More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0999 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0999  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  100 
 
 		 574 aa  1092    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2661  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  49.91 
 
 		 556 aa  360  4e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1279  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  46.96 
 
 		 565 aa  292  9e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1023  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  48.59 
 
 		 555 aa  223  7e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.057602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1581  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  37.42 
 
 		 563 aa  197  6e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01540  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  37.69 
 
 		 587 aa  193  6e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1038  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  39.07 
 
 		 544 aa  188  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0466413 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0811  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  43.77 
 
 		 558 aa  182  1e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.65371  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0509  NADH dehydrogenase (quinone)  29.98 
 
 		 748 aa  159  9e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000352419  hitchhiker  0.0000000405513 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0918  NADH dehydrogenase (quinone)  30.71 
 
 		 559 aa  158  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0107  NADH dehydrogenase (quinone)  33 
 
 		 500 aa  157  7e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000249004 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4575  hydrogenase 4 subunit B  32.01 
 
 		 671 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0916  hydrogenase 4 subunit B  36.63 
 
 		 674 aa  122  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0135  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  27.85 
 
 		 513 aa  121  3e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.501467  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1398  NADH dehydrogenase (quinone)  34.71 
 
 		 498 aa  120  7e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0917  NADH dehydrogenase (quinone)  32.89 
 
 		 486 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.958268  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0778  NADH dehydrogenase (quinone)  39.53 
 
 		 682 aa  118  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.590886  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1280  NADH dehydrogenase (quinone)  31.81 
 
 		 499 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0379  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  33.33 
 
 		 605 aa  117  5e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.00000000000619684  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0845  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.35 
 
 		 698 aa  117  7.999999999999999e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.676363 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0892  NADH dehydrogenase (quinone)  30.74 
 
 		 669 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1691  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.31 
 
 		 688 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000143823  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2742  NADH dehydrogenase (quinone)  34.71 
 
 		 497 aa  114  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3795  NADH dehydrogenase (quinone)  37.06 
 
 		 666 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.789396  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4506  NADH dehydrogenase (quinone)  30.38 
 
 		 1265 aa  114  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.105233 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0969  NADH dehydrogenase (quinone)  33.11 
 
 		 1253 aa  114  5e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0218073 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0891  NADH dehydrogenase (quinone)  30.97 
 
 		 493 aa  112  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.158004  normal  0.070736 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1396  hydrogenase 4 subunit B  34.48 
 
 		 671 aa  111  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3712  NADH dehydrogenase (quinone)  36.71 
 
 		 666 aa  111  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.753561  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0703  NADH dehydrogenase (quinone)  28.11 
 
 		 662 aa  110  5e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.20305  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1000  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  30.21 
 
 		 507 aa  110  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.827251 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00940  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  30.72 
 
 		 672 aa  110  7.000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0812  NADH dehydrogenase (quinone)  31.53 
 
 		 503 aa  109  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.114491  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4288  NADH dehydrogenase (quinone)  31.52 
 
 		 637 aa  109  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277072  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3292  hydrogenase 4 subunit B  32.54 
 
 		 674 aa  109  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4066  NADH dehydrogenase (quinone)  32.29 
 
 		 669 aa  109  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0619804  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1142  hydrogenase 4 subunit B  34.81 
 
 		 748 aa  108  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.239539  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3194  NADH dehydrogenase (quinone)  31.55 
 
 		 1264 aa  108  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.466435 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3781  NADH dehydrogenase (quinone)  34.73 
 
 		 654 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0217094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0166  hydrogenase 4 subunit B  35.88 
 
 		 681 aa  108  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.970512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2967  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  29.4 
 
 		 501 aa  108  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37012 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2662  NADH dehydrogenase (quinone)  32.93 
 
 		 503 aa  108  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3666  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  29.57 
 
 		 492 aa  108  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.752681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2288  NADH dehydrogenase (quinone)  30.62 
 
 		 488 aa  108  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1399  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter MnhD subunit-like protein  33.45 
 
 		 437 aa  107  5e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2708  hydrogenase 4 subunit B  32.96 
 
 		 679 aa  107  5e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1285  hydrogenase 4 subunit B  32.55 
 
 		 673 aa  107  6e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.488809  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0929  hydrogenase 4 subunit B  35.79 
 
 		 687 aa  107  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4671  hydrogenase 4 subunit B  35.47 
 
 		 674 aa  107  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.130495 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1248  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  27.86 
 
 		 534 aa  107  7e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.130648  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0315  NADH dehydrogenase (quinone)  30.79 
 
 		 674 aa  107  7e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.39787  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3954  NADH dehydrogenase (quinone)  30.96 
 
 		 497 aa  107  8e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14770  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  33.44 
 
 		 510 aa  106  9e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.18278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3654  NADH dehydrogenase (quinone)  36.01 
 
 		 665 aa  106  9e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01299  NADH dehydrogenase subunit M  30.05 
 
 		 491 aa  106  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.648189  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1880  NADH dehydrogenase (quinone)  33.67 
 
 		 1245 aa  106  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.374238  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1194  hydrogenase 4 subunit B  33.73 
 
 		 672 aa  106  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3953  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.56 
 
 		 492 aa  106  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1914  L-alanyl-D-glutamate peptidase  28.9 
 
 		 655 aa  106  1e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02374  NADH dehydrogenase subunit N  33.33 
 
 		 672 aa  105  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3704  hydrogenase 4 subunit B  33.33 
 
 		 672 aa  105  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.726938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1001  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.39 
 
 		 494 aa  105  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.629716 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3855  hydrogenase 4 subunit B  36.33 
 
 		 672 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02336  hypothetical protein  33.33 
 
 		 672 aa  105  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1187  NADH dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 		 672 aa  105  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1420  NADH dehydrogenase (quinone)  32.77 
 
 		 1265 aa  105  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2629  hydrogenase 4 subunit B  33.33 
 
 		 672 aa  105  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1307  NADH dehydrogenase (quinone)  31.62 
 
 		 633 aa  105  3e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0720  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  26.45 
 
 		 504 aa  105  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.362005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2191  hydrogenase 4 subunit B  31.11 
 
 		 673 aa  104  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.660892 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6065  hydrogenase 4 subunit B  31.68 
 
 		 669 aa  103  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388772  hitchhiker  0.000500664 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2966  NADH dehydrogenase (quinone)  29.61 
 
 		 501 aa  103  9e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.278298 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0252  NADH dehydrogenase subunit M  29.88 
 
 		 501 aa  103  1e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1205  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.99 
 
 		 471 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.425489  normal  0.0100074 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3948  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  30.95 
 
 		 545 aa  102  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.147624 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01550  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  28.86 
 
 		 505 aa  102  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.739929 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1540  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.6 
 
 		 540 aa  102  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.010926 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1473  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  26.23 
 
 		 480 aa  101  3e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.38482 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0188  NADH dehydrogenase (quinone)  30.75 
 
 		 737 aa  102  3e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2460  NADH dehydrogenase (quinone)  32.67 
 
 		 683 aa  100  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2761  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  25.22 
 
 		 484 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1260  hydrogenase 4 subunit B  36.21 
 
 		 672 aa  100  7e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0751084 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1127  hydrogenase membrane subunit  31.06 
 
 		 649 aa  100  7e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0224903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35440  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  29.35 
 
 		 540 aa  100  7e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.708783 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3667  NADH dehydrogenase (quinone)  30.77 
 
 		 496 aa  100  7e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3692  NADH dehydrogenase (quinone)  27.27 
 
 		 500 aa  100  8e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0669  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  28.02 
 
 		 538 aa  100  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0281  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  26.93 
 
 		 800 aa  99.8  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.305042  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1791  ATP-binding protein  29.82 
 
 		 655 aa  100  1e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0608774  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0329  hydrogenase 4 subunit B  34.88 
 
 		 669 aa  99.8  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3869  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  30.03 
 
 		 599 aa  99.8  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2093  NADH dehydrogenase (quinone)  27.46 
 
 		 501 aa  99.8  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.156897  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0070  NADH dehydrogenase (quinone)  33.1 
 
 		 667 aa  99.8  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2474  hydrogenase 4 subunit B  33.56 
 
 		 669 aa  100  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3285  NADH dehydrogenase (quinone)  31.19 
 
 		 496 aa  99  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0676667  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2616  NADH dehydrogenase (quinone)  31.01 
 
 		 577 aa  99  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0943  NADH dehydrogenase (quinone)  31.2 
 
 		 723 aa  99.4  2e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.730208  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1615  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  26.05 
 
 		 485 aa  99.4  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.619005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0281  NADH dehydrogenase subunit M  29.59 
 
 		 501 aa  99  2e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.540456  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0184  NADH dehydrogenase (quinone)  31.54 
 
 		 487 aa  99.4  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>