More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4439 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4439  porphobilinogen deaminase  100 
 
 		 311 aa  604  9.999999999999999e-173  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0549  Hydroxymethylbilane synthase  64.36 
 
 		 306 aa  361  8e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.503516  normal  0.484278 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0262  porphobilinogen deaminase  64.36 
 
 		 303 aa  361  9e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.207863  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4371  porphobilinogen deaminase  62.1 
 
 		 335 aa  348  8e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2732  porphobilinogen deaminase  63.69 
 
 		 320 aa  331  8e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4579  porphobilinogen deaminase  59.93 
 
 		 312 aa  316  3e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8325  porphobilinogen deaminase  57.43 
 
 		 317 aa  294  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.883441 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0357  porphobilinogen deaminase  56.73 
 
 		 322 aa  293  4e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0427  porphobilinogen deaminase  56.41 
 
 		 322 aa  290  2e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.751162  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0495  porphobilinogen deaminase  57.57 
 
 		 314 aa  290  2e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1544  porphobilinogen deaminase  55.88 
 
 		 305 aa  289  4e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.471062  normal  0.491282 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0677  porphobilinogen deaminase  54.02 
 
 		 314 aa  282  6.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0690  porphobilinogen deaminase  54.02 
 
 		 314 aa  282  6.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.118278 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0670  porphobilinogen deaminase  54.02 
 
 		 314 aa  281  7.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10521  porphobilinogen deaminase  54.84 
 
 		 309 aa  278  7e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1014  porphobilinogen deaminase  54.43 
 
 		 313 aa  273  3e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0827893  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02860  porphobilinogen deaminase  54.55 
 
 		 316 aa  271  1e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.302767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0845  porphobilinogen deaminase  53.9 
 
 		 312 aa  271  1e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.026448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0066  porphobilinogen deaminase  52.92 
 
 		 312 aa  268  8e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0447079  normal  0.735502 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6729  porphobilinogen deaminase  55.37 
 
 		 313 aa  268  1e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24400  hydroxymethylbilane synthase  51.65 
 
 		 358 aa  266  2.9999999999999995e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.485393  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0668  porphobilinogen deaminase  54.43 
 
 		 318 aa  263  2e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6130  porphobilinogen deaminase  50.45 
 
 		 354 aa  261  1e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.401748 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36050  hydroxymethylbilane synthase  52.55 
 
 		 312 aa  254  9e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000727024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3252  porphobilinogen deaminase  53.5 
 
 		 343 aa  250  3e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0180697  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0237  hydroxymethylbilane synthase  50.65 
 
 		 331 aa  247  2e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15190  porphobilinogen deaminase  47.22 
 
 		 377 aa  244  9.999999999999999e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.229707  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26790  hydroxymethylbilane synthase  50 
 
 		 337 aa  242  6e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0486  porphobilinogen deaminase  47.84 
 
 		 395 aa  239  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.471298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2492  porphobilinogen deaminase  53.99 
 
 		 344 aa  238  9e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0471431  normal  0.22632 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2489  porphobilinogen deaminase  51.99 
 
 		 332 aa  238  1e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100869 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0618  porphobilinogen deaminase  64.2 
 
 		 326 aa  238  1e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0490105 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4012  porphobilinogen deaminase  59.92 
 
 		 334 aa  233  2.0000000000000002e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.191711  normal  0.94998 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3437  porphobilinogen deaminase  54.12 
 
 		 342 aa  233  3e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000351099  decreased coverage  0.00118997 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3234  porphobilinogen deaminase  44.95 
 
 		 318 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00122468  normal  0.150053 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2767  porphobilinogen deaminase  49.69 
 
 		 332 aa  231  1e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00352178  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3285  porphobilinogen deaminase  44.37 
 
 		 318 aa  228  9e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3202  porphobilinogen deaminase  44.48 
 
 		 309 aa  228  1e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3548  porphobilinogen deaminase  46.28 
 
 		 300 aa  226  3e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0690  porphobilinogen deaminase  39.61 
 
 		 310 aa  226  4e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1363  porphobilinogen deaminase  46.41 
 
 		 314 aa  225  7e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1460  porphobilinogen deaminase  46.41 
 
 		 314 aa  225  7e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2492  porphobilinogen deaminase  45.75 
 
 		 314 aa  225  8e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39329  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2163  porphobilinogen deaminase  39.54 
 
 		 309 aa  225  9e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.138876  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0359  porphobilinogen deaminase  42.44 
 
 		 318 aa  224  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2563  porphobilinogen deaminase  43.14 
 
 		 311 aa  221  9e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0093  porphobilinogen deaminase  45.22 
 
 		 309 aa  221  9.999999999999999e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.779159  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0074  porphobilinogen deaminase  40.38 
 
 		 317 aa  220  3e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0487  porphobilinogen deaminase  43.14 
 
 		 313 aa  219  3.9999999999999997e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1124  porphobilinogen deaminase  40.19 
 
 		 311 aa  219  6e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.417261 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1427  porphobilinogen deaminase  40.97 
 
 		 313 aa  218  8.999999999999998e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1375  porphobilinogen deaminase  44.44 
 
 		 313 aa  217  2e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192689  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0408  porphobilinogen deaminase  41.8 
 
 		 318 aa  216  5e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1347  porphobilinogen deaminase  45.54 
 
 		 309 aa  214  9.999999999999999e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0893  porphobilinogen deaminase  40.65 
 
 		 313 aa  214  9.999999999999999e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0502  porphobilinogen deaminase  41.88 
 
 		 310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0502  porphobilinogen deaminase  45.54 
 
 		 312 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000513467  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0584  porphobilinogen deaminase  42.22 
 
 		 317 aa  212  4.9999999999999996e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.415079 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1715  porphobilinogen deaminase  51.2 
 
 		 315 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0408  porphobilinogen deaminase  41.16 
 
 		 318 aa  212  7e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0685  hydroxymethylbilane synthase  40.45 
 
 		 306 aa  212  7.999999999999999e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.161676  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1025  porphobilinogen deaminase  42.62 
 
 		 310 aa  210  2e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0857406  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3664  porphobilinogen deaminase  45.31 
 
 		 334 aa  209  4e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3202  porphobilinogen deaminase  45.34 
 
 		 318 aa  209  4e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0969809  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0652  porphobilinogen deaminase  41.23 
 
 		 309 aa  209  4e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0737  hydroxymethylbilane synthase  41.47 
 
 		 314 aa  209  4e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1273  porphobilinogen deaminase  42.68 
 
 		 315 aa  209  5e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0318  porphobilinogen deaminase  41.5 
 
 		 317 aa  208  8e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3090  porphobilinogen deaminase  44.95 
 
 		 331 aa  208  8e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3591  porphobilinogen deaminase  41.88 
 
 		 326 aa  208  1e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3642  porphobilinogen deaminase  39.94 
 
 		 310 aa  207  1e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3063  porphobilinogen deaminase  42.17 
 
 		 315 aa  207  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3375  porphobilinogen deaminase  42.3 
 
 		 310 aa  207  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1999  porphobilinogen deaminase  45.54 
 
 		 318 aa  207  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61051  decreased coverage  0.0000671123 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4551  porphobilinogen deaminase  40.78 
 
 		 309 aa  206  3e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4208  porphobilinogen deaminase  41.1 
 
 		 309 aa  206  3e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0373  porphobilinogen deaminase  41.78 
 
 		 310 aa  207  3e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3180  porphobilinogen deaminase  40.26 
 
 		 309 aa  206  3e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4582  porphobilinogen deaminase  40.58 
 
 		 309 aa  206  3e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4197  porphobilinogen deaminase  41.1 
 
 		 309 aa  206  5e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4309  porphobilinogen deaminase  40.58 
 
 		 309 aa  206  5e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4361  porphobilinogen deaminase  40.78 
 
 		 309 aa  206  6e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.448902  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4696  porphobilinogen deaminase  40.78 
 
 		 309 aa  206  6e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0388  porphobilinogen deaminase  42.11 
 
 		 315 aa  206  6e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.895145  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3060  porphobilinogen deaminase  40.89 
 
 		 351 aa  205  7e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0950  porphobilinogen deaminase  39.35 
 
 		 313 aa  205  7e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1796  porphobilinogen deaminase  39.03 
 
 		 313 aa  205  7e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.160972  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1515  porphobilinogen deaminase  39.68 
 
 		 313 aa  205  8e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1374  porphobilinogen deaminase  49.2 
 
 		 308 aa  205  9e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.212718  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4968  porphobilinogen deaminase  39.68 
 
 		 322 aa  205  9e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0044  porphobilinogen deaminase  39.68 
 
 		 321 aa  205  1e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1287  porphobilinogen deaminase  41.83 
 
 		 310 aa  204  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.909327  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2621  porphobilinogen deaminase  40.26 
 
 		 316 aa  204  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.995581  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4171  porphobilinogen deaminase  42.76 
 
 		 313 aa  203  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00534991  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4555  porphobilinogen deaminase  40.45 
 
 		 309 aa  202  4e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0767  porphobilinogen deaminase  39.81 
 
 		 311 aa  203  4e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0872  porphobilinogen deaminase  41.88 
 
 		 310 aa  203  4e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4600  porphobilinogen deaminase  40.45 
 
 		 309 aa  202  6e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2232  porphobilinogen deaminase  49.39 
 
 		 312 aa  202  6e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.495959  normal  0.0113482 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2170  porphobilinogen deaminase  39.67 
 
 		 307 aa  202  8e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.160302  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>