58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2503 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2503  hypothetical protein  100 
 
 		 264 aa  520  1e-147  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3753  RDD domain containing protein  58.85 
 
 		 285 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1397  membrane protein/domain-like protein  54.66 
 
 		 343 aa  211  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.309206 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3834  RDD domain containing protein  46.18 
 
 		 272 aa  194  1e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4051  RDD domain containing protein  49.79 
 
 		 288 aa  188  5.999999999999999e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20730  predicted membrane protein/domain  42.04 
 
 		 286 aa  184  9e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00769566  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5231  RDD domain-containing protein  47.74 
 
 		 262 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435963  normal  0.746138 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4952  RDD domain-containing protein  47.74 
 
 		 262 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4863  RDD domain-containing protein  47.74 
 
 		 262 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.964955  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2522  RDD domain containing protein  45.04 
 
 		 272 aa  174  9e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11329  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5459  RDD domain-containing protein  46.12 
 
 		 293 aa  168  8e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1836  RDD domain containing protein  41.91 
 
 		 268 aa  168  9e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1614  RDD domain-containing protein  45.72 
 
 		 323 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0215766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7601  RDD domain containing protein  42.34 
 
 		 327 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.202371  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1333  RDD domain-containing protein  45.78 
 
 		 280 aa  154  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.391018 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1271  RDD domain containing protein  42.28 
 
 		 266 aa  154  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000317829 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13726  hypothetical protein  42.72 
 
 		 310 aa  152  4e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0402342  normal  0.595615 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1201  RDD domain-containing protein  38.98 
 
 		 269 aa  149  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5849  RDD domain-containing protein  38.43 
 
 		 316 aa  149  6e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.273522 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3913  RDD domain-containing protein  41.94 
 
 		 269 aa  143  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0538103  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09260  predicted membrane protein/domain protein  42.08 
 
 		 272 aa  142  7e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.144214 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2339  RDD domain containing protein  40.08 
 
 		 282 aa  137  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0325969  hitchhiker  0.0000235215 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0755  RDD  40.15 
 
 		 340 aa  131  9e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.581888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4825  RDD domain containing protein  38.11 
 
 		 285 aa  101  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4809  RDD  33.48 
 
 		 261 aa  88.6  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000284972  normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3316  RDD domain-containing protein  38.89 
 
 		 241 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3843  RDD domain containing protein  40.54 
 
 		 229 aa  86.7  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4021  RDD  40.41 
 
 		 241 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.897049  normal  0.0584976 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4317  hypothetical protein  38.19 
 
 		 235 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3447  RDD domain-containing protein  30.56 
 
 		 254 aa  84.7  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1596  RDD domain-containing protein  33.33 
 
 		 258 aa  81.6  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38330  hypothetical protein  37.57 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0409  RDD  39.22 
 
 		 231 aa  79  0.00000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3579  RDD domain containing protein  29.63 
 
 		 265 aa  72.8  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000310569 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56100  hypothetical protein  38.19 
 
 		 265 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09288  putative transmembrane protein  30.13 
 
 		 237 aa  72  0.000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.875246  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4887  hypothetical protein  38.89 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.437888  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4266  RDD domain-containing protein  33.8 
 
 		 274 aa  65.5  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000560964  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4439  RDD  39.58 
 
 		 241 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.296549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0824  RDD domain containing protein  27.14 
 
 		 590 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0333571  normal  0.0552944 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3574  RDD domain containing protein  28.14 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.737424  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2132  hypothetical protein  26.32 
 
 		 238 aa  61.6  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4958  RDD domain containing protein  30 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000303152 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0232  RDD domain containing protein  27.88 
 
 		 247 aa  58.9  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1682  RDD domain containing protein  28.29 
 
 		 241 aa  51.2  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3078  hypothetical protein  36.9 
 
 		 406 aa  49.7  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0399  RDD domain-containing protein  30.37 
 
 		 278 aa  49.3  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0177068 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3069  RDD domain containing protein  31.65 
 
 		 150 aa  48.1  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1701  RDD domain containing protein  34.27 
 
 		 162 aa  48.1  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000482282  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3744  RDD domain containing protein  25.83 
 
 		 279 aa  48.1  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3129  RDD domain containing protein  29.24 
 
 		 304 aa  47.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.403499 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2675  RDD domain-containing protein  32.53 
 
 		 306 aa  46.6  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1745  RDD domain containing protein  28.86 
 
 		 151 aa  45.8  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1422  RDD domain-containing protein  28.95 
 
 		 257 aa  45.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176176  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4396  RDD  32.95 
 
 		 162 aa  44.3  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327978 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2233  RDD domain-containing protein  26.22 
 
 		 247 aa  44.3  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00562558  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3524  RDD domain-containing protein  36.62 
 
 		 165 aa  43.1  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.352555 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3079  RDD  27.27 
 
 		 137 aa  42  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.714918  normal  0.0142272 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>