74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4228 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4228  phage shock protein C, PspC  100 
 
 		 436 aa  835    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2584  hypothetical protein  33.33 
 
 		 469 aa  146  6e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1227  hypothetical protein  35.32 
 
 		 555 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.010904 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5231  phage shock protein C, PspC  32.47 
 
 		 474 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118703  hitchhiker  0.0028531 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3826  PspC domain-containing protein  31.25 
 
 		 445 aa  81.3  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4216  phage shock protein C, PspC  26.51 
 
 		 511 aa  74.3  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.041872  normal  0.0645369 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0654  phage shock protein C, PspC  25.68 
 
 		 464 aa  69.3  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.19259  normal  0.260983 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04800  putative stress-responsive transcriptional regulator  26.9 
 
 		 418 aa  68.9  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.975328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2935  phage shock protein C, PspC  45.16 
 
 		 71 aa  63.9  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000394883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6083  phage shock protein C, PspC  32.04 
 
 		 399 aa  60.8  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1660  phage shock protein C, PspC  36.75 
 
 		 127 aa  59.3  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3000  phage shock protein C, PspC  30.88 
 
 		 547 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0542  phage shock protein C, PspC  40 
 
 		 124 aa  57.8  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3366  phage shock protein C  36.49 
 
 		 127 aa  57.8  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3608  PspC domain-containing protein  40.66 
 
 		 419 aa  57.4  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4670  phage shock protein C, PspC  43.64 
 
 		 143 aa  57.4  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3130  phage shock protein C, PspC  45 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2822  phage shock protein C, PspC  44.44 
 
 		 97 aa  55.8  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0579  hypothetical protein  41.82 
 
 		 240 aa  55.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.702691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28340  putative stress-responsive transcriptional regulator  38.71 
 
 		 533 aa  55.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0709411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4227  putative signal transduction histidine kinase  44.26 
 
 		 394 aa  55.1  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9060  Putative stress-responsive transcriptional regulator protein-like protein  41.82 
 
 		 178 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1594  phage shock protein C, PspC  37.23 
 
 		 127 aa  54.7  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2855  putative stress-responsive transcriptional regulator  38.24 
 
 		 86 aa  54.3  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1926  phage shock protein C, PspC  40 
 
 		 174 aa  53.5  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000470088  unclonable  0.00000000972351 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1253  phage shock protein C, PspC  28.33 
 
 		 464 aa  53.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.21534  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2330  phage shock protein C, PspC  34.57 
 
 		 92 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4996  phage shock protein C, PspC  43.64 
 
 		 98 aa  50.4  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2350  phage shock protein C, PspC  41.07 
 
 		 194 aa  50.4  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0196  phage shock protein C, PspC  26.17 
 
 		 578 aa  50.4  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.695474  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0072  phage shock protein C, PspC  38.33 
 
 		 161 aa  50.4  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6527  phage shock protein C, PspC  40 
 
 		 417 aa  50.1  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.627165  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3932  phage shock protein C, PspC  41.43 
 
 		 96 aa  50.4  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.923929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0522  phage shock protein C, PspC  42.11 
 
 		 164 aa  50.1  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.854498  normal  0.422706 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5232  putative signal transduction histidine kinase  40.79 
 
 		 400 aa  50.4  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0452492  hitchhiker  0.00276259 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2843  phage shock protein C, PspC  37.93 
 
 		 68 aa  50.1  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000296758  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2312  phage shock protein C, PspC  35.14 
 
 		 76 aa  50.1  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4222  phage shock protein C, PspC  46.05 
 
 		 103 aa  49.7  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.155341  normal  0.0141639 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5725  putative signal transduction histidine kinase  45 
 
 		 398 aa  49.7  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4462  phage shock protein C, PspC  31.94 
 
 		 86 aa  48.9  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09558  hypothetical protein  28.75 
 
 		 582 aa  48.5  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.501669  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2712  phage shock protein C, PspC  27.78 
 
 		 512 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3205  phage shock protein C, PspC  50 
 
 		 96 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.236376 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4820  phage shock protein C, PspC  40.62 
 
 		 66 aa  48.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0822  stress-responsive transcriptional regulator  38.33 
 
 		 95 aa  48.1  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.55702  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1174  PspC domain-containing protein  38.33 
 
 		 82 aa  47.8  0.0004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1275  phage shock protein C, PspC  45.71 
 
 		 169 aa  47.4  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0715782  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0849  phage shock protein C, PspC  38.57 
 
 		 147 aa  47.4  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2455  phage shock protein C, PspC  41.3 
 
 		 81 aa  47  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.129612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2743  phage shock protein C, PspC  33.82 
 
 		 847 aa  46.6  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00338438  hitchhiker  0.000000294429 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4438  putative signal transduction histidine kinase  46.38 
 
 		 394 aa  46.6  0.0009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1735  PspC domain protein  43.64 
 
 		 445 aa  46.2  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1648  phage shock protein C, PspC  45.65 
 
 		 416 aa  46.6  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.530019  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0475  stress-responsive transcriptional regulator  33.9 
 
 		 61 aa  46.2  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0661  phage shock protein C, PspC  35.94 
 
 		 119 aa  45.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0783  phage shock protein C, PspC  38.38 
 
 		 601 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.626732 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2711  putative signal transduction histidine kinase  39.68 
 
 		 477 aa  45.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00959084 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17350  signal transduction histidine kinase  43.75 
 
 		 419 aa  45.1  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2882  phage shock protein C, PspC  46.67 
 
 		 114 aa  45.1  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.390226 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0621  phage shock protein C, PspC  31.15 
 
 		 86 aa  44.3  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3035  phage shock protein C, PspC  36.05 
 
 		 497 aa  44.7  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177773  hitchhiker  0.0028338 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2452  phage shock protein C, PspC  43.84 
 
 		 138 aa  44.3  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000523744  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3790  phage shock protein C, PspC  40 
 
 		 108 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.454801 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1228  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.51 
 
 		 404 aa  43.9  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.120133  hitchhiker  0.00954124 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4529  phage shock protein C, PspC  47.22 
 
 		 400 aa  43.9  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1319  phage shock protein C, PspC  38.1 
 
 		 165 aa  43.9  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0132  phage shock protein C, PspC  46.03 
 
 		 82 aa  43.9  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0723813  normal  0.142504 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0248  phage shock protein C, PspC  41.07 
 
 		 346 aa  43.5  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04810  signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 		 481 aa  43.5  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0912  phage shock protein C, PspC  40 
 
 		 85 aa  43.5  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3236  PspC domain protein  35.71 
 
 		 129 aa  43.5  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0450  phage shock protein C, PspC  38.16 
 
 		 84 aa  43.5  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1045  hypothetical protein  32.76 
 
 		 79 aa  43.1  0.009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1158  phage shock protein C, PspC  36.76 
 
 		 124 aa  43.1  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>