195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1789 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1789  ribonuclease BN  100 
 
 
300 aa  571  1.0000000000000001e-162  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00331025  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6692  membrane protein-like protein  56.21 
 
 
324 aa  276  4e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.291028 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2354  ribonuclease BN  47.52 
 
 
327 aa  260  2e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2813  ribonuclease BN  51.43 
 
 
336 aa  239  4e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.934919 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1249  ribonuclease BN  46.29 
 
 
360 aa  239  5e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00563624  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1887  hypothetical protein  49.82 
 
 
433 aa  229  4e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.321613  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1751  ribonuclease BN  49.82 
 
 
355 aa  215  9e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.807347  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3072  ribonuclease BN  48.12 
 
 
361 aa  213  2.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0634792 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3495  ribonuclease BN  45.19 
 
 
342 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.385493 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3555  ribonuclease BN  41.33 
 
 
354 aa  179  5.999999999999999e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.862191  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1501  ribonuclease BN  35.4 
 
 
431 aa  145  7.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.639318  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1038  ribonuclease BN  35.82 
 
 
355 aa  132  7.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2180  ribonuclease BN  32.42 
 
 
321 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.111198  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2226  ribonuclease BN  32.42 
 
 
321 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2169  ribonuclease BN  32.42 
 
 
321 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.000149157  hitchhiker  0.00191818 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24410  predicted membrane protein  34.77 
 
 
402 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12721  hypothetical protein  30.82 
 
 
324 aa  126  3e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.662031  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3945  ribonuclease BN  31.13 
 
 
323 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2241  ribonuclease BN  33.57 
 
 
426 aa  125  9e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2454  ribonuclease BN  32.57 
 
 
344 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.458983 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1838  ribonuclease BN  32.99 
 
 
404 aa  121  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0195892  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0518  ribonuclease BN  30.71 
 
 
298 aa  119  6e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3775  ribonuclease BN  30.99 
 
 
356 aa  116  6e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00242423  normal  0.45335 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19220  predicted membrane protein  29.49 
 
 
463 aa  106  6e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.234203  normal  0.518782 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0430  ribonuclease BN  34.1 
 
 
313 aa  100  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4597  ribonuclease BN, putative  30.45 
 
 
351 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144363  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  26.3 
 
 
341 aa  94.7  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2056  ribonuclease BN  29.69 
 
 
321 aa  92.4  9e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  27.1 
 
 
316 aa  87  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3781  ribonuclease BN  27.85 
 
 
321 aa  87  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  0.0277399 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6295  ribonuclease BN  30.85 
 
 
351 aa  85.9  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  26.09 
 
 
392 aa  84.3  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  27.43 
 
 
323 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  29.25 
 
 
328 aa  83.6  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  27.61 
 
 
386 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1249  ribonuclease BN, putative  29.03 
 
 
356 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474718  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0983  ribonuclease BN  25.98 
 
 
414 aa  81.3  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.460306 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2397  hypothetical protein  28.52 
 
 
352 aa  81.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2691  ribonuclease BN  26.79 
 
 
397 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2469  ribonuclease BN  26.79 
 
 
397 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  28.92 
 
 
299 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1062  ribonuclease BN  26.33 
 
 
386 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  29.58 
 
 
299 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4345  ribonuclease BN  28.62 
 
 
331 aa  79.3  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  24.33 
 
 
283 aa  79.3  0.00000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  27.08 
 
 
289 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  27.08 
 
 
289 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  27.08 
 
 
289 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  27.08 
 
 
289 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  27.69 
 
 
289 aa  79  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  27.08 
 
 
289 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2397  ribonuclease BN  27.44 
 
 
396 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3860  ribonuclease BN  26.27 
 
 
317 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  25.9 
 
 
328 aa  78.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  27.08 
 
 
289 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0145  ribonuclease BN  29.59 
 
 
367 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1440  ribonuclease BN  28.83 
 
 
317 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  26.91 
 
 
286 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4670  ribonuclease BN, putative  27.27 
 
 
296 aa  76.6  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.370784 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  25.39 
 
 
283 aa  76.6  0.0000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4560  ribonuclease BN, putative  28.51 
 
 
318 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  24.16 
 
 
320 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  23.9 
 
 
317 aa  75.9  0.0000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3778  ribonuclease BN  28.36 
 
 
348 aa  75.5  0.0000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541742  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1073  ribonuclease BN  26.62 
 
 
328 aa  75.5  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  26.52 
 
 
328 aa  75.5  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4067  ribonuclease BN  28.05 
 
 
319 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1329  putative ribonuclease BN  28.05 
 
 
318 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  25.09 
 
 
349 aa  74.7  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3110  ribonuclease BN  27.07 
 
 
347 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  27.69 
 
 
289 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  27.08 
 
 
288 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  27.08 
 
 
288 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1265  ribonuclease BN  27.68 
 
 
347 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1115  ribonuclease BN  27.68 
 
 
347 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3912  ribonuclease BN, putative  25.19 
 
 
386 aa  72.8  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561181  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0874  ribonuclease BN  26.12 
 
 
388 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0502515 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0800  ribonuclease BN  26.43 
 
 
386 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251545  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2132  ribonuclease BN  27 
 
 
375 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.066415  normal  0.616348 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0834  ribonuclease BN  26.12 
 
 
388 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1250  ribonuclease BN  25.36 
 
 
291 aa  72  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  29.05 
 
 
330 aa  72.4  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2060  ribonuclease BN, putative  26.69 
 
 
318 aa  71.6  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670045  normal  0.582678 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  25.29 
 
 
277 aa  70.5  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0318  putative ribonuclease BN  26.5 
 
 
322 aa  70.1  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5324  ribonuclease BN  30.19 
 
 
301 aa  69.3  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4751  putative ribonuclease BN  28.17 
 
 
330 aa  68.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.537612  hitchhiker  0.00670616 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1900  putative ribonuclease BN  28.25 
 
 
322 aa  68.6  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213292  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0345  ribonuclease BN  26.83 
 
 
334 aa  66.2  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1457  ribonuclease BN  29.59 
 
 
484 aa  65.1  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32910  Ribonuclease BN protein  26.87 
 
 
289 aa  65.1  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4297  ribonuclease BN, putative  24.29 
 
 
384 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0524586 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0138  putative ribonuclease BN  22.56 
 
 
371 aa  65.1  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.674179  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1198  putative ribonuclease BN  22.93 
 
 
322 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.405959  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0036  putative ribonuclease BN  26.13 
 
 
283 aa  65.5  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0251  ribonuclease BN  26.26 
 
 
333 aa  64.3  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4339  ribonuclease BN, putative  27.95 
 
 
350 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168174  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4425  putative ribonuclease BN  27.95 
 
 
350 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690543  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4719  putative ribonuclease BN  27.95 
 
 
350 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196963  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  24.01 
 
 
363 aa  64.3  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>