More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0543 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_0543  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 448 aa  867    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9059  hypothetical protein  63.07 
 
 		 431 aa  477  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3365  major facilitator superfamily protein  60.95 
 
 		 424 aa  473  1e-132  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2854  hypothetical protein  44.17 
 
 		 452 aa  312  6.999999999999999e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4460  major facilitator superfamily MFS_1  42.89 
 
 		 434 aa  273  6e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2956  major facilitator superfamily MFS_1  46.6 
 
 		 412 aa  264  3e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000194659 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2953  major facilitator superfamily MFS_1  44.58 
 
 		 413 aa  260  3e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0279289  hitchhiker  0.000525778 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0548  major facilitator superfamily MFS_1  40.62 
 
 		 419 aa  253  5.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.010876  decreased coverage  0.00150074 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2261  major facilitator superfamily MFS_1  49.86 
 
 		 399 aa  253  5.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0224254  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1534  major facilitator superfamily MFS_1  45.2 
 
 		 438 aa  246  6.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.565747  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0356  major facilitator superfamily MFS_1  41.84 
 
 		 407 aa  233  4.0000000000000004e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3537  major facilitator transporter  39.45 
 
 		 465 aa  228  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.833005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3912  major facilitator transporter  40.1 
 
 		 465 aa  226  8e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.31796 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4635  major facilitator superfamily MFS_1  34.99 
 
 		 437 aa  200  5e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.10393  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28870  arabinose efflux permease family protein  42.36 
 
 		 402 aa  199  9e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.447315 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4677  major facilitator transporter  40.38 
 
 		 425 aa  196  5.000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.126838  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0921  major facilitator transporter  38.73 
 
 		 442 aa  188  1e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4247  major facilitator transporter  41.15 
 
 		 421 aa  188  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.124967  normal  0.0481306 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2605  major facilitator superfamily MFS_1  37.16 
 
 		 407 aa  171  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000338843  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7935  hypothetical protein  41.36 
 
 		 396 aa  171  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4233  hypothetical protein  28.46 
 
 		 430 aa  94.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121217  normal  0.0238527 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  28.97 
 
 		 426 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  30.75 
 
 		 429 aa  83.6  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2302  major facilitator superfamily MFS_1  32.47 
 
 		 390 aa  83.2  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000026904  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1507  macrolide efflux protein  20.88 
 
 		 404 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.667551  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0637  protein of unknown function DUF894, DitE  26.92 
 
 		 536 aa  82.8  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.167725  normal  0.197731 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1538  major facilitator transporter  20.48 
 
 		 404 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756552  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  21.52 
 
 		 414 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  23.25 
 
 		 414 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8802  major facilitator superfamily MFS_1  30.51 
 
 		 405 aa  81.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.953446 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4605  major facilitator transporter  23.91 
 
 		 462 aa  81.6  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0763  major facilitator superfamily MFS_1  24.26 
 
 		 421 aa  80.9  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03951  hypothetical protein  22.74 
 
 		 432 aa  80.1  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1719  putative permease  20.39 
 
 		 404 aa  80.1  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  23.1 
 
 		 444 aa  79.7  0.00000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  21.19 
 
 		 417 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1498  macrolide efflux protein  22.94 
 
 		 404 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  24.55 
 
 		 397 aa  79.3  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  29.68 
 
 		 420 aa  79.7  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 432 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2122  major facilitator transporter  30.9 
 
 		 424 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  21.77 
 
 		 432 aa  78.2  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1533  permease  21.57 
 
 		 404 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1652  permease  21.57 
 
 		 404 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.608559  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  27.33 
 
 		 444 aa  77  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  23.53 
 
 		 390 aa  77  0.0000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  23.53 
 
 		 390 aa  77  0.0000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0842  protein of unknown function DUF894 DitE  26.23 
 
 		 586 aa  76.6  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0985  hypothetical protein  25.26 
 
 		 460 aa  76.6  0.0000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.309761  normal  0.0823053 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  25.63 
 
 		 420 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2780  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 423 aa  75.9  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.018642 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1892  transporter, putative  26.13 
 
 		 420 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166254  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0736  protein of unknown function DUF894, DitE  26.32 
 
 		 539 aa  73.6  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  26.06 
 
 		 410 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  25.38 
 
 		 420 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4269  major facilitator transporter  29.48 
 
 		 436 aa  73.2  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1928  major facilitator superfamily MFS_1  30.73 
 
 		 414 aa  73.2  0.000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0688885  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  25.13 
 
 		 420 aa  72  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2947  macrolide-efflux protein  23.81 
 
 		 419 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0495728  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  25.13 
 
 		 420 aa  72  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1932  major facilitator superfamily MFS_1  26.9 
 
 		 406 aa  71.6  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1940  putative transporter  25.63 
 
 		 420 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000531086  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3276  putative permease  23.81 
 
 		 419 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.550677  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3010  macrolide-efflux protein  23.81 
 
 		 419 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31240  putative nrbE-like protein  30.23 
 
 		 436 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011963  unclonable  4.15969e-22 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  26.26 
 
 		 408 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1147  major facilitator superfamily MFS_1  29.03 
 
 		 436 aa  71.2  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.114141  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3528  major facilitator superfamily MFS_1  22.07 
 
 		 482 aa  71.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  27.99 
 
 		 413 aa  70.5  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6215  major facilitator superfamily MFS_1  28.23 
 
 		 404 aa  70.5  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0532982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  29.66 
 
 		 451 aa  70.1  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3025  permease  23.81 
 
 		 419 aa  70.1  0.00000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2589  major facilitator superfamily MFS_1  22.07 
 
 		 482 aa  69.7  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0568188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3258  permease  23.81 
 
 		 419 aa  70.1  0.00000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3575  major facilitator superfamily MFS_1  28.36 
 
 		 416 aa  69.7  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1155  major facilitator superfamily MFS_1  25.46 
 
 		 399 aa  69.3  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.128986 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  23.58 
 
 		 433 aa  69.3  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36730  Major Facilitator Superfamily transporter  28.35 
 
 		 446 aa  69.7  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.298448 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  24.53 
 
 		 412 aa  69.7  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  22.5 
 
 		 409 aa  68.6  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3471  major facilitator transporter  23.76 
 
 		 419 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6327  major facilitator transporter  27.37 
 
 		 461 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.400788 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3270  permease, putative  23.32 
 
 		 419 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.719917  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  23.97 
 
 		 424 aa  68.2  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4092  protein of unknown function DUF894, DitE  26.4 
 
 		 519 aa  68.2  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1942  multidrug resistance protein; putative tetracycline resistance determinant  23.12 
 
 		 406 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0213e-35 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5656  major facilitator superfamily MFS_1  34.97 
 
 		 662 aa  67.8  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.346028 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3362  protein of unknown function DUF894 DitE  25.64 
 
 		 569 aa  67.8  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.394214  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4012  protein of unknown function DUF894, DitE  25.64 
 
 		 569 aa  67.8  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0135  major facilitator transporter  31.25 
 
 		 445 aa  67.4  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5125  protein of unknown function DUF894 DitE  25.89 
 
 		 542 aa  67  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3450  major facilitator superfamily MFS_1  25.46 
 
 		 499 aa  66.6  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033474 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1486  major facilitator transporter  26.89 
 
 		 420 aa  66.6  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.467645  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0479  major facilitator superfamily MFS_1  24.29 
 
 		 427 aa  66.6  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.742618 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1748  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  22.85 
 
 		 406 aa  65.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000069396  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0701  major facilitator superfamily MFS_1  22.62 
 
 		 423 aa  66.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  24.18 
 
 		 408 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1797  putative permease  20.97 
 
 		 379 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2643  major facilitator transporter  22.81 
 
 		 399 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.238963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1484  major facilitator transporter  23.76 
 
 		 406 aa  65.1  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.178978  normal  0.0348378 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>