168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2054 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2054  copper resistance protein CopC  100 
 
 		 193 aa  376  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2571  conserved hypothetical protein containing Cu resistance protein-like domain  43.35 
 
 		 199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6378 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4979  hypothetical protein  41.71 
 
 		 198 aa  108  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5351  copper resistance protein CopC  41.22 
 
 		 226 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3714  copper resistance protein CopC  42.22 
 
 		 226 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1243  copper resistance protein CopC  30.88 
 
 		 206 aa  90.1  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565653  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2807  copper resistance protein CopC  39.55 
 
 		 229 aa  87.8  8e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5659  copper resistance protein CopC  36.81 
 
 		 223 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.531469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5386  copper resistance protein CopC  40.29 
 
 		 170 aa  84.3  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0298  Cu resistance protein CopC  40.52 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2636  cell wall anchor domain-containing protein  36.11 
 
 		 173 aa  84.3  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2591  copper resistance protein CopC  37.13 
 
 		 196 aa  81.3  0.000000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06090  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  41.91 
 
 		 233 aa  80.5  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0566  copper resistance protein CopC  34.85 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11740  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  37.3 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245018  normal  0.434498 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2794  copper resistance protein CopC  47.06 
 
 		 265 aa  78.2  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0197  copper resistance protein CopC  43 
 
 		 244 aa  77.8  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00600  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  32.32 
 
 		 197 aa  73.9  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.07291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5782  copper resistance protein CopC  32.85 
 
 		 869 aa  72.8  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3378  copper resistance protein CopC  32.51 
 
 		 284 aa  72.8  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0755618  hitchhiker  0.00467806 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4536  copper resistance protein CopC  39.02 
 
 		 189 aa  70.9  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.450196 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24410  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  31.32 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208823  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3270  copper resistance protein CopC  41.59 
 
 		 225 aa  68.2  0.00000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2789  copper resistance protein CopC  36.75 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0441468  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6847  conserved hypothetical protein of Cu resistance protein CopC-like protein  33.33 
 
 		 188 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4545  copper resistance protein CopC  37.07 
 
 		 241 aa  66.2  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2502  copper resistance protein CopC  35.86 
 
 		 226 aa  66.6  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.422344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2472  copper resistance protein CopC  41.44 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2163  copper resistance protein CopC  40.2 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.856375  normal  0.693909 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0115  copper resistance protein C  31.9 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0430  copper resistance protein CopC  37.5 
 
 		 160 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0550778  normal  0.772452 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1127  copper resistance protein CopC  33.61 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.035308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4271  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.153975 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1943  copper resistance protein CopC  35.04 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00257341 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2426  copper resistance D  36.08 
 
 		 539 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.441884  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1238  copper resistance protein CopC  37.39 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.669517  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4442  copper resistance protein CopC  38.18 
 
 		 424 aa  59.7  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6630  copper resistance protein CopC  37.72 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2038  copper resistance protein CopC  36.94 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2634  copper resistance protein CopC  29.79 
 
 		 173 aa  58.5  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3414  copper resistance protein CopC  36.28 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0468  copper resistance protein CopC  39.6 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  27.73 
 
 		 544 aa  58.2  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  27.73 
 
 		 544 aa  58.2  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3277  copper resistance protein CopC  34.21 
 
 		 528 aa  58.2  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6289  copper resistance protein CopC  36.59 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.202962 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  25.83 
 
 		 544 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3384  copper resistance protein CopC  36.28 
 
 		 121 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4983  copper resistance protein CopC  36.28 
 
 		 121 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1028  copper resistance protein CopC  30.77 
 
 		 184 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0204789 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2339  copper resistance protein CopC  35.04 
 
 		 128 aa  57.4  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.221588  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1623  copper resistance protein CopC  35.04 
 
 		 128 aa  57.4  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2437  copper resistance protein CopC  35.04 
 
 		 128 aa  57.4  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1275  copper resistance protein CopC  36.36 
 
 		 605 aa  57.4  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.453103  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5005  copper resistance protein CopC  34.67 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2321  copper resistance protein CopC  30.23 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.539083  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2761  copper resistance protein CopC  30.23 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.425917  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  33.9 
 
 		 565 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  33.9 
 
 		 564 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1500  copper resistance protein CopC  31.62 
 
 		 590 aa  56.2  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5304  copper resistance protein CopC  35.4 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.949952  normal  0.102582 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  28.7 
 
 		 549 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  25 
 
 		 549 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  29.2 
 
 		 547 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0602  copper resistance protein CopC  31.21 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000550062 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5008  copper resistance protein CopC  31.52 
 
 		 513 aa  55.5  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  26.98 
 
 		 547 aa  55.5  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  29.2 
 
 		 544 aa  55.1  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0445  copper resistance protein CopC  35.2 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0694  copper resistance protein CopC  35.4 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.57317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0652  putative copper resistance protein, CopC  34.51 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2340  copper resistance protein CopC  32.54 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273287  normal  0.896409 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2198  copper resistance D  33.68 
 
 		 519 aa  54.3  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4480  copper resistance protein CopC  37.82 
 
 		 632 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427384  normal  0.536935 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0419  copper resistance D domain-containing protein  36.97 
 
 		 576 aa  53.9  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.080355  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1067  copper resistance protein CopC  39 
 
 		 593 aa  53.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2762  copper resistance protein CopC  36.73 
 
 		 126 aa  53.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1957  copper resistance protein, putative  38 
 
 		 146 aa  53.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1122  copper resistance protein CopC  38.53 
 
 		 607 aa  53.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.747822 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2514  copper resistance protein CopC  33.65 
 
 		 120 aa  53.9  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  32.61 
 
 		 613 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  26.96 
 
 		 547 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3812  copper resistance protein CopC  29.75 
 
 		 124 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.994582  normal  0.824411 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1495  copper resistance protein CopC  32.17 
 
 		 126 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.594535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2011  hypothetical protein  38.14 
 
 		 126 aa  52.4  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3510  copper resistance protein CopC  36.21 
 
 		 172 aa  52.4  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1726  copper resistance protein CopC  28.72 
 
 		 207 aa  52.4  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.889834  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1160  copper resistance protein CopC  36.45 
 
 		 180 aa  52  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2170  copper resistance protein, putative  33.33 
 
 		 144 aa  51.6  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.117129  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4266  copper resistance protein CopC  33.06 
 
 		 203 aa  51.6  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0318139  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0716  putative copper resistance protein CopC  38.14 
 
 		 129 aa  52  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.180787  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0624  putative copper resistance protein CopC  38.14 
 
 		 129 aa  52  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.793575  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3575  copper resistance protein CopC  39.18 
 
 		 217 aa  52  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.310709  normal  0.0481479 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4567  copper resistance protein CopC  34.19 
 
 		 272 aa  52  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3446  copper resistance protein CopC  35.19 
 
 		 120 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5192  copper resistance protein CopC  36.73 
 
 		 131 aa  51.2  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3355  copper resistance protein CopC  35.71 
 
 		 139 aa  51.2  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4174  copper resistance protein CopC  33.96 
 
 		 559 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3531  copper resistance protein CopC  34.17 
 
 		 143 aa  50.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0355537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1388  copper resistance protein CopC  29.03 
 
 		 132 aa  50.8  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>