55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4051 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4051  RDD domain containing protein  100 
 
 		 288 aa  551  1e-156  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1397  membrane protein/domain-like protein  56.85 
 
 		 343 aa  223  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.309206 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3834  RDD domain containing protein  46.39 
 
 		 272 aa  199  5e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5231  RDD domain-containing protein  51.23 
 
 		 262 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435963  normal  0.746138 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4952  RDD domain-containing protein  51.23 
 
 		 262 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4863  RDD domain-containing protein  51.23 
 
 		 262 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.964955  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5459  RDD domain-containing protein  49.8 
 
 		 293 aa  195  6e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13726  hypothetical protein  51.46 
 
 		 310 aa  193  3e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0402342  normal  0.595615 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5849  RDD domain-containing protein  43.93 
 
 		 316 aa  187  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.273522 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1333  RDD domain-containing protein  50 
 
 		 280 aa  185  8e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.391018 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2503  hypothetical protein  50 
 
 		 264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0755  RDD  45.64 
 
 		 340 aa  181  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.581888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2522  RDD domain containing protein  45.83 
 
 		 272 aa  181  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11329  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3753  RDD domain containing protein  49.38 
 
 		 285 aa  180  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20730  predicted membrane protein/domain  42.97 
 
 		 286 aa  170  2e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00769566  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1201  RDD domain-containing protein  43.03 
 
 		 269 aa  169  4e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7601  RDD domain containing protein  44.98 
 
 		 327 aa  168  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.202371  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1614  RDD domain-containing protein  42.81 
 
 		 323 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0215766 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1836  RDD domain containing protein  40.24 
 
 		 268 aa  166  5e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2339  RDD domain containing protein  47.08 
 
 		 282 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0325969  hitchhiker  0.0000235215 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3913  RDD domain-containing protein  47.42 
 
 		 269 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0538103  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1271  RDD domain containing protein  44.09 
 
 		 266 aa  150  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000317829 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09260  predicted membrane protein/domain protein  43.01 
 
 		 272 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.144214 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4825  RDD domain containing protein  41.15 
 
 		 285 aa  118  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4809  RDD  34.94 
 
 		 261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000284972  normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1596  RDD domain-containing protein  33.46 
 
 		 258 aa  89.4  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0824  RDD domain containing protein  33.5 
 
 		 590 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0333571  normal  0.0552944 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4317  hypothetical protein  37.25 
 
 		 235 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3316  RDD domain-containing protein  36.36 
 
 		 241 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4021  RDD  34.64 
 
 		 241 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.897049  normal  0.0584976 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3843  RDD domain containing protein  40.14 
 
 		 229 aa  74.7  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0409  RDD  33.74 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4266  RDD domain-containing protein  32.89 
 
 		 274 aa  72.8  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000560964  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09288  putative transmembrane protein  29.53 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.875246  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3447  RDD domain-containing protein  32.27 
 
 		 254 aa  71.6  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38330  hypothetical protein  34.46 
 
 		 242 aa  67.4  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3579  RDD domain containing protein  29.46 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000310569 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56100  hypothetical protein  35.66 
 
 		 265 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2132  hypothetical protein  27.63 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4887  hypothetical protein  43.59 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.437888  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4439  RDD  40.96 
 
 		 241 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.296549  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3744  RDD domain containing protein  31.01 
 
 		 279 aa  55.8  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3574  RDD domain containing protein  29.8 
 
 		 255 aa  54.7  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.737424  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3129  RDD domain containing protein  30.81 
 
 		 304 aa  52  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.403499 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0232  RDD domain containing protein  24.51 
 
 		 247 aa  51.6  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3078  hypothetical protein  30.41 
 
 		 406 aa  51.2  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1682  RDD domain containing protein  27.33 
 
 		 241 aa  50.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0170  RDD domain-containing protein  31.58 
 
 		 145 aa  47.4  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000534855  decreased coverage  0.00967799 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0277  RDD domain containing protein  33.64 
 
 		 217 aa  47  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.666159  normal  0.0986894 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1681  RDD domain containing protein  30.84 
 
 		 156 aa  45.8  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3069  RDD domain containing protein  35.11 
 
 		 150 aa  44.7  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4958  RDD domain containing protein  34.15 
 
 		 231 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000303152 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2334  RDD domain containing protein  41.56 
 
 		 207 aa  44.3  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1157  RDD domain-containing protein  45.71 
 
 		 175 aa  44.3  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0015  RDD domain-containing protein  35.9 
 
 		 80 aa  43.1  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>