More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1638 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_1638  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  100 
 
 
452 aa  885    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1711  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  88.94 
 
 
452 aa  748    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4787  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  36.1 
 
 
475 aa  224  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1615  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  38.6 
 
 
485 aa  222  9.999999999999999e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.619005  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1473  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  34.19 
 
 
480 aa  218  2e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.38482 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2761  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  34.38 
 
 
484 aa  212  9e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3341  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  34.7 
 
 
484 aa  212  9e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.115126  normal  0.467258 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3543  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  33.48 
 
 
480 aa  209  6e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.229766  normal  0.874469 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2571  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  35.92 
 
 
483 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0805  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  37.5 
 
 
401 aa  178  1e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0580  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  33.33 
 
 
476 aa  165  2.0000000000000002e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.817185  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1163  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter MnhD subunit-like  30.23 
 
 
507 aa  150  4e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.63442  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1635  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.89 
 
 
502 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.193581  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2525  NADH dehydrogenase (quinone)  31.4 
 
 
505 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0135  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  28.82 
 
 
513 aa  120  6e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.501467  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0121  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.84 
 
 
491 aa  119  9.999999999999999e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1107  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.58 
 
 
488 aa  118  1.9999999999999998e-25  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.980044  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0706  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase family protein  29.43 
 
 
458 aa  116  8.999999999999998e-25  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.409683  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2286  NADH dehydrogenase (quinone)  31.58 
 
 
437 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1281  NADH dehydrogenase (quinone)  31.4 
 
 
493 aa  114  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2663  NADH dehydrogenase (quinone)  31.07 
 
 
479 aa  113  6e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0589  NADH dehydrogenase (quinone)  29.93 
 
 
473 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0179  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.43 
 
 
491 aa  111  3e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.490475  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0107  NADH dehydrogenase (quinone)  26.93 
 
 
500 aa  111  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000249004 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0320  NADH dehydrogenase (quinone)  29.82 
 
 
531 aa  109  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2967  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  28.61 
 
 
501 aa  106  8e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.37012 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1001  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.07 
 
 
494 aa  103  6e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.629716 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0574  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  29.76 
 
 
535 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3948  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  27.13 
 
 
545 aa  102  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.147624 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3666  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  29.85 
 
 
492 aa  102  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.752681  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2099  NADH dehydrogenase (quinone)  27.41 
 
 
498 aa  102  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.805314  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0584  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  29.37 
 
 
535 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12060  NADH dehydrogenase I subunit L  28.53 
 
 
506 aa  101  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000252399  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0596  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  29.37 
 
 
535 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.395006 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0380  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  27.74 
 
 
472 aa  100  4e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000595488  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2161  NADH dehydrogenase (quinone)  30.94 
 
 
501 aa  100  5e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3953  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  27.82 
 
 
492 aa  99.8  9e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3284  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  28.41 
 
 
492 aa  99.8  9e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.141551  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0918  NADH dehydrogenase (quinone)  27.78 
 
 
559 aa  99.8  9e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0844  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  28.73 
 
 
548 aa  98.6  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.639175  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1397  NADH dehydrogenase (quinone)  31.6 
 
 
501 aa  98.6  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0890  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  28.67 
 
 
507 aa  98.6  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.50733  normal  0.143167 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1771  NADH dehydrogenase (quinone)  26.36 
 
 
500 aa  99  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0751  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  29.32 
 
 
501 aa  99  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00659406  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0875  hydrogenase subunit F  28.08 
 
 
482 aa  97.8  3e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00115046 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2456  NADH dehydrogenase (quinone)  27.3 
 
 
662 aa  98.2  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0192367  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0742  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  29.55 
 
 
538 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.778742 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1205  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  28.69 
 
 
471 aa  97.4  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.425489  normal  0.0100074 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0703  NADH dehydrogenase (quinone)  32.28 
 
 
662 aa  97.4  5e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.20305  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0508  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  26.1 
 
 
499 aa  97.1  6e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000163951  hitchhiker  0.000000287422 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0164  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  29.15 
 
 
538 aa  97.1  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0917  NADH dehydrogenase (quinone)  27.11 
 
 
486 aa  96.7  7e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.958268  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3658  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  29.75 
 
 
562 aa  96.7  7e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3530  NADH dehydrogenase (quinone)  29.13 
 
 
470 aa  96.7  7e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0563  NADH dehydrogenase (quinone)  29.31 
 
 
539 aa  96.3  9e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.850315  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0980  NADH dehydrogenase (quinone)  30.36 
 
 
502 aa  95.9  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.723018  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18950  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  27.33 
 
 
543 aa  95.9  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1607  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  30.03 
 
 
466 aa  95.5  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.410462  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2863  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.06 
 
 
498 aa  95.1  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.845476  normal  0.745609 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2093  NADH dehydrogenase (quinone)  28.64 
 
 
501 aa  95.1  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.156897  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3871  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  27.27 
 
 
539 aa  95.5  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1781  hydrogenase subunit F  27.5 
 
 
482 aa  95.5  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0877  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  28.47 
 
 
517 aa  94.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0349434  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1003  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.62 
 
 
517 aa  94.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00150473  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3692  NADH dehydrogenase (quinone)  29.09 
 
 
500 aa  94.4  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1042  hydrogenase subunit F  27.53 
 
 
482 aa  94  5e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1123  putative NADH dehydrogenase  29.28 
 
 
498 aa  94  5e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0103051  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3447  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  29.52 
 
 
541 aa  94  5e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.209361  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1742  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  29.97 
 
 
457 aa  94  5e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3221  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  28.36 
 
 
500 aa  93.6  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0486  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  26.99 
 
 
535 aa  93.6  6e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1138  NADH dehydrogenase (quinone)  27.2 
 
 
470 aa  93.6  7e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2858  NADH dehydrogenase (quinone)  27.59 
 
 
504 aa  93.2  9e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.356875  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0077  NADH dehydrogenase (quinone)  27.08 
 
 
500 aa  92.8  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1688  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  28.29 
 
 
495 aa  92.8  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.565022  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0916  hydrogenase 4 subunit B  27.06 
 
 
674 aa  92.4  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0669  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  28.92 
 
 
538 aa  92.4  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6065  hydrogenase 4 subunit B  27.43 
 
 
669 aa  92.4  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388772  hitchhiker  0.000500664 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4285  NADH dehydrogenase (quinone)  27.97 
 
 
499 aa  92  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.14859  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3394  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  28.48 
 
 
485 aa  92.4  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3716  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  28.13 
 
 
559 aa  91.7  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5153  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  26.39 
 
 
548 aa  92  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.939463  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3984  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  25.59 
 
 
503 aa  91.3  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1772  Na(+)/H(+) antiporter subunit D  27.96 
 
 
499 aa  91.3  3e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3534  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  30.42 
 
 
532 aa  90.9  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.336988 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000416  Na(+) H(+) antiporter subunit D  29.81 
 
 
498 aa  90.9  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0610  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.4 
 
 
520 aa  90.9  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01560  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  30.77 
 
 
493 aa  90.5  6e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0044  NADH dehydrogenase (quinone)  25.53 
 
 
525 aa  90.5  6e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.33239 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5103  NADH dehydrogenase (quinone)  30.77 
 
 
584 aa  90.1  7e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0509  NADH dehydrogenase (quinone)  27.49 
 
 
748 aa  90.1  7e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000352419  hitchhiker  0.0000000405513 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2882  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit M  28.43 
 
 
534 aa  90.1  8e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.139376  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1136  NADH dehydrogenase (quinone)  25.44 
 
 
476 aa  90.1  8e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1420  NADH dehydrogenase (quinone)  27.27 
 
 
1265 aa  89  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30370  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 4 (chain M)  27.73 
 
 
470 aa  89.4  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.515319 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0816  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  29.23 
 
 
497 aa  89.7  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0641  NADH dehydrogenase (quinone)  30.77 
 
 
463 aa  89.4  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1636  NADH dehydrogenase (quinone)  30.77 
 
 
463 aa  89.4  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3180  NADH dehydrogenase (quinone)  30.77 
 
 
463 aa  89.4  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1629  NADH dehydrogenase (quinone)  32.08 
 
 
476 aa  89.7  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.22379  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>