More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1615 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3543  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  67.29 
 
 
480 aa  649    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.229766  normal  0.874469 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4787  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  69.18 
 
 
475 aa  651    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2571  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  69.29 
 
 
483 aa  660    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3341  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  73.5 
 
 
484 aa  723    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.115126  normal  0.467258 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2761  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  73.08 
 
 
484 aa  719    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1615  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  100 
 
 
485 aa  966    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.619005  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1473  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  64.51 
 
 
480 aa  612  9.999999999999999e-175  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.38482 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1638  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  38.6 
 
 
452 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1711  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  36.8 
 
 
452 aa  217  4e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1163  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter MnhD subunit-like  30.63 
 
 
507 aa  157  6e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.63442  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0805  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.54 
 
 
401 aa  127  5e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0580  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  29.75 
 
 
476 aa  115  1.0000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.817185  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1281  NADH dehydrogenase (quinone)  28.31 
 
 
493 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0320  NADH dehydrogenase (quinone)  30.41 
 
 
531 aa  114  5e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12060  NADH dehydrogenase I subunit L  29.45 
 
 
506 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000252399  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18950  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  25.45 
 
 
543 aa  111  3e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0107  NADH dehydrogenase (quinone)  26.29 
 
 
500 aa  111  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000249004 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2663  NADH dehydrogenase (quinone)  29.39 
 
 
479 aa  108  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0918  NADH dehydrogenase (quinone)  28.48 
 
 
559 aa  108  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0164  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  24 
 
 
538 aa  107  6e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0742  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  24.38 
 
 
538 aa  106  8e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.778742 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0135  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  24.85 
 
 
513 aa  104  3e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.501467  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05170  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  28.17 
 
 
521 aa  103  5e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0509  NADH dehydrogenase (quinone)  28.23 
 
 
748 aa  103  5e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000352419  hitchhiker  0.0000000405513 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0496  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  24.12 
 
 
565 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0681  NADH dehydrogenase (quinone)  30.03 
 
 
584 aa  102  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.389184 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1431  NADH dehydrogenase (quinone)  29.33 
 
 
498 aa  102  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.352854  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16780  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  24.55 
 
 
525 aa  101  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.234078  normal  0.0837109 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0508  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  27.19 
 
 
499 aa  101  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000163951  hitchhiker  0.000000287422 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0791  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  27.67 
 
 
661 aa  101  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0188  NADH dehydrogenase (quinone)  30.66 
 
 
737 aa  101  3e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0349  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit D4  25.06 
 
 
506 aa  100  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224429  normal  0.680492 
 
 
-
 
NC_002936  DET1575  hydrogenase membrane subunit  28.3 
 
 
617 aa  100  7e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1397  NADH dehydrogenase (quinone)  31.91 
 
 
501 aa  99.8  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2161  NADH dehydrogenase (quinone)  28.24 
 
 
501 aa  99.8  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0669  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  24.01 
 
 
538 aa  98.6  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3658  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  25.15 
 
 
562 aa  99  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3871  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  25.15 
 
 
539 aa  98.6  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4892  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  25.23 
 
 
552 aa  98.2  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.405552  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0380  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  26.6 
 
 
472 aa  97.8  4e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000595488  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0706  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase family protein  25.43 
 
 
458 aa  97.8  4e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.409683  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5212  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  27.32 
 
 
523 aa  97.4  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0000590255  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0348  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  26.3 
 
 
547 aa  97.1  6e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0328119  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0574  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  25 
 
 
535 aa  97.1  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3948  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  25.9 
 
 
545 aa  97.1  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.147624 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1771  NADH dehydrogenase (quinone)  28.06 
 
 
500 aa  96.7  8e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1127  hydrogenase membrane subunit  29.13 
 
 
649 aa  96.7  9e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0224903  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00940  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  28.1 
 
 
672 aa  95.9  1e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2586  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  25.33 
 
 
522 aa  96.3  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1123  putative NADH dehydrogenase  28.7 
 
 
498 aa  95.9  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0103051  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0584  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  24.72 
 
 
535 aa  96.3  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2460  NADH dehydrogenase (quinone)  25.9 
 
 
683 aa  96.3  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0596  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  24.72 
 
 
535 aa  96.3  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.395006 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0077  NADH dehydrogenase (quinone)  26.28 
 
 
500 aa  95.5  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2525  NADH dehydrogenase (quinone)  25.88 
 
 
505 aa  95.9  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1110  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  28.03 
 
 
512 aa  95.5  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6653  Na(+)/H(+) antiporter subunit D  24.85 
 
 
529 aa  95.5  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0867  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  25.99 
 
 
519 aa  95.5  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.335998  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3534  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  28.82 
 
 
532 aa  95.5  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.336988 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0284  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit M  24.53 
 
 
517 aa  95.1  3e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000106102 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2882  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit M  24.18 
 
 
534 aa  94.7  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.139376  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0044  NADH dehydrogenase (quinone)  23.64 
 
 
525 aa  94.4  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.33239 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0128  hydrogenase-4 component F  25 
 
 
491 aa  94  5e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.223921  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35440  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  24.93 
 
 
540 aa  93.6  6e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.708783 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2708  hydrogenase 4 subunit B  26.96 
 
 
679 aa  93.6  6e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1285  hydrogenase 4 subunit B  26.93 
 
 
673 aa  93.6  7e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.488809  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1194  hydrogenase 4 subunit B  30.41 
 
 
672 aa  93.6  7e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1911  hypothetical protein  26.91 
 
 
493 aa  93.6  8e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.262508  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0980  NADH dehydrogenase (quinone)  26.43 
 
 
502 aa  93.2  9e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.723018  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02374  NADH dehydrogenase subunit N  30.09 
 
 
672 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0511  NADH ubiquinone/plastoquinone complex subunit, putative  27.9 
 
 
488 aa  92.8  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02336  hypothetical protein  30.09 
 
 
672 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3704  hydrogenase 4 subunit B  28.02 
 
 
672 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.726938  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2629  hydrogenase 4 subunit B  30.09 
 
 
672 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14770  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  28.01 
 
 
510 aa  92.4  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.18278  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1187  NADH dehydrogenase (quinone)  30.09 
 
 
672 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2858  NADH dehydrogenase (quinone)  26.72 
 
 
504 aa  92  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.356875  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2099  NADH dehydrogenase (quinone)  26.39 
 
 
498 aa  92.4  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.805314  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3185  NADH dehydrogenase (quinone)  27.34 
 
 
552 aa  92  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3692  NADH dehydrogenase (quinone)  28 
 
 
500 aa  91.7  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1038  hydrogenase-4 component F  25.38 
 
 
491 aa  92.4  2e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000418597  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1136  NADH dehydrogenase (quinone)  26.64 
 
 
476 aa  92  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5537  NADH dehydrogenase subunit L  27.52 
 
 
620 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0906168 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1581  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  30.36 
 
 
563 aa  91.7  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0589  NADH dehydrogenase (quinone)  28.42 
 
 
473 aa  91.3  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0519  NADH dehydrogenase (quinone)  29.2 
 
 
476 aa  90.9  4e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2191  hydrogenase 4 subunit B  29.93 
 
 
673 aa  90.9  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.660892 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0731  quinone dependent NADH dehydrogenase  27.27 
 
 
511 aa  90.5  7e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.156813  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1160  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  27.22 
 
 
495 aa  90.1  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2437  NADH dehydrogenase (quinone)  24.23 
 
 
530 aa  90.1  8e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.366515 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2456  NADH dehydrogenase (quinone)  28.06 
 
 
662 aa  89.7  9e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0192367  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2093  NADH dehydrogenase (quinone)  25.5 
 
 
501 aa  89.7  9e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.156897  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0751  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  26.77 
 
 
501 aa  89.7  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00659406  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3886  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  25.93 
 
 
560 aa  89.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.590668 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0877  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  27.34 
 
 
517 aa  89.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0349434  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0751  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  27.99 
 
 
768 aa  89.4  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.75438  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0943  NADH dehydrogenase (quinone)  27.05 
 
 
723 aa  89.7  1e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.730208  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1599  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  26.09 
 
 
762 aa  89.4  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.85135  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000416  Na(+) H(+) antiporter subunit D  27.76 
 
 
498 aa  89.7  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3836  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  25.93 
 
 
560 aa  89.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>