More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1369 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1369  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
206 aa  408  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0591  MotA/TolQ/ExbB proton channel  66.02 
 
 
214 aa  279  2e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0990686 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2673  MotA/TolQ/ExbB proton channel  64.36 
 
 
253 aa  273  1.0000000000000001e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  62.38 
 
 
208 aa  258  3e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1436  MotA/TolQ/ExbB proton channel  63.18 
 
 
218 aa  251  7e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.726638 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2178  putative tolQ-type transport protein  57.92 
 
 
211 aa  244  6.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25490  putative tolQ-type transport protein  57.92 
 
 
211 aa  244  6.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0178753  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  58.21 
 
 
210 aa  238  4e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.94 
 
 
208 aa  233  2.0000000000000002e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.162411  normal  0.347505 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  53.69 
 
 
204 aa  228  5e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1612  MotA/TolQ/ExbB proton channel  57.43 
 
 
210 aa  225  3e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.19801 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14740  MotA/TolQ/ExbB proton channel  61.98 
 
 
200 aa  222  3e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0542744  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4177  MotA/TolQ/ExbB proton channel  55.67 
 
 
211 aa  218  5e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0667192  normal  0.294706 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50 
 
 
209 aa  217  1e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1029  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.48 
 
 
203 aa  215  4e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000146441  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3816  MotA/TolQ/ExbB proton channel  56.93 
 
 
224 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.114421  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1510  exbB-like biopolymer transport  50 
 
 
201 aa  211  3.9999999999999995e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.232406  normal  0.284557 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1509  MotA/TolQ/ExbB proton channel  55.67 
 
 
211 aa  211  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.75134  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1474  MotA/TolQ/ExbB proton channel  56.44 
 
 
224 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.368115  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1898  MotA/TolQ/ExbB proton channel  55.94 
 
 
224 aa  210  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000558815 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1633  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.69 
 
 
238 aa  207  8e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0433342  normal  0.463741 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1731  MotA/TolQ/ExbB proton channel  55.72 
 
 
207 aa  207  8e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2092  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.02 
 
 
204 aa  202  4e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0117508  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0351  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.27 
 
 
220 aa  199  3e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0387  biopolymer transport protein  53.27 
 
 
220 aa  199  3e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3217  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.25 
 
 
202 aa  194  5.000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.581955  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3847  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  53.12 
 
 
214 aa  191  5e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.410653  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3210  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.04 
 
 
201 aa  182  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000028591  normal  0.177382 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1396  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.5 
 
 
220 aa  182  3e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.739677  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.34 
 
 
206 aa  180  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000013307  unclonable  0.0000000588107 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2528  biopolymer transport EXBB-like transmembrane protein  45.85 
 
 
206 aa  176  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0033963  normal  0.0481325 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2399  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.37 
 
 
206 aa  176  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0433367  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2805  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.37 
 
 
206 aa  174  6e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00166663  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3153  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.5 
 
 
221 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00590  biopolymer transport protein  50.25 
 
 
220 aa  172  3.9999999999999995e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.421222  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0485  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  47.42 
 
 
206 aa  171  5.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18294  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0645  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.42 
 
 
206 aa  171  5.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557109  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2643  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.29 
 
 
210 aa  169  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.232186  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2483  putative biopolymer transport exbB-like transmembrane protein  46.04 
 
 
213 aa  168  5e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0658113  normal  0.425168 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0595  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.34 
 
 
231 aa  168  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000000225479  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2553  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.65 
 
 
192 aa  164  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158299 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2566  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45 
 
 
208 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.11709  decreased coverage  0.00204386 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2303  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.4 
 
 
212 aa  159  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.466313  normal  0.0952346 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1556  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.4 
 
 
212 aa  159  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.25632  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3572  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.78 
 
 
210 aa  157  9e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0594941  decreased coverage  0.0034613 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1505  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  45.18 
 
 
206 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000130364  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1925  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43 
 
 
207 aa  154  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4891  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.23 
 
 
216 aa  152  4e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2947  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.04 
 
 
212 aa  142  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1060  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.72 
 
 
244 aa  139  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.962837 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1318  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.72 
 
 
214 aa  139  3e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2153  transport protein TolQ-like  42.02 
 
 
474 aa  135  5e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.337835  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1521  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.17 
 
 
238 aa  126  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.565129  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.81 
 
 
576 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000125272  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0848  TolR-like transport protein  39.38 
 
 
470 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.638917  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1654  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.27 
 
 
480 aa  114  7.999999999999999e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.759397  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0746  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.64 
 
 
339 aa  114  8.999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1464  hypothetical protein  32.16 
 
 
229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0453  biopolymer transport proteins-like  39.09 
 
 
465 aa  111  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.204978  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11810  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.7 
 
 
216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2391  biopolymer transport protein  35.75 
 
 
234 aa  108  7.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0607  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.41 
 
 
478 aa  105  6e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00882438  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1721  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.68 
 
 
241 aa  105  6e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0001524  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0536  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.41 
 
 
209 aa  104  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.84 
 
 
209 aa  103  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.475045  hitchhiker  0.0000283851 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1169  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.96 
 
 
236 aa  101  7e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.435369  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0286  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.64 
 
 
212 aa  101  7e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.55 
 
 
233 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4034  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.55 
 
 
233 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.133642  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4177  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.55 
 
 
233 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.143236  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  30.15 
 
 
204 aa  99.8  2e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.372688 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6479  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.36 
 
 
237 aa  99.8  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.691155  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4648  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.47 
 
 
218 aa  99  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.388023  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3563  ATPase  32.99 
 
 
220 aa  97.8  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.363023  normal  0.586206 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0539  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.22 
 
 
222 aa  95.5  5e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.977509  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0149  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.66 
 
 
251 aa  95.1  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000197157  hitchhiker  0.00713803 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1438  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.43 
 
 
232 aa  95.1  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06640  putative biopolymer transport protein  29.21 
 
 
228 aa  95.1  7e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.304214  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0561  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.66 
 
 
199 aa  93.6  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.305166 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3131  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.44 
 
 
274 aa  92.8  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0548  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.05 
 
 
263 aa  92.8  3e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.477361  normal  0.119792 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0916  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.52 
 
 
200 aa  92.8  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.931657  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5938  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.78 
 
 
236 aa  92  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0262  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.77 
 
 
243 aa  91.7  7e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0861801  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1228  putative adventurous gliding motility protein R  30.65 
 
 
217 aa  91.3  8e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0258731  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0394  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.99 
 
 
229 aa  91.3  9e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.265292  hitchhiker  0.00010169 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2154  biopolymer transport protein (ExbB)-like  32.5 
 
 
208 aa  90.5  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2890  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.53 
 
 
257 aa  90.1  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000981257 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1976  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.05 
 
 
234 aa  89  4e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.254375  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02770  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  28.57 
 
 
246 aa  89.4  4e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0353  TonB system biopolymer transport component  31.58 
 
 
460 aa  89  5e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.899068  normal  0.349209 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2273  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  32.97 
 
 
230 aa  88.2  7e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1920  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.97 
 
 
230 aa  88.2  7e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00636  biopolymer transport protein  39.52 
 
 
453 aa  87.8  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001857  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  39.52 
 
 
453 aa  87.8  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3762  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.77 
 
 
268 aa  87  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.457209  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3975  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  32.47 
 
 
457 aa  86.7  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3807  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.84 
 
 
324 aa  86.7  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1865  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.53 
 
 
210 aa  87  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.646793 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3579  biopolymer transport protein  32.5 
 
 
234 aa  87  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.159406  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>