More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2200 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2200  F0F1 ATP synthase subunit delta  100 
 
 
182 aa  361  4e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.506317  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2620  F0F1 ATP synthase subunit delta  55.06 
 
 
184 aa  220  7e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2612  F0F1 ATP synthase subunit delta  56.07 
 
 
183 aa  208  4e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.279079  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3384  F0F1 ATP synthase subunit delta  54.49 
 
 
185 aa  207  7e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000127487  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2719  F0F1 ATP synthase subunit delta  54.49 
 
 
185 aa  207  7e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3337  ATP synthase F1 delta subunit  54.22 
 
 
184 aa  193  1e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.631562  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1491  F0F1 ATP synthase subunit delta  51.38 
 
 
185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154194  normal  0.935253 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0335  F0F1 ATP synthase subunit delta  47.4 
 
 
180 aa  149  2e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.584491  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15711  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.21 
 
 
182 aa  134  8e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.572565  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0487  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.88 
 
 
182 aa  129  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.298952  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04821  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.72 
 
 
182 aa  129  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18501  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.88 
 
 
182 aa  127  7.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0982  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.3 
 
 
182 aa  127  9.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1545  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.88 
 
 
180 aa  126  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2189  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.3 
 
 
182 aa  126  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16311  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.14 
 
 
180 aa  126  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16421  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.72 
 
 
180 aa  125  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16541  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.14 
 
 
180 aa  122  2e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.536377  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.42 
 
 
182 aa  114  6e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.58 
 
 
182 aa  106  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.54 
 
 
182 aa  105  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4038  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.14 
 
 
180 aa  101  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00667961 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.73 
 
 
180 aa  101  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0498007  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3739  ATP synthase F1, delta subunit  33.14 
 
 
182 aa  100  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2192  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.55 
 
 
183 aa  100  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3409  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.03 
 
 
180 aa  97.8  8e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0895663  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3173  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.18 
 
 
180 aa  97.1  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461622  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  31.03 
 
 
179 aa  96.3  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4498  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.5 
 
 
179 aa  96.7  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5158  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.53 
 
 
180 aa  96.3  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4991  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.53 
 
 
180 aa  96.3  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5008  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.53 
 
 
180 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5550  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.53 
 
 
180 aa  96.3  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0201793  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.18 
 
 
181 aa  96.3  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5399  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.53 
 
 
180 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.135919999999999e-51 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0603  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.76 
 
 
180 aa  96.3  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1504  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.76 
 
 
180 aa  96.3  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.164611  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3213  ATP synthase F1, delta subunit  29.88 
 
 
179 aa  95.9  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.167436 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1641  ATP synthase F1, delta subunit  32.93 
 
 
179 aa  94.7  7e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5433  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.53 
 
 
180 aa  94.4  9e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5430  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.53 
 
 
180 aa  94.4  9e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0101333  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5486  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.53 
 
 
180 aa  94.4  9e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.151912  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3944  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.91 
 
 
188 aa  93.6  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.754294  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1223  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.86 
 
 
186 aa  94  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2605  ATP synthase F1, delta subunit  30.9 
 
 
188 aa  93.6  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3363  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.33 
 
 
184 aa  92.8  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.19453  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3655  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.91 
 
 
188 aa  93.2  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5521  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.94 
 
 
180 aa  91.7  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000263908  hitchhiker  0.00000000000000110124 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5106  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.35 
 
 
180 aa  90.9  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61934  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0110  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.89 
 
 
180 aa  90.5  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4506  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.49 
 
 
179 aa  89.7  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3306  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.74 
 
 
178 aa  89  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00728321  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1462  ATP synthase F1, delta subunit  32.94 
 
 
194 aa  89  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47648  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2585  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.71 
 
 
183 aa  88.6  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0988  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.88 
 
 
183 aa  88.2  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0577519  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2185  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.32 
 
 
183 aa  88.2  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2381  ATP synthase F1, delta subunit  27.81 
 
 
178 aa  88.2  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0533596 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4487  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.94 
 
 
179 aa  88.2  6e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.94 
 
 
178 aa  88.2  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4621  ATP synthase F1, delta subunit  29.52 
 
 
176 aa  88.2  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2385  ATP synthase F1 delta subunit  28.99 
 
 
182 aa  88.2  6e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0395  ATP synthase F1, delta subunit  29.27 
 
 
182 aa  87.8  8e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2847  ATP synthase F1, delta subunit  31.95 
 
 
179 aa  87.4  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.187337 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0600  F0F1 ATP synthase subunit delta  30 
 
 
183 aa  85.9  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000223  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4260  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.18 
 
 
180 aa  85.9  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32540  F-ATPase family transporter: protons (chloroplast)  31.87 
 
 
217 aa  85.9  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.17293 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0221  ATP synthase F1, delta subunit  31.76 
 
 
190 aa  85.5  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2590  ATP synthase F1, delta subunit  30.81 
 
 
178 aa  85.1  5e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.570122  normal  0.0802262 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6065  ATP synthase F1, delta subunit  31.07 
 
 
179 aa  84.7  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3418  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.76 
 
 
178 aa  84.3  8e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4351  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.49 
 
 
193 aa  84.3  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3828  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.79 
 
 
180 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2165  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.19 
 
 
179 aa  83.6  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0429  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.41 
 
 
186 aa  83.2  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0131  ATP synthase F1, delta subunit  30.99 
 
 
185 aa  82.8  0.000000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0620  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.98 
 
 
184 aa  83.2  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1241  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.71 
 
 
182 aa  82.8  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2747  ATP synthase F1, delta subunit  29.89 
 
 
178 aa  82.4  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00491756  normal  0.287613 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2455  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.57 
 
 
179 aa  82.8  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0314  ATP synthase F1, delta subunit  29.24 
 
 
192 aa  82  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.240984  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0082  H+-transporting two-sector ATPase, delta(OSCP) subunit  29.71 
 
 
183 aa  82  0.000000000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7383  ATP synthase F1, delta subunit  28.49 
 
 
190 aa  81.6  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.705381  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6638  ATP synthase F1, delta subunit  29.61 
 
 
190 aa  81.6  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1028  ATP synthase F1, delta subunit  29.59 
 
 
173 aa  81.3  0.000000000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52190  F1 sector of membrane-bound ATP synthase, delta subunit  27.59 
 
 
178 aa  79.7  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3308  H(+)-transporting two-sector ATPase  28.49 
 
 
178 aa  80.1  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.276301  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4110  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.31 
 
 
193 aa  79.3  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2399  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.6 
 
 
190 aa  79.3  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0340  ATP synthase F1, delta subunit  28.65 
 
 
188 aa  78.6  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843718 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0533  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.41 
 
 
186 aa  79  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2828  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.55 
 
 
183 aa  79  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0059  ATP synthase F1, delta subunit  31.11 
 
 
177 aa  78.2  0.00000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2925  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.74 
 
 
188 aa  78.2  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2800  F-type H+-transporting ATP synthase, delta (OSCP) subunit  26.59 
 
 
178 aa  78.2  0.00000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31614  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0268  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.65 
 
 
186 aa  78.2  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4335  ATP synthase F1, delta subunit  30.72 
 
 
179 aa  78.2  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000408074  normal  0.759858 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1872  F0F1-type ATP synthase, delta subunit  28.99 
 
 
180 aa  78.2  0.00000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0177  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.82 
 
 
186 aa  77.8  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0556  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.41 
 
 
186 aa  77.8  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0174  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.82 
 
 
186 aa  77.4  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>