77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1286 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1286  SNARE associated Golgi protein-related protein  100 
 
 		 194 aa  376  1e-103  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.453161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1434  SNARE associated Golgi protein  75.14 
 
 		 194 aa  263  1e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141401  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0548  SNARE associated Golgi protein-related protein  57.14 
 
 		 195 aa  223  2e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1822  SNARE associated Golgi protein  63.84 
 
 		 193 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  unclonable  0.00000000131488  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03725  membrane protein; member of the DedA of proteins  57.78 
 
 		 183 aa  210  1e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.241313  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1077  DedA family membrane protein  54.21 
 
 		 192 aa  202  3e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0791  hypothetical protein  58.56 
 
 		 193 aa  202  4e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.864721  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1827  hypothetical protein  55.03 
 
 		 193 aa  200  9.999999999999999e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1255  hypothetical protein  48.44 
 
 		 192 aa  189  2e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0889015  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1429  hypothetical protein  56.59 
 
 		 191 aa  189  2e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1501  lipoprotein B  44.85 
 
 		 191 aa  185  4e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0681914  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2964  DedA family  45.26 
 
 		 193 aa  151  4e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0479  DedA family protein  43.48 
 
 		 193 aa  145  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0757  DedA family protein  44.44 
 
 		 210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00163  lipoprotein  41.97 
 
 		 204 aa  141  5e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193393  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0868  DedA family  41.45 
 
 		 193 aa  141  7e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0371  hypothetical protein  49.7 
 
 		 192 aa  140  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0978  DedA family protein  41.49 
 
 		 193 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00254572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5187  DedA  41.58 
 
 		 193 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.936462  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2679  hypothetical protein  46.24 
 
 		 198 aa  138  6e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1280  SNARE associated Golgi protein  40.11 
 
 		 192 aa  136  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1460  hypothetical protein  41.21 
 
 		 204 aa  135  5e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3739  hypothetical protein  42.7 
 
 		 198 aa  135  5e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0861772  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3196  DedA family protein  53.85 
 
 		 200 aa  135  5e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.556536  normal  0.711097 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0048  DedA family protein  42.08 
 
 		 193 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2492  DedA family protein  46.15 
 
 		 192 aa  134  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0302048  normal  0.107524 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2076  hypothetical protein  40.23 
 
 		 195 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00198239  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0715  DedA family  41.36 
 
 		 205 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.628845  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1428  hypothetical protein  37.56 
 
 		 197 aa  131  6e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000050345  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0958  hypothetical protein  40.21 
 
 		 193 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.361291  normal  0.790222 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0203  SNARE associated Golgi protein  44.38 
 
 		 214 aa  129  3e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0699  DedA family  41.44 
 
 		 193 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1168  DedA family protein  47.65 
 
 		 192 aa  128  6e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0232351 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0725  DedA family protein  41.44 
 
 		 193 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0738  DedA family protein  41.44 
 
 		 193 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2300  hypothetical protein  45.4 
 
 		 187 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000215162  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1314  hypothetical protein  44.44 
 
 		 197 aa  122  3e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00346276  decreased coverage  0.000188073 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3116  hypothetical protein  38.32 
 
 		 215 aa  121  7e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0984  membrane-like protein  38.83 
 
 		 212 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.559705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5212  DedA family protein  44 
 
 		 193 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685047  normal  0.0291 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5957  DedA family protein  45.28 
 
 		 193 aa  117  9e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.597905  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72790  hypothetical protein  40.74 
 
 		 194 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1606  membrane protein-like protein  39.64 
 
 		 416 aa  115  3.9999999999999997e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1994  lipoprotein  37.81 
 
 		 204 aa  112  3e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1920  hypothetical protein  37.81 
 
 		 204 aa  112  3e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.817234  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0411  SNARE associated Golgi protein  40.57 
 
 		 195 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.100204 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04042  DedA family protein BAL199  29.38 
 
 		 195 aa  97.4  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3998  hypothetical protein  34.72 
 
 		 196 aa  97.1  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3844  putative transmembrane-associated alkaline phosphatase protein  32.64 
 
 		 196 aa  94.7  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.662096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3551  putative transmembrane-associated alkaline phosphatase protein  33.89 
 
 		 198 aa  92  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.846117  normal  0.490696 
 
 
-
 
NC_004310  BR1641  hypothetical protein  34.29 
 
 		 196 aa  92.4  4e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1589  hypothetical protein  34.29 
 
 		 222 aa  91.7  7e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.356457  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1274  hypothetical protein  33.68 
 
 		 196 aa  90.9  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2545  hypothetical protein  33.51 
 
 		 195 aa  89  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4083  hypothetical protein  28.66 
 
 		 190 aa  84  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0183  hypothetical protein  36.2 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0012  SNARE associated Golgi protein  38.93 
 
 		 159 aa  74.3  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.566831  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0156  SNARE associated Golgi protein  35.11 
 
 		 160 aa  64.7  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.461417  normal  0.0291058 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0716  hypothetical protein  34.35 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0653  hypothetical protein  32.95 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1746  SNARE associated Golgi protein  34.35 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.535585  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5727  SNARE associated Golgi protein-related protein  36.07 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3883  hypothetical protein  28.66 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.230327 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2588  SNARE associated Golgi protein  30.51 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2536  SNARE associated Golgi protein  30.51 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2075  DedA family protein  29.66 
 
 		 204 aa  48.5  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.190236  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0601  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.48 
 
 		 205 aa  46.6  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2807  SNARE associated Golgi protein-related protein  25 
 
 		 198 aa  46.6  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.034805  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0316  DedA family protein  29.01 
 
 		 207 aa  45.8  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.414992  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1084  DedA-like protein  26.25 
 
 		 201 aa  45.1  0.0006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.672419  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0260  alkaline phosphatase-like protein  25.81 
 
 		 202 aa  45.1  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.894036  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0310  DedA family protein  29.01 
 
 		 207 aa  44.7  0.0009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2940  hypothetical protein  26.92 
 
 		 143 aa  42.4  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4718  SNARE associated Golgi protein-like protein  26.82 
 
 		 207 aa  42.4  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.517829  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1089  SNARE associated Golgi protein  24.46 
 
 		 160 aa  41.6  0.008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1030  SNARE associated Golgi protein-like protein  28.46 
 
 		 203 aa  41.2  0.01  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1959  hypothetical protein  27.75 
 
 		 211 aa  41.2  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>