More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0159 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_3353  transketolase  66.06 
 
 		 664 aa  917    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.741116  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02356  transketolase 2, thiamin-binding  62.33 
 
 		 667 aa  862    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02765  transketolase 1, thiamin-binding  67.57 
 
 		 663 aa  949    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0759  transketolase  67.57 
 
 		 663 aa  949    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1205  transketolase  62.33 
 
 		 667 aa  862    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0644  transketolase  50.99 
 
 		 666 aa  668    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0678  transketolase  50.99 
 
 		 666 aa  668    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4965  transketolase  65.21 
 
 		 665 aa  913    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0192  transketolase  61.84 
 
 		 693 aa  842    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.123051 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3040  transketolase  66.42 
 
 		 670 aa  926    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0242601  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3046  transketolase  66.42 
 
 		 670 aa  928    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.590988  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3317  transketolase  68.16 
 
 		 675 aa  935    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2750  transketolase  67.02 
 
 		 675 aa  898    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18201  transketolase  49.17 
 
 		 668 aa  639    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3718  transketolase  50.15 
 
 		 666 aa  658    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000892016  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3872  transketolase  61.99 
 
 		 662 aa  862    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3341  transketolase  67.12 
 
 		 663 aa  931    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0470091 
 
 
-
 
NC_004310  BR1727  transketolase  52.34 
 
 		 663 aa  645    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.827271  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0930  transketolase  65.76 
 
 		 664 aa  905    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0385  transketolase  64.91 
 
 		 665 aa  911    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4585  transketolase  62.68 
 
 		 695 aa  857    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3470  transketolase  50 
 
 		 666 aa  651    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000202879  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1042  transketolase  62.69 
 
 		 668 aa  863    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3436  transketolase  49.85 
 
 		 666 aa  650    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116203  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0389  transketolase  68.16 
 
 		 690 aa  934    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3388  transketolase  49.85 
 
 		 666 aa  651    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000543798  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2469  transketolase  68.16 
 
 		 690 aa  934    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0154  transketolase  54.6 
 
 		 668 aa  759    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0139  transketolase  54.45 
 
 		 668 aa  759    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20621  transketolase  50.53 
 
 		 670 aa  650    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4792  transketolase  64.91 
 
 		 665 aa  914    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646987 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1617  transketolase  61.04 
 
 		 665 aa  836    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.804069 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3591  transketolase  67.72 
 
 		 668 aa  913    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0287801 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3626  transketolase  61.26 
 
 		 690 aa  849    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.560894  normal  0.611761 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1187  transketolase  50.23 
 
 		 670 aa  649    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0904971  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2841  transketolase  68.64 
 
 		 677 aa  936    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0159  transketolase  100 
 
 		 661 aa  1368    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2790  transketolase  60.83 
 
 		 692 aa  834    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3645  transketolase  54.68 
 
 		 670 aa  662    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3467  transketolase  68.31 
 
 		 690 aa  937    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2808  transketolase  65.36 
 
 		 665 aa  916    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000368556  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5267  transketolase  65.51 
 
 		 681 aa  909    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2759  transketolase  64.65 
 
 		 663 aa  890    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3722  transketolase  67.71 
 
 		 690 aa  925    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1635  transketolase  53.02 
 
 		 670 aa  658    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2960  transketolase  62.18 
 
 		 662 aa  863    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.986583 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0124  transketolase  50.83 
 
 		 669 aa  642    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0136213 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2631  transketolase  65.06 
 
 		 664 aa  872    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0244  transketolase  63.2 
 
 		 662 aa  863    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000179813  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0827  transketolase  65.31 
 
 		 664 aa  886    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000324946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3744  transketolase  50 
 
 		 666 aa  651    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152991  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1703  transketolase  48.87 
 
 		 668 aa  635    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0538  transketolase  55.3 
 
 		 668 aa  674    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0388  transketolase  72.05 
 
 		 671 aa  988    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0259  transketolase  65.28 
 
 		 680 aa  885    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.336202 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2405  transketolase  60.33 
 
 		 682 aa  810    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1195  transketolase  66.82 
 
 		 690 aa  898    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0949  transketolase  52.49 
 
 		 671 aa  667    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3040  transketolase  64.76 
 
 		 666 aa  895    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1968  transketolase  54.06 
 
 		 655 aa  674    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00341468  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4056  transketolase  61.83 
 
 		 681 aa  852    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1984  transketolase  65.86 
 
 		 693 aa  863    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4112  transketolase  60.82 
 
 		 693 aa  825    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0472  transketolase  64.06 
 
 		 667 aa  884    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0841196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2897  transketolase  50.53 
 
 		 673 aa  639    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.715416  normal  0.0202712 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0715  transketolase  62.61 
 
 		 664 aa  845    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.582031 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2249  transketolase  73.18 
 
 		 663 aa  1009    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0965691  hitchhiker  0.0000320127 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4349  transketolase  58.43 
 
 		 693 aa  818    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4827  transketolase  63.61 
 
 		 674 aa  861    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.827436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0565  transketolase  68.48 
 
 		 662 aa  932    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2448  transketolase  64.22 
 
 		 680 aa  893    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.574393 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1083  transketolase  64.86 
 
 		 664 aa  899    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000105408  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1052  transketolase  52.58 
 
 		 671 aa  666    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.25792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3959  transketolase  63.27 
 
 		 678 aa  856    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0353  transketolase  58.73 
 
 		 663 aa  798    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0384  transketolase  64.51 
 
 		 663 aa  896    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1249  transketolase  68.16 
 
 		 690 aa  934    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.47821  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1849  transketolase  60.88 
 
 		 665 aa  835    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.322822 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1513  transketolase  60.88 
 
 		 684 aa  848    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00869632  decreased coverage  0.000119249 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2980  transketolase  68.79 
 
 		 659 aa  936    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0075  transketolase  59.13 
 
 		 665 aa  834    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18031  transketolase  49.62 
 
 		 668 aa  640    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1320  transketolase  51.89 
 
 		 660 aa  639    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0155  transketolase  67.71 
 
 		 690 aa  925    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3468  transketolase  68.31 
 
 		 690 aa  937    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0227  transketolase  65.6 
 
 		 657 aa  913    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3330  transketolase  64.76 
 
 		 666 aa  902    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0024244  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0752  transketolase  64.46 
 
 		 664 aa  902    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0551  transketolase  65.86 
 
 		 662 aa  932    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0450  transketolase  53.92 
 
 		 672 aa  657    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0773  transketolase  66.37 
 
 		 664 aa  921    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0232346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3250  transketolase  66.21 
 
 		 664 aa  917    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.456833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2261  transketolase  62.16 
 
 		 666 aa  870    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2841  transketolase  62.41 
 
 		 665 aa  874    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0647  transketolase  64.25 
 
 		 680 aa  893    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000464673  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3431  transketolase  68.46 
 
 		 696 aa  937    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0538  transketolase  67.41 
 
 		 690 aa  928    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.242033  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07130  transketolase  65.06 
 
 		 665 aa  915    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0339  transketolase  63.32 
 
 		 667 aa  884    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0349  transketolase  50.38 
 
 		 658 aa  638    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>