152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2553 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2553  HpcH/HpaI aldolase  100 
 
 		 332 aa  676    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.108107  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2868  malyl-CoA lyase or citrate lyase, beta subunit  73.46 
 
 		 327 aa  508  1e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4148  putative citrate lyase  61.77 
 
 		 331 aa  429  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4429  Citrate lyase subunit beta-like protein  62.27 
 
 		 373 aa  427  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00516467  normal  0.457948 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4731  HpcH/HpaI aldolase  60 
 
 		 334 aa  404  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834162  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1830  HpcH/HpaI aldolase  57.54 
 
 		 326 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.650441 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4357  HpcH/HpaI aldolase  56.31 
 
 		 340 aa  383  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6859  HpcH/HpaI aldolase  56 
 
 		 338 aa  380  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.750259  normal  0.224007 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2154  HpcH/HpaI aldolase  57.54 
 
 		 326 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.377613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2899  lyase  54.85 
 
 		 338 aa  375  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0657  lyase, putative  58.18 
 
 		 339 aa  370  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2490  HpcH/HpaI aldolase  56.62 
 
 		 326 aa  365  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.33076 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4436  HpcH/HpaI aldolase  59.15 
 
 		 378 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3931  HpcH/HpaI aldolase  59.15 
 
 		 378 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3597  HpcH/HpaI aldolase  58.46 
 
 		 335 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1999  lyase protein  58.31 
 
 		 320 aa  362  4e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.697821  normal  0.433586 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2328  putative citrate lyase beta subunit  56.31 
 
 		 326 aa  362  4e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3824  HpcH/HpaI aldolase  59.7 
 
 		 334 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.508893 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1618  putative lyase  57.85 
 
 		 339 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1826  putative lyase  57.85 
 
 		 339 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2337  putative lyase  57.85 
 
 		 339 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0496  putative lyase  57.85 
 
 		 339 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2475  putative lyase  57.85 
 
 		 339 aa  361  8e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3308  HpcH/HpaI aldolase  59.09 
 
 		 334 aa  359  5e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.747689 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1752  putative lyase  57.68 
 
 		 331 aa  354  1e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2155  citrate lyase beta subunit-like  58.84 
 
 		 335 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4652  HpcH/HpaI aldolase  58.05 
 
 		 335 aa  350  3e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0797  putative lyase  57.97 
 
 		 307 aa  328  8e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2173  putative lyase  51.06 
 
 		 337 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.24016 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2709  putative lyase  49.4 
 
 		 350 aa  320  3e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.15345 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3597  HpcH/HpaI aldolase  48.05 
 
 		 356 aa  299  3e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3029  HpcH/HpaI aldolase  49.1 
 
 		 329 aa  296  3e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.37236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2208  HpcH/HpaI aldolase  51.5 
 
 		 341 aa  295  6e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2431  HpcH/HpaI aldolase  50.3 
 
 		 339 aa  288  1e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1804  putative citrate lyase beta subunit  47.09 
 
 		 354 aa  285  8e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0637103  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1434  HpcH/HpaI aldolase  48.78 
 
 		 332 aa  278  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2279  HpcH/HpaI aldolase  48.78 
 
 		 336 aa  268  8e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2789  HpcH/HpaI aldolase  48.78 
 
 		 336 aa  268  8.999999999999999e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.175467  normal  0.257367 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3189  citrate (pro-3S)-lyase  31.41 
 
 		 301 aa  84.7  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0128752  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2805  HpcH/HpaI aldolase  27.62 
 
 		 355 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1771  beta subunit of citrate lyase  28.73 
 
 		 318 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.508507  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0417  Citryl-CoA lyase  28.73 
 
 		 318 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0799  citrate (pro-3S)-lyase  26.76 
 
 		 341 aa  79.3  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.105286  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1580  Citryl-CoA lyase  26.96 
 
 		 303 aa  75.5  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.264708  hitchhiker  0.00335996 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2481  citrate (pro-3S)-lyase  27.99 
 
 		 379 aa  74.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.565353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3098  HpcH/HpaI aldolase  26.54 
 
 		 371 aa  74.7  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136599  normal  0.227792 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0830  citrate lyase  27.11 
 
 		 282 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0807208  normal  0.0919126 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6909  citrate (pro-3S)-lyase  29.7 
 
 		 316 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3165  Citryl-CoA lyase  27.24 
 
 		 320 aa  70.1  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4393  HpcH/HpaI aldolase  25 
 
 		 363 aa  69.7  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3050  citrate lyase subunit beta  27.99 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0471  citrate lyase  26.35 
 
 		 318 aa  67  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.750948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1253  Citryl-CoA lyase  30.6 
 
 		 287 aa  66.2  0.0000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2166  citrate lyase  30.03 
 
 		 338 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4030  citrate (pro-3S)-lyase  26.92 
 
 		 316 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4534  Citryl-CoA lyase  26.92 
 
 		 321 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.668521  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0213  HpcH/HpaI aldolase  28.03 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4213  HpcH/HpaI aldolase  27.35 
 
 		 351 aa  63.9  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1370  Citrate (pro-3S)-lyase  28 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2830  Citryl-CoA lyase  29.88 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0217  citrate lyase  27.45 
 
 		 325 aa  58.9  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.342299  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3810  HpcH/HpaI aldolase  27.49 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3870  HpcH/HpaI aldolase  23.21 
 
 		 346 aa  58.5  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  28.86 
 
 		 282 aa  58.2  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0669  Citryl-CoA lyase  26.4 
 
 		 318 aa  57  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2214  HpcH/HpaI aldolase  33.02 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0660288  normal  0.0595234 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6108  HpcH/HpaI aldolase  30.92 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000904095  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1739  citrate lyase, beta subunit, putative  27.31 
 
 		 320 aa  55.5  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000771015  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01440  conserved hypothetical protein  23.55 
 
 		 330 aa  55.5  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6315  HpcH/HpaI aldolase  25 
 
 		 349 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.185554  hitchhiker  0.008113 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1313  putative citrate lyase beta subunit  30.48 
 
 		 275 aa  55.1  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0723  Citryl-CoA lyase  25.35 
 
 		 318 aa  54.7  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0655305 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5950  HpcH/HpaI aldolase  23.9 
 
 		 291 aa  53.9  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1328  HpcH/HpaI aldolase  23.36 
 
 		 350 aa  53.5  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  hitchhiker  0.00231317 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0618  Citrate (pro-3S)-lyase  29.36 
 
 		 270 aa  53.1  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0840536 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4487  citrate (pro-3S)-lyase  26.14 
 
 		 318 aa  53.1  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0353068  normal  0.0397424 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7769  Citrate (pro-3S)-lyase  27.53 
 
 		 321 aa  53.1  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1078  citrate lyase  27.9 
 
 		 316 aa  52.8  0.000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.132128  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1137  Citrate (pro-3S)-lyase  27.6 
 
 		 317 aa  52.4  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1754  Citrate (pro-3S)-lyase  25 
 
 		 324 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0669  putative HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase  24.42 
 
 		 274 aa  52  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0106618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7119  HpcH/HpaI aldolase  25.71 
 
 		 324 aa  52  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574186  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0580  HpcH/HpaI aldolase  30.08 
 
 		 297 aa  51.2  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5195  Citrate (pro-3S)-lyase  28.5 
 
 		 315 aa  51.6  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.152568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1348  HpcH/HpaI aldolase  31.86 
 
 		 276 aa  51.2  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  23.98 
 
 		 294 aa  50.8  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1777  Citrate (pro-3S)-lyase  24.42 
 
 		 312 aa  51.2  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1154  Citrate (pro-3S)-lyase  32.57 
 
 		 288 aa  50.8  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3663  Citryl-CoA lyase  25.36 
 
 		 323 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.144396  normal  0.0822593 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4390  HpcH/HpaI aldolase  23.41 
 
 		 349 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.345408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1192  Citrate (pro-3S)-lyase  26.42 
 
 		 313 aa  50.4  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.151099  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2561  citrate (pro-3S)-lyase  26.01 
 
 		 331 aa  50.4  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.180481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2138  Citrate (pro-3S)-lyase  25 
 
 		 324 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.845302  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1802  citrate (pro-3S)-lyase  25 
 
 		 324 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.23047 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6255  HpcH/HpaI aldolase  23.51 
 
 		 291 aa  50.1  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.76273 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7178  HpcH/HpaI aldolase  23.85 
 
 		 350 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102062  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1719  Citrate (pro-3S)-lyase  25.26 
 
 		 325 aa  49.7  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.412951 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6559  citrate (pro-3S)-lyase  24.64 
 
 		 323 aa  49.7  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527752  normal  0.02273 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5924  citrate (pro-3S)-lyase  26.5 
 
 		 325 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1719  HpcH/HpaI aldolase  25.48 
 
 		 281 aa  48.9  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.422564 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>