More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3412 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_9143  DNA repair protein RadA  72.61 
 
 		 466 aa  683    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3412  DNA repair protein RadA  100 
 
 		 475 aa  931    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.176098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0603  DNA repair protein RadA  68.07 
 
 		 462 aa  575  1.0000000000000001e-163  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.981961  normal  0.107382 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4466  DNA repair protein RadA  63.83 
 
 		 468 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2711  DNA repair protein RadA  65.65 
 
 		 454 aa  548  1e-155  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0470  DNA repair protein RadA  64.38 
 
 		 472 aa  545  1e-154  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.435063  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24550  DNA repair protein RadA  61.24 
 
 		 461 aa  526  1e-148  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0360  DNA repair protein RadA  60.17 
 
 		 457 aa  525  1e-148  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0200  DNA repair protein RadA  65.07 
 
 		 457 aa  525  1e-148  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06880  DNA repair protein RadA  61.73 
 
 		 473 aa  524  1e-147  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0566  DNA repair protein RadA  65.19 
 
 		 473 aa  523  1e-147  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646319 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4999  DNA repair protein RadA  59.75 
 
 		 483 aa  520  1e-146  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.412289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0397  DNA repair protein RadA  58.37 
 
 		 498 aa  515  1.0000000000000001e-145  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01590  DNA repair protein RadA  63.74 
 
 		 478 aa  509  1e-143  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8361  DNA repair protein RadA  65.95 
 
 		 468 aa  508  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0493  DNA repair protein RadA  56.78 
 
 		 453 aa  509  1e-143  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.119863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35070  DNA repair protein RadA  64.61 
 
 		 454 aa  498  1e-140  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.876933  normal  0.773163 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0366  DNA repair protein RadA  62.97 
 
 		 462 aa  496  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18348  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0645  DNA repair protein RadA  61.66 
 
 		 449 aa  490  1e-137  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3279  DNA repair protein RadA  63.12 
 
 		 478 aa  483  1e-135  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491227  hitchhiker  0.00533763 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4258  DNA repair protein RadA  58.49 
 
 		 485 aa  481  1e-134  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1442  DNA repair protein RadA  54.04 
 
 		 467 aa  473  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.798431  normal  0.214735 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4699  DNA repair protein RadA  62.53 
 
 		 499 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0544491 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5342  DNA repair protein RadA  52.95 
 
 		 462 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4269  DNA repair protein RadA  62.21 
 
 		 481 aa  466  9.999999999999999e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.182746 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0968  DNA repair protein RadA  54.31 
 
 		 461 aa  456  1e-127  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000135308  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0359  DNA repair protein RadA  60.09 
 
 		 490 aa  453  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.596347  hitchhiker  0.00589399 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4828  DNA repair protein RadA  54.87 
 
 		 466 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.963187  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5128  DNA repair protein RadA  55.07 
 
 		 466 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.764257 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4742  DNA repair protein RadA  54.87 
 
 		 466 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0228  DNA repair protein RadA  60.28 
 
 		 460 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.745621 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0599  DNA repair protein RadA  57.21 
 
 		 461 aa  442  1e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.316853  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0150  DNA repair protein RadA  56.69 
 
 		 465 aa  439  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627247  normal  0.549694 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13618  DNA repair protein RadA  56.47 
 
 		 480 aa  434  1e-120  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.516493 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0864  DNA repair protein RadA  56.91 
 
 		 475 aa  424  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.493178 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1987  DNA repair protein RadA  49.31 
 
 		 453 aa  409  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0423  DNA repair protein RadA  52.12 
 
 		 448 aa  410  1e-113  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0293  DNA repair protein RadA  47.29 
 
 		 495 aa  405  1.0000000000000001e-112  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0917  DNA repair protein RadA  51.75 
 
 		 456 aa  407  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1747  DNA repair protein RadA  48.21 
 
 		 512 aa  403  1e-111  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0251  DNA repair protein RadA  50 
 
 		 462 aa  402  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0110  DNA repair protein RadA  44.44 
 
 		 454 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.242522  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1786  DNA repair protein RadA  43.4 
 
 		 454 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000301687  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0256  DNA repair protein RadA  46.5 
 
 		 457 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00319082  normal  0.307702 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4275  DNA repair protein RadA  45.7 
 
 		 455 aa  395  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.783093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5347  DNA repair protein RadA  50.94 
 
 		 458 aa  396  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2476  DNA repair protein RadA  50.83 
 
 		 458 aa  397  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0409258  hitchhiker  0.0000251063 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0130  DNA repair protein RadA  46.01 
 
 		 453 aa  395  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000766532  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2057  DNA repair protein RadA  50.47 
 
 		 458 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.168969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1245  DNA repair protein RadA  50.47 
 
 		 456 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.579553 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4640  DNA repair protein RadA  44.63 
 
 		 455 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0965  DNA repair protein RadA  52.49 
 
 		 450 aa  392  1e-108  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0756  DNA repair protein RadA  48.6 
 
 		 453 aa  393  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4885  DNA repair protein RadA  44.86 
 
 		 455 aa  394  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1311  DNA repair protein RadA  50.47 
 
 		 456 aa  393  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0994  DNA repair protein RadA  44.62 
 
 		 457 aa  394  1e-108  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3556  DNA repair protein RadA  50.71 
 
 		 457 aa  392  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1332  DNA repair protein RadA  50.71 
 
 		 453 aa  392  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.909582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1661  DNA repair protein RadA  50.59 
 
 		 458 aa  393  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0578663  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2038  DNA repair protein RadA  50.47 
 
 		 458 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0836  DNA repair protein RadA  43.24 
 
 		 457 aa  393  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0984957  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41070  DNA repair protein RadA  49.07 
 
 		 453 aa  390  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.51547  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1372  DNA repair protein RadA  50.71 
 
 		 456 aa  390  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5249  DNA repair protein RadA  48.36 
 
 		 453 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1401  DNA repair protein RadA  50.59 
 
 		 455 aa  391  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.227517  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6039  DNA repair protein RadA  50.23 
 
 		 458 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.667951  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1939  DNA repair protein RadA  50.47 
 
 		 458 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.763295 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0548  DNA repair protein RadA  42.62 
 
 		 454 aa  390  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0562  DNA repair protein RadA  42.62 
 
 		 454 aa  390  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2070  DNA repair protein RadA  50.47 
 
 		 458 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60990  DNA repair protein RadA  48.13 
 
 		 453 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1349  DNA repair protein RadA  49.53 
 
 		 458 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517323  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2077  DNA repair protein RadA  49.53 
 
 		 458 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0646051  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1574  DNA repair protein RadA  49.53 
 
 		 458 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.700761  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2274  DNA repair protein RadA  47.38 
 
 		 450 aa  388  1e-106  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2246  DNA repair protein RadA  47.14 
 
 		 450 aa  388  1e-106  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4638  DNA repair protein RadA  46.09 
 
 		 456 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.854791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0841  DNA repair protein RadA  48.6 
 
 		 457 aa  385  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2602  DNA repair protein RadA  49.53 
 
 		 458 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0200982  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2008  DNA repair protein RadA  49.77 
 
 		 458 aa  388  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.480875  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3235  DNA repair protein RadA  49.53 
 
 		 458 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.150478  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0794  DNA repair protein RadA  47.37 
 
 		 477 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2513  DNA repair protein RadA  49.53 
 
 		 458 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.167746  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1239  DNA repair protein RadA  49.53 
 
 		 458 aa  387  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.873439 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0422  DNA repair protein RadA  45.26 
 
 		 448 aa  387  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00757431  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0138  DNA repair protein RadA  49.65 
 
 		 475 aa  385  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.822754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2457  DNA repair protein RadA  49.53 
 
 		 458 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.108981  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02991  DNA repair protein RadA  44.37 
 
 		 455 aa  382  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0285  DNA repair protein RadA  47.41 
 
 		 450 aa  384  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0463822  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4644  DNA repair protein RadA  47.03 
 
 		 456 aa  385  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.592741 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2341  DNA repair protein RadA  48.94 
 
 		 453 aa  384  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4506  DNA repair protein RadA  47.03 
 
 		 456 aa  385  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1933  DNA repair protein RadA  51.42 
 
 		 471 aa  384  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.922552  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0827  DNA repair protein RadA  46.09 
 
 		 482 aa  382  1e-105  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0400  DNA repair protein RadA  46.59 
 
 		 450 aa  382  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000197198  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1358  DNA repair protein RadA  49.41 
 
 		 458 aa  385  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.156859  normal  0.874233 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1707  DNA repair protein RadA  46.06 
 
 		 453 aa  382  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0112208  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0263  DNA repair protein RadA  46.44 
 
 		 452 aa  383  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.992448  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0166  DNA repair protein RadA  42.62 
 
 		 457 aa  381  1e-104  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4298  DNA repair protein RadA  49.18 
 
 		 455 aa  380  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>