633 aa  204  4e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07215  ABC transporter ATP-binding protein  28.95 
 
 		 622 aa  203  5e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3628  ABC transporter related  31.21 
 
 		 649 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00303453  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  32.55 
 
 		 540 aa  201  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  32.63 
 
 		 543 aa  200  5e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  33.59 
 
 		 545 aa  200  5e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4007  ABC transporter related protein  28.93 
 
 		 641 aa  199  9e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4025  ABC transporter related  32.63 
 
 		 543 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2910  ABC transporter related  34.4 
 
 		 537 aa  197  4.0000000000000005e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.53858 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  30.38 
 
 		 533 aa  196  9e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2545  ABC transporter-related protein  31.91 
 
 		 641 aa  196  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00131859  decreased coverage  1.5432e-19 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11540  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  32.6 
 
 		 532 aa  195  2e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00577413  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  32.12 
 
 		 549 aa  195  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  31.91 
 
 		 540 aa  195  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1075  ABC transporter related  31.4 
 
 		 627 aa  195  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000840512 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  26.06 
 
 		 639 aa  194  3e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  31.72 
 
 		 540 aa  194  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2072  ABC transporter related protein  34.95 
 
 		 533 aa  194  4e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  33.14 
 
 		 544 aa  194  4e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0716  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  32.95 
 
 		 541 aa  194  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5994  ABC transporter related  32.16 
 
 		 540 aa  194  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0310  ABC transporter related  30.23 
 
 		 649 aa  193  6e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0922  ABC transporter, ATP-binding protein  33.27 
 
 		 645 aa  193  7e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0308249  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5912  ABC transporter related  31.98 
 
 		 560 aa  193  7e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.214443 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0889  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.74 
 
 		 554 aa  193  7e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_50537  predicted protein  30.49 
 
 		 879 aa  193  8e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.437528  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  28.92 
 
 		 643 aa  193  8e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2877  ABC transporter related  31.8 
 
 		 621 aa  192  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.358823  normal  0.296098 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0576  ABC transporter related  32.6 
 
 		 540 aa  192  1e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2563  ABC transporter related  33.98 
 
 		 532 aa  192  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0199173  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0493  ATPase  30.31 
 
 		 653 aa  191  2e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.521292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0701  ABC transporter related  31.33 
 
 		 648 aa  192  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000286992 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2271  ABC transporter related  33.04 
 
 		 532 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.582561 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  32.18 
 
 		 540 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  28.52 
 
 		 636 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1220  ABC transporter related  30.97 
 
 		 627 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000289587 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1027  ABC transporter related  30.1 
 
 		 664 aa  191  2.9999999999999997e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0770  ABC transporter related  30.93 
 
 		 629 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0943746 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4062  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.82 
 
 		 554 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.247157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0764  ABC transporter related  30.17 
 
 		 652 aa  191  4e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.687969  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1682  ABC transporter related protein  33.76 
 
 		 532 aa  191  4e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4024  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.01 
 
 		 554 aa  191  4e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.640286  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4057  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.01 
 
 		 554 aa  190  5e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  28.8 
 
 		 634 aa  190  5e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0690  ABC transporter related protein  30.75 
 
 		 648 aa  190  5.999999999999999e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.185815  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  31.32 
 
 		 690 aa  190  5.999999999999999e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0619  ABC transporter ATP-binding protein uup  27.5 
 
 		 646 aa  190  5.999999999999999e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.828103  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1631  ABC transporter related  32.68 
 
 		 545 aa  189  8e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.987433 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2115  ABC transporter related  27.46 
 
 		 621 aa  189  9e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0255573  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  30.29 
 
 		 545 aa  189  9e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4945  ABC transporter related  29.93 
 
 		 561 aa  189  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4267  ABC transporter related  31.88 
 
 		 621 aa  189  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.183783  normal  0.517303 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3917  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.81 
 
 		 554 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4634  ABC transporter related  31.88 
 
 		 621 aa  189  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  30.95 
 
 		 709 aa  188  2e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1799  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.34 
 
 		 554 aa  189  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.255837 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  28.73 
 
 		 685 aa  189  2e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1948  ABC transporter related  30.4 
 
 		 650 aa  188  2e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1093  ABC transporter related  28.63 
 
 		 634 aa  188  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2696  ABC transporter related  31.12 
 
 		 659 aa  187  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2217  ABC transporter related  32.51 
 
 		 565 aa  187  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0024  ABC transporter related protein  26.65 
 
 		 627 aa  187  4e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1801  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.02 
 
 		 553 aa  187  4e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.124805  normal  0.0665876 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1721  ABC transporter-related protein  31.99 
 
 		 548 aa  187  5e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0618  ABC transporter related  29.38 
 
 		 652 aa  187  5e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000236816  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1447  ABC transporter related  29.57 
 
 		 632 aa  186  7e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0743  ABC transporter related  28.73 
 
 		 625 aa  186  9e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0760  ABC transporter related  28.73 
 
 		 625 aa  186  9e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4079  ABC transporter related  32.59 
 
 		 540 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1792  ABC transporter related  31.8 
 
 		 548 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1233  ABC transporter related  31.47 
 
 		 659 aa  186  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.632204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2091  ABC transporter related  29.37 
 
 		 627 aa  186  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.105315 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2157  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  31.99 
 
 		 548 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428099  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2190  ABC transporter, ATP-binding protein  29.35 
 
 		 631 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.783831 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0506  ABC transporter related  35.21 
 
 		 691 aa  186  1.0000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7527  hypothetical protein  34.8 
 
 		 536 aa  186  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.752036  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>