More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_1719 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_1719  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
354 aa  716    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.219309  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0930  radical SAM family protein  51.26 
 
 
338 aa  339  4e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000118017  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1971  radical SAM domain-containing protein  49.58 
 
 
357 aa  330  2e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1689  radical SAM domain-containing protein  49.58 
 
 
357 aa  330  2e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0776794  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0688  Radical SAM domain protein  49.1 
 
 
336 aa  323  3e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0774  ELP3 component of the RNA polymerase II complex  44.03 
 
 
362 aa  315  6e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000160735  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0660  Radical SAM domain protein  51.39 
 
 
359 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.142353  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1501  radical SAM domain-containing protein  38.87 
 
 
341 aa  275  9e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.166226  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1160  Radical SAM domain protein  41.98 
 
 
341 aa  274  1.0000000000000001e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.276403  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3202  Radical SAM domain protein  39.87 
 
 
342 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00235958  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1061  Radical SAM domain protein  37.81 
 
 
343 aa  249  6e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8315700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2227  radical SAM domain-containing protein  36.44 
 
 
342 aa  248  8e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.775407  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2316  radical SAM family protein  37.11 
 
 
346 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1944  Radical SAM domain protein  36.06 
 
 
374 aa  239  6.999999999999999e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0450295  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3151  radical SAM domain-containing protein  39.18 
 
 
351 aa  238  1e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0207208  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1777  radical SAM domain-containing protein  37.99 
 
 
352 aa  233  3e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.112435  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1404  radical SAM protein, putative histone acetyltransferase  36.74 
 
 
345 aa  230  2e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000266579  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0875  radical SAM domain-containing protein  36.12 
 
 
359 aa  230  3e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1713  radical SAM domain-containing protein  40.15 
 
 
317 aa  203  4e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1179  radical SAM domain-containing protein  38.97 
 
 
314 aa  200  3e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1640  radical SAM domain-containing protein  41.22 
 
 
317 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2238  Radical SAM domain protein  30.99 
 
 
354 aa  192  1e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0787  radical SAM domain-containing protein  37.77 
 
 
317 aa  187  2e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2540  radical SAM domain-containing protein  32.34 
 
 
340 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.093156 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2966  Radical SAM domain protein  32.47 
 
 
344 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0294152  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0515  Elongator protein 3/MiaB/NifB  31.37 
 
 
309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.84475  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0182  Radical SAM domain protein  26.46 
 
 
401 aa  154  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.534223  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1562  Radical SAM domain protein  27.83 
 
 
401 aa  146  5e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1085  histone acetyltransferase, ELP3 family  29.25 
 
 
514 aa  106  6e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.707697  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0898  ELP3 family histone acetyltransferase  37.12 
 
 
512 aa  99.8  6e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.589047  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1460  histone acetyltransferase, ELP3 family  24.46 
 
 
473 aa  98.6  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0612  ELP3 family histone acetyltransferase  27.9 
 
 
459 aa  97.1  5e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.125099  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0586  ELP3 family histone acetyltransferase  27.47 
 
 
459 aa  96.3  7e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000912711  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0122  radical SAM domain-containing protein  23.38 
 
 
483 aa  94.7  2e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_551  radical SAM superfamily  27.9 
 
 
459 aa  94.7  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0398241  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0579  ELP3 family histone acetyltransferase  28.28 
 
 
527 aa  94.4  3e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0279  ELP3 family histone acetyltransferase  28.11 
 
 
563 aa  92.8  8e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1318  ELP3 family histone acetyltransferase  25.93 
 
 
510 aa  92.4  1e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.340377 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2046  ELP3 family histone acetyltransferase  28.99 
 
 
530 aa  91.7  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1167  radical SAM domain-containing protein  23.05 
 
 
469 aa  90.9  3e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.413437  normal  0.627812 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2190  coproporphyrinogen III oxidase  27.08 
 
 
480 aa  89.4  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0088  radical SAM domain-containing protein  22.3 
 
 
477 aa  89  1e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0202426 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1901  coproporphyrinogen III oxidase  27.08 
 
 
480 aa  88.2  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0952  histone acetyltransferase, ELP3 family  28.23 
 
 
526 aa  88.2  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1293  putative radical SAM protein  29.11 
 
 
341 aa  87.8  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0347  putative radical SAM protein  37.21 
 
 
293 aa  87.8  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1755  ELP3 family histone acetyltransferase  34.85 
 
 
547 aa  87.4  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.668163  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0824  ELP3 family histone acetyltransferase  31.06 
 
 
541 aa  87  4e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.318054  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1736  hypothetical protein  28.57 
 
 
317 aa  87  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1832  ELP3 family histone acetyltransferase  31.06 
 
 
541 aa  85.9  9e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1093  ELP3 family histone acetyltransferase  30.66 
 
 
541 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.108771  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2203  hypothetical protein  27.66 
 
 
314 aa  84.3  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1989  ELP3 family histone acetyltransferase  32.39 
 
 
548 aa  83.2  0.000000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11990  radical SAM protein, TIGR01212 family  30.93 
 
 
318 aa  83.2  0.000000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000013437  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0760  putative radical SAM protein  29.86 
 
 
304 aa  82.4  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.992819  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1956  ELP3 family histone acetyltransferase  34.15 
 
 
526 aa  81.3  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.724461 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2192  histone acetyltransferase, ELP3 family  33.33 
 
 
576 aa  80.9  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0586  radical SAM family protein  33.83 
 
 
319 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1480  histone acetyltransferase, ELP3 family  26.09 
 
 
585 aa  80.5  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.761791  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1133  ELP3 family histone acetyltransferase  31.34 
 
 
522 aa  80.5  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2706  histone acetyltransferase, ELP3 family  26.09 
 
 
553 aa  80.9  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0300  hypothetical protein  24.88 
 
 
309 aa  80.1  0.00000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.558235  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27329  predicted protein  28 
 
 
555 aa  80.1  0.00000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.072078  hitchhiker  0.00552121 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02294  histone acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06140)  28.74 
 
 
574 aa  79.7  0.00000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0872  histone acetyltransferase, ELP3 family  26.47 
 
 
556 aa  79.3  0.00000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1304  hypothetical protein  33.88 
 
 
520 aa  79.7  0.00000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2930  histone acetyltransferase, ELP3 family  30.3 
 
 
554 aa  79  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.281817  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0889  ELP3 family histone acetyltransferase  31.06 
 
 
541 aa  79.3  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2936  hypothetical protein  29.67 
 
 
319 aa  79  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.971153  hitchhiker  0.00000000000000717489 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0651  conserved hypothetical radical SAM protein  27.67 
 
 
318 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0804  putative radical SAM protein  28.85 
 
 
334 aa  79  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.768446  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0306  hypothetical protein  24.4 
 
 
309 aa  79.3  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.216797  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3790  hypothetical protein  25.47 
 
 
314 aa  78.2  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0994894  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3661  putative radical SAM protein  29.85 
 
 
319 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1358  putative radical SAM protein  26.45 
 
 
318 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.161503  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3655  putative radical SAM protein  25 
 
 
328 aa  77.8  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0760029 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3477  putative radical SAM protein  26.17 
 
 
313 aa  77.4  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.143192  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03076  predicted Fe-S oxidoreductase  24.53 
 
 
309 aa  76.6  0.0000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.709944  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0496  conserved hypothetical protein  24.53 
 
 
309 aa  76.6  0.0000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0489  putative radical SAM protein  24.53 
 
 
320 aa  76.6  0.0000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.577174 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4534  radical SAM protein, TIGR01212 family  24.53 
 
 
309 aa  76.6  0.0000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03027  hypothetical protein  24.53 
 
 
309 aa  76.6  0.0000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.828625  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3404  radical SAM family protein  24.53 
 
 
309 aa  76.6  0.0000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3699  radical SAM family protein  24.53 
 
 
309 aa  76.6  0.0000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00950  Pol II transcription elongation factor, putative  27.01 
 
 
557 aa  76.6  0.0000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.110026  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08040  histone acetyltransferase  29.28 
 
 
598 aa  75.5  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.584733  hitchhiker  0.0000000843356 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0260  conserved hypothetical radical SAM protein  23.61 
 
 
307 aa  75.9  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0739  radical SAM family protein  27.19 
 
 
332 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.974352  normal  0.805342 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_50848  predicted protein  33.09 
 
 
544 aa  75.9  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.104715  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3559  radical SAM protein, TIGR01212 family  25.38 
 
 
309 aa  75.1  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3632  hypothetical protein  24.06 
 
 
317 aa  74.7  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.197622  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3507  radical SAM family protein  24.06 
 
 
309 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42410  predicted protein  28.16 
 
 
558 aa  74.7  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4343  putative radical SAM protein  25 
 
 
312 aa  74.7  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.122173 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1179  radical SAM family protein  26.73 
 
 
332 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.808864  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0664  hypothetical protein  26.21 
 
 
318 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.08613e-26 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1137  putative radical SAM protein  23.04 
 
 
309 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00496914  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3134  hypothetical protein  24.02 
 
 
309 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000932261  normal  0.614838 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1177  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.08 
 
 
372 aa  73.6  0.000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0082  radical SAM family protein  27.19 
 
 
332 aa  73.9  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>