51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2368 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2368  peptidase C60 sortase A and B  100 
 
 
212 aa  412  1e-114  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00022706  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3604  peptidase C60, sortase A and B  49.5 
 
 
225 aa  177  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.126497 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0916  putative secreted protein  51.06 
 
 
188 aa  176  3e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.998693  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3534  peptidase C60, sortase A and B  48.74 
 
 
279 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3909  peptidase C60 sortase A and B  49.25 
 
 
279 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.985373 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0528  peptidase C60 sortase A and B  55.1 
 
 
368 aa  170  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0135812 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2482  peptidase C60 sortase A and B  63.69 
 
 
196 aa  169  4e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00306249  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3985  peptidase C60 sortase A and B  56.76 
 
 
223 aa  168  5e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.136335  hitchhiker  0.00273946 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1719  peptidase C60 sortase A and B  49.48 
 
 
203 aa  167  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.724245  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1734  peptidase C60, sortase A and B  55.29 
 
 
214 aa  162  3e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.841121 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3186  peptidase C60 sortase A and B  50.97 
 
 
245 aa  161  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0385448 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0613  peptidase C60 sortase A and B  55.03 
 
 
178 aa  158  6e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.405747  normal  0.507985 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7838  peptidase C60 sortase A and B  56.29 
 
 
946 aa  156  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0706316 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0530  peptidase C60 sortase A and B  54.11 
 
 
298 aa  155  6e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0197121 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1052  hypothetical protein  52 
 
 
291 aa  154  9e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.236232  hitchhiker  0.00758039 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1017  hypothetical protein  47.3 
 
 
284 aa  153  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1112  hypothetical protein  60.54 
 
 
192 aa  153  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773264  normal  0.429356 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0141  peptidase C60 sortase A and B  52.17 
 
 
216 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8256  peptidase C60 sortase A and B  47.03 
 
 
242 aa  152  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1460  peptidase C60, sortase A and B  55.56 
 
 
309 aa  152  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  decreased coverage  0.00772893 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3164  peptidase C60 sortase A and B  51.33 
 
 
208 aa  151  8.999999999999999e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0992718  hitchhiker  0.0000126147 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13180  sortase (surface protein transpeptidase)  50 
 
 
213 aa  150  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1145  hypothetical protein  42.55 
 
 
187 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.895027  normal  0.809068 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5005  peptidase C60 sortase A and B  54.11 
 
 
347 aa  145  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.387743  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1793  peptidase C60 sortase A and B  50.34 
 
 
276 aa  144  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000420005  normal  0.114453 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4117  peptidase C60 sortase A and B  54.42 
 
 
210 aa  141  8e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3574  peptidase C60 sortase A and B  47.95 
 
 
247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.560002  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3978  peptidase C60 sortase A and B  47.95 
 
 
247 aa  139  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107893  normal  0.372748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0428  peptidase C60 sortase A and B  47.68 
 
 
235 aa  138  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.992897  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5708  peptidase C60 sortase A and B  52.45 
 
 
167 aa  137  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.312966  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0348  peptidase C60, sortase A and B  50.34 
 
 
214 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0108508 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6891  hypothetical protein  45.25 
 
 
235 aa  132  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0157  peptidase C60 sortase A and B  47.1 
 
 
235 aa  128  8.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4659  peptidase C60 sortase A and B  45.45 
 
 
267 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0567  peptidase C60 sortase A and B  37.24 
 
 
321 aa  103  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4732  peptidase C60 sortase A and B  43.35 
 
 
202 aa  98.2  8e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3106  peptidase C60 sortase A and B  39.01 
 
 
226 aa  94.4  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.474444  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4206  peptidase C60, sortase A and B  41.5 
 
 
218 aa  91.7  8e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3472  peptidase C60 sortase A and B  37.5 
 
 
156 aa  89  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4636  peptidase C60 sortase A and B  39.19 
 
 
220 aa  86.7  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206736  normal  0.403037 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0141  peptidase C60, sortase A and B  39.86 
 
 
241 aa  83.6  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0474  peptidase C60 sortase A and B  36.76 
 
 
222 aa  79.3  0.00000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0221  peptidase C60, sortase A and B  35.37 
 
 
238 aa  72.8  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09850  sortase (surface protein transpeptidase)  32.41 
 
 
144 aa  68.9  0.00000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.618908  normal  0.0802521 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2061  peptidase C60 sortase A and B  34.01 
 
 
194 aa  60.8  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.244992  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0373  peptidase C60 sortase A and B  31.94 
 
 
243 aa  60.5  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.642022 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31940  sortase family enzyme  33.11 
 
 
260 aa  51.6  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0575864  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13700  sortase (surface protein transpeptidase)  31.03 
 
 
226 aa  48.9  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0695  peptidase C60 sortase A and B  31.25 
 
 
228 aa  48.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1131  peptidase C60 sortase A and B  30 
 
 
238 aa  44.7  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1772  peptidase C60 sortase A and B  27.78 
 
 
228 aa  44.7  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>