More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4323 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_29780  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  77.08 
 
 		 396 aa  646    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.573725 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1183  translation elongation factor Tu  81.61 
 
 		 397 aa  690    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.120688 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2661  translation elongation factor Tu  81.36 
 
 		 397 aa  682    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3925  elongation factor Tu  82.87 
 
 		 397 aa  663    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1119  translation elongation factor Tu  81.36 
 
 		 396 aa  646    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3466  translation elongation factor Tu  83.08 
 
 		 396 aa  691    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0246546  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10699  elongation factor Tu  82.37 
 
 		 396 aa  650    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2648  elongation factor Tu  90.18 
 
 		 397 aa  742    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.428976  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0625  translation elongation factor Tu  76.12 
 
 		 401 aa  640    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0685  elongation factor Tu  81.36 
 
 		 397 aa  659    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.731809 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20900  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  81.06 
 
 		 397 aa  690    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.191388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03960  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  82.87 
 
 		 397 aa  691    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0924  translation elongation factor Tu  85.89 
 
 		 397 aa  691    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0489446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3803  translation elongation factor Tu  80.35 
 
 		 396 aa  671    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.875507  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0580  elongation factor Tu  84.63 
 
 		 397 aa  686    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.700966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4317  elongation factor Tu  82.87 
 
 		 397 aa  664    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6051  elongation factor Tu  84.89 
 
 		 397 aa  674    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.198403  normal  0.396578 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2692  elongation factor Tu  77.89 
 
 		 396 aa  644    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.487048 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0560  translation elongation factor Tu  88.41 
 
 		 397 aa  703    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6616  translation elongation factor Tu  83.88 
 
 		 397 aa  687    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0987  elongation factor Tu  81.61 
 
 		 396 aa  660    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3145  elongation factor Tu  79.29 
 
 		 396 aa  662    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0585  translation elongation factor Tu  77.33 
 
 		 396 aa  655    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.344387  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2979  elongation factor Tu  77.64 
 
 		 396 aa  642    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.990994  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1084  elongation factor Tu  88.16 
 
 		 397 aa  698    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172914 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4509  translation elongation factor Tu  84.63 
 
 		 397 aa  684    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.936276  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0304  elongation factor Tu  86.65 
 
 		 397 aa  714    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273769 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1015  elongation factor Tu  81.61 
 
 		 396 aa  660    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.345465 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5075  elongation factor Tu  81.86 
 
 		 396 aa  664    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.602594  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4323  translation elongation factor Tu  100 
 
 		 397 aa  808    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3922  elongation factor Tu  85.89 
 
 		 397 aa  723    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1005  elongation factor Tu  81.61 
 
 		 396 aa  660    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1282  elongation factor Tu  81.61 
 
 		 396 aa  680    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0674069  normal  0.99115 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5122  translation elongation factor Tu  87.91 
 
 		 397 aa  727    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.821409 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  75.57 
 
 		 395 aa  629  1e-179  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23870  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  73.55 
 
 		 395 aa  621  1e-177  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08650  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  73.02 
 
 		 400 aa  615  1e-175  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000915749  hitchhiker  0.000000299529 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17200  elongation factor Tu  77.33 
 
 		 396 aa  611  9.999999999999999e-175  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.232418  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0238  elongation factor Tu  73.3 
 
 		 397 aa  612  9.999999999999999e-175  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000602877  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1048  elongation factor Tu  73.23 
 
 		 394 aa  609  1e-173  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000767064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1362  elongation factor Tu  73.68 
 
 		 396 aa  608  1e-173  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.641297 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1355  elongation factor Tu  74.69 
 
 		 396 aa  610  1e-173  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358693  normal  0.0503589 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2266  elongation factor Tu  73.43 
 
 		 396 aa  608  1e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2293  elongation factor Tu  73.43 
 
 		 396 aa  608  1e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.404032 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  73.43 
 
 		 396 aa  610  1e-173  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  73.43 
 
 		 396 aa  610  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  73.43 
 
 		 396 aa  610  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1224  elongation factor Tu  74.24 
 
 		 395 aa  610  1e-173  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000327734  unclonable  0.0000129395 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4684  elongation factor Tu  74.24 
 
 		 395 aa  610  1e-173  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000125263  normal  0.0270964 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2788  translation elongation factor Tu  73.75 
 
 		 397 aa  607  1e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  73.43 
 
 		 396 aa  610  1e-173  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0396  translation elongation factor Tu  76.83 
 
 		 395 aa  608  1e-173  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3669  elongation factor Tu  72.68 
 
 		 396 aa  604  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  73.13 
 
 		 400 aa  604  9.999999999999999e-173  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2171  translation elongation factor Tu  73.18 
 
 		 396 aa  605  9.999999999999999e-173  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  0.373473 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2776  translation elongation factor Tu  74.12 
 
 		 397 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105082  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3703  elongation factor Tu  72.68 
 
 		 396 aa  604  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3450  elongation factor Tu  73.18 
 
 		 396 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3186  elongation factor Tu  73.18 
 
 		 396 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3204  elongation factor Tu  73.18 
 
 		 396 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0185  elongation factor Tu  72.47 
 
 		 394 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000201579  hitchhiker  0.00891044 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0180  elongation factor Tu  72.47 
 
 		 394 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000449049  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0105  elongation factor Tu  75.57 
 
 		 395 aa  606  9.999999999999999e-173  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2183  translation elongation factor Tu  73.18 
 
 		 396 aa  605  9.999999999999999e-173  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.557033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0185  elongation factor Tu  72.47 
 
 		 394 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000202802  normal  0.069078 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0197  elongation factor Tu  72.47 
 
 		 394 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000214684  hitchhiker  0.0000000334083 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1059  elongation factor Tu  71.68 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0877336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2374  elongation factor Tu  71.68 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  73.75 
 
 		 397 aa  603  1.0000000000000001e-171  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2722  elongation factor Tu  72.68 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0752612  normal  0.841998 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  73.75 
 
 		 397 aa  603  1.0000000000000001e-171  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2734  elongation factor Tu  72.68 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102462 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2730  elongation factor Tu  74.38 
 
 		 400 aa  602  1.0000000000000001e-171  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0217  elongation factor Tu  72.47 
 
 		 394 aa  599  1e-170  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0229  elongation factor Tu  72.73 
 
 		 394 aa  598  1e-170  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0754  elongation factor Tu  72.5 
 
 		 396 aa  600  1e-170  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150197  normal  0.0210812 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2326  elongation factor Tu  70.93 
 
 		 396 aa  599  1e-170  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000632593  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2338  elongation factor Tu  70.93 
 
 		 396 aa  599  1e-170  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000797106  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0320  elongation factor Tu  71.64 
 
 		 399 aa  599  1e-170  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.716365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  72.43 
 
 		 396 aa  598  1e-170  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2462  elongation factor Tu  72.64 
 
 		 400 aa  600  1e-170  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0594726 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0742  elongation factor Tu  72.5 
 
 		 396 aa  600  1e-170  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1543  elongation factor Tu  72.68 
 
 		 396 aa  600  1e-170  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0109  elongation factor Tu  74.56 
 
 		 395 aa  600  1e-170  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000245051  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09710  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  75.56 
 
 		 400 aa  599  1e-170  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000220871  hitchhiker  0.00000138274 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2229  elongation factor Tu  72.43 
 
 		 396 aa  598  1e-170  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0152937 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0197  elongation factor Tu  72.73 
 
 		 394 aa  597  1e-170  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000553237  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0192  elongation factor Tu  72.73 
 
 		 394 aa  597  1e-170  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059163  decreased coverage  0.000414976 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1101  translation elongation factor Tu  77.58 
 
 		 398 aa  599  1e-170  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000113146  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3762  elongation factor Tu  72.18 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.000000000163409  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2634  elongation factor Tu  72.18 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000354854  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3778  elongation factor Tu  72.18 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3794  elongation factor Tu  72.18 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000750152  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3186  elongation factor Tu  72.18 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000468547  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3432  elongation factor Tu  71.93 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000234353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3445  elongation factor Tu  71.93 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000180875  normal  0.0858427 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0299  elongation factor Tu  72.18 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000130927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0312  elongation factor Tu  72.18 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000663244  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0051  elongation factor Tu  72.61 
 
 		 396 aa  596  1e-169  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000252436  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0039  elongation factor Tu  72.61 
 
 		 396 aa  596  1e-169  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.00000000135478  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>