More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1604 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_1604  putative transcription regulator protein  100 
 
 
144 aa  292  1e-78  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000436344  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3379  ferric uptake regulator, Fur family  35.56 
 
 
175 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3702  ferric uptake regulator, Fur family  35.04 
 
 
175 aa  81.6  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1467  transcriptional regulator, Fur family  35.51 
 
 
158 aa  79  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.225207  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1183  ferric uptake regulator, Fur family  35.51 
 
 
158 aa  79  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.837957 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0048  putative transcription regulator protein  33.8 
 
 
172 aa  75.5  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0128  ferric uptake regulator family protein  37.58 
 
 
169 aa  75.1  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.1335 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1930  ferric uptake regulator, Fur family  30.51 
 
 
144 aa  74.7  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2512  ferric uptake regulator family protein  31.62 
 
 
201 aa  72  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.450617  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3496  ferric uptake regulator, Fur family  34.53 
 
 
152 aa  72  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5541  ferric uptake regulator, Fur family  31.5 
 
 
138 aa  71.6  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.713771 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0164  putative transcription regulator protein  33.58 
 
 
172 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4566  Fur family transcriptional regulator protein  28.12 
 
 
136 aa  69.3  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1233  ferric uptake regulator family protein  35.43 
 
 
147 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0931  ferric uptake regulator family protein  26.92 
 
 
130 aa  67.8  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1959  putative ferric uptake regulator, Fur family  34.07 
 
 
161 aa  65.1  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0515  ferric uptake regulator, Fur family  24.14 
 
 
142 aa  64.7  0.0000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2211  ferric uptake regulator family protein  30.6 
 
 
150 aa  63.9  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.395667  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00840  zinc uptake transcriptional regulator, Fur family  32.41 
 
 
161 aa  62.4  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0718  ferric uptake regulator  30.2 
 
 
159 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00407056  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0593  ferric uptake regulator family protein  31.25 
 
 
145 aa  61.2  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.687838  hitchhiker  0.00515693 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0116  ferric uptake regulator, Fur family  34.29 
 
 
142 aa  61.2  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.241411 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72560  transcriptional regulator np20  31.94 
 
 
167 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.640017  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0488  ferric uptake regulator family protein  28.26 
 
 
163 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00616714  hitchhiker  0.00143129 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0533  ferric uptake regulator, Fur family  28.89 
 
 
141 aa  60.5  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6300  transcriptional regulator np20  32.21 
 
 
167 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0276  zinc uptake regulation protein, putative  31.25 
 
 
160 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4458  ferric uptake regulator family protein  31.65 
 
 
141 aa  58.9  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.342841  hitchhiker  0.00667855 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1460  ferric uptake regulator, Fur family  30.07 
 
 
161 aa  58.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5267  zinc uptake regulation protein, putative  30.56 
 
 
160 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0025  ferric uptake regulator family protein  30.66 
 
 
149 aa  58.2  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.344249  normal  0.157034 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0132  ferric-uptake regulator  27.42 
 
 
123 aa  57.8  0.00000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0060  zinc uptake regulation protein, putative  30.56 
 
 
160 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0584  ferric uptake regulator family protein  32.12 
 
 
149 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.274905  normal  0.220198 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0136  ferric uptake regulator family protein  29.17 
 
 
161 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7635  ferric uptake regulator family protein  30.08 
 
 
163 aa  56.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.585134 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5109  ferric uptake regulator family protein  28.47 
 
 
161 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.143994 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2623  ferric uptake regulator family protein  27.66 
 
 
153 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.195295  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4496  ferric uptake regulator family protein  28.57 
 
 
161 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1989  ferric uptake regulator family protein  27.66 
 
 
153 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0698  ferric uptake regulator family protein  27.66 
 
 
186 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.470229 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1195  ferric uptake regulator family protein  28.67 
 
 
162 aa  56.2  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.534314  normal  0.113542 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2599  ferric uptake regulator family protein  27.66 
 
 
153 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2788  putative zinc uptake regulation protein  26.03 
 
 
155 aa  55.5  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002343  zinc uptake regulation protein ZUR  28.86 
 
 
154 aa  55.1  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0747  ferric-uptake regulator  27.48 
 
 
152 aa  55.1  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0134  ferric uptake regulator family protein  29.86 
 
 
161 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74995  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1892  Fur family transcriptional regulator  26.87 
 
 
141 aa  55.1  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0119  FUR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
135 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.723813  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0292  ferric uptake regulator family protein  28.78 
 
 
174 aa  55.1  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0252498  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0546  ferric uptake regulator family protein  23.4 
 
 
139 aa  54.7  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1882  ferric uptake regulator family protein  28.78 
 
 
149 aa  55.1  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.161499  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0297  ferric uptake regulator family protein  26.03 
 
 
159 aa  54.7  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2145  ferric-uptake regulator  26.85 
 
 
164 aa  54.7  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0621  putative ferric uptake regulator, Fur family  27.54 
 
 
155 aa  54.7  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.776664  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2647  ferric uptake regulator family protein  26.95 
 
 
153 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3248  transcriptional regulator, TrmB  30.77 
 
 
164 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0836778  normal  0.597442 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2432  ferric uptake regulator, Fur family  32.09 
 
 
156 aa  54.7  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00932127  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5930  ferric uptake regulator family protein  26.95 
 
 
153 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1230  FUR family transcriptional regulator  25.87 
 
 
139 aa  54.7  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0757057  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2515  ferric uptake regulator family protein  26.95 
 
 
218 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.432858 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1420  FUR family transcriptional regulator  25.87 
 
 
139 aa  54.3  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0522352  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0170  ferric uptake regulator, Fur family  25.35 
 
 
139 aa  53.9  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  24.09 
 
 
145 aa  53.9  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1806  ferric uptake regulator family protein  31.82 
 
 
141 aa  53.9  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.696064  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2685  ferric uptake regulator family protein  24.09 
 
 
146 aa  53.5  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0992523 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3018  ferric uptake regulator, Fur family  29.41 
 
 
145 aa  53.5  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0481144  normal  0.294593 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2295  ferric uptake regulator family protein  25.18 
 
 
159 aa  53.5  0.0000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0489  ferric uptake regulator family protein  29.17 
 
 
167 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.574052  normal  0.122535 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11678  putative transcription regulator  23.88 
 
 
137 aa  53.5  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  26.32 
 
 
143 aa  53.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1301  ferric uptake regulator family protein  25.35 
 
 
166 aa  53.5  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0281675  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  26.32 
 
 
143 aa  53.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0650  ferric uptake regulator family protein  26.43 
 
 
144 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000137697  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1415  ferric uptake regulator family protein  30.22 
 
 
140 aa  52.4  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000000163802  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3054  ferric uptake regulator, Fur family  30.67 
 
 
157 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04330  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  28.71 
 
 
138 aa  52.8  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4099  ferric uptake regulator family protein  25.17 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1228  ferric uptake regulator family protein  28.57 
 
 
138 aa  52  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1732  zinc uptake regulation protein  27.07 
 
 
116 aa  51.6  0.000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2424  ferric-uptake regulator  31.85 
 
 
163 aa  51.6  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.688654  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00010  zinc uptake regulation protein  31.16 
 
 
161 aa  51.6  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0554  ferric uptake regulator, Fur family  30.37 
 
 
153 aa  51.6  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.028923  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0691  transcriptional regulator, putative  26.24 
 
 
216 aa  50.8  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3389  ferric uptake regulator family protein  31.88 
 
 
145 aa  51.2  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.261962  normal  0.0261677 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  26.28 
 
 
150 aa  51.2  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0867  FUR family transcriptional regulator  25.53 
 
 
154 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1562  ferric uptake regulator, Fur family  23.78 
 
 
147 aa  50.8  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  24.81 
 
 
153 aa  50.8  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1293  ferric uptake regulator family protein  25 
 
 
149 aa  50.4  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.998505  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0498  ferric uptake regulator, Fur family  25.71 
 
 
150 aa  50.8  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08960  ferric uptake regulator, Fur family  27.21 
 
 
134 aa  50.4  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1216  ferric uptake regulator, Fur family  28.67 
 
 
149 aa  50.4  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2188  transcriptional regulator Fur family  29.69 
 
 
133 aa  50.4  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0800466  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0627  FUR family transcriptional regulator  25.35 
 
 
154 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0075  FUR family transcriptional regulator  25.35 
 
 
154 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0871  FUR family transcriptional regulator  25.35 
 
 
154 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0329  transcriptional regulator, putative  25.35 
 
 
174 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0816853  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1064  ferric uptake regulator family protein  23.57 
 
 
152 aa  49.7  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193805  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1453  ferric uptake regulator, Fur family  28.57 
 
 
151 aa  49.7  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.023883  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>