More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0844 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0844  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  100 
 
 
548 aa  1053    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.639175  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3447  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  46.73 
 
 
541 aa  426  1e-118  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.209361  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5153  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  46.67 
 
 
548 aa  425  1e-117  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.939463  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2863  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  49.77 
 
 
498 aa  369  1e-101  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.845476  normal  0.745609 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2967  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  37.22 
 
 
501 aa  271  2.9999999999999997e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.37012 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3666  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  35.06 
 
 
492 aa  263  4e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.752681  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0890  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  36.69 
 
 
507 aa  260  5.0000000000000005e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.50733  normal  0.143167 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2161  NADH dehydrogenase (quinone)  40 
 
 
501 aa  259  1e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3953  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  34.38 
 
 
492 aa  253  7e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3284  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  34.61 
 
 
492 aa  243  5e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.141551  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1107  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.25 
 
 
488 aa  242  2e-62  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.980044  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0791  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  34.04 
 
 
496 aa  228  3e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1635  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  36.95 
 
 
502 aa  227  5.0000000000000005e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.193581  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2286  NADH dehydrogenase (quinone)  38.3 
 
 
437 aa  227  5.0000000000000005e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0179  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  29.77 
 
 
491 aa  218  2e-55  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.490475  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0121  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  29.67 
 
 
491 aa  211  2e-53  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0917  NADH dehydrogenase (quinone)  32.06 
 
 
486 aa  203  7e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.958268  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0508  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  30.13 
 
 
499 aa  202  9.999999999999999e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000163951  hitchhiker  0.000000287422 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0107  NADH dehydrogenase (quinone)  30.28 
 
 
500 aa  197  3e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000249004 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4892  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  30.45 
 
 
552 aa  194  5e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.405552  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0496  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.27 
 
 
565 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1281  NADH dehydrogenase (quinone)  32.96 
 
 
493 aa  187  3e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0380  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.12 
 
 
472 aa  188  3e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000595488  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3658  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.17 
 
 
562 aa  181  4e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3948  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.51 
 
 
545 aa  177  4e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.147624 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3871  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  29.32 
 
 
539 aa  176  8e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2032  NADH dehydrogenase (quinone)  29.51 
 
 
504 aa  176  9.999999999999999e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000416  Na(+) H(+) antiporter subunit D  30.42 
 
 
498 aa  175  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12060  NADH dehydrogenase I subunit L  31.73 
 
 
506 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000252399  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1397  NADH dehydrogenase (quinone)  32.35 
 
 
501 aa  173  6.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2742  NADH dehydrogenase (quinone)  33.14 
 
 
497 aa  173  9e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0044  NADH dehydrogenase (quinone)  30.02 
 
 
525 aa  172  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.33239 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2858  NADH dehydrogenase (quinone)  31.8 
 
 
504 aa  172  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.356875  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0584  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.43 
 
 
535 aa  170  5e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0596  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.43 
 
 
535 aa  170  5e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.395006 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0574  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.64 
 
 
535 aa  170  5e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1123  putative NADH dehydrogenase  29.93 
 
 
498 aa  170  6e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0103051  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18950  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.86 
 
 
543 aa  170  7e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5212  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  34.67 
 
 
523 aa  168  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0000590255  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2525  NADH dehydrogenase (quinone)  31.03 
 
 
505 aa  169  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0164  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  27.94 
 
 
538 aa  169  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1280  NADH dehydrogenase (quinone)  33.24 
 
 
499 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6653  Na(+)/H(+) antiporter subunit D  30 
 
 
529 aa  166  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3221  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.3 
 
 
500 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0669  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  29.86 
 
 
538 aa  165  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3716  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  30.46 
 
 
559 aa  164  3e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0135  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  29.31 
 
 
513 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.501467  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2712  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.89 
 
 
574 aa  164  5.0000000000000005e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0742  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  27.66 
 
 
538 aa  163  7e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.778742 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3692  NADH dehydrogenase (quinone)  28.05 
 
 
500 aa  163  1e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2093  NADH dehydrogenase (quinone)  28.05 
 
 
501 aa  161  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.156897  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35440  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  28.64 
 
 
540 aa  160  4e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.708783 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0097  NADH dehydrogenase (quinone)  28.04 
 
 
505 aa  160  5e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.988192  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14770  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.2 
 
 
510 aa  160  5e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.18278  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2099  NADH dehydrogenase (quinone)  30.95 
 
 
498 aa  160  6e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.805314  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1037  NADH dehydrogenase (quinone)  32.86 
 
 
497 aa  160  7e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0301781 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1771  NADH dehydrogenase (quinone)  28.08 
 
 
500 aa  160  7e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0210  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  30.55 
 
 
525 aa  160  7e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.924509  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1398  NADH dehydrogenase (quinone)  32.39 
 
 
498 aa  159  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0731  quinone dependent NADH dehydrogenase  29.91 
 
 
511 aa  159  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.156813  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01560  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  34.83 
 
 
493 aa  157  4e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2341  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.21 
 
 
504 aa  157  6e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0348  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  28.83 
 
 
547 aa  157  6e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0328119  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2864  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.53 
 
 
566 aa  155  1e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479761  normal  0.594337 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01550  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  31.03 
 
 
505 aa  155  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.739929 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0486  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  34.81 
 
 
535 aa  155  2.9999999999999998e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25180  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  29.42 
 
 
526 aa  155  2.9999999999999998e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0648794  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2741  NADH dehydrogenase (quinone)  32.1 
 
 
482 aa  154  4e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.405496  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0751  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  29.22 
 
 
501 aa  154  4e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00659406  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1136  NADH dehydrogenase (quinone)  27.94 
 
 
476 aa  153  5.9999999999999996e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4628  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  30.77 
 
 
511 aa  152  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2586  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.53 
 
 
522 aa  152  1e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0671  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.99 
 
 
525 aa  152  2e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2288  NADH dehydrogenase (quinone)  28.54 
 
 
488 aa  152  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0535  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  27.46 
 
 
498 aa  151  3e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3717  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  29.4 
 
 
539 aa  151  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.95628 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1731  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  30.6 
 
 
505 aa  151  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.494392  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2871  NADH dehydrogenase (quinone)  28.68 
 
 
490 aa  150  4e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0563  NADH dehydrogenase (quinone)  33.15 
 
 
539 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.850315  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0949  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  25.49 
 
 
498 aa  148  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0968  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  25.49 
 
 
498 aa  148  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3185  NADH dehydrogenase (quinone)  29.95 
 
 
552 aa  147  5e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0077  NADH dehydrogenase (quinone)  28.92 
 
 
500 aa  147  6e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1205  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  30.2 
 
 
471 aa  146  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.425489  normal  0.0100074 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2437  NADH dehydrogenase (quinone)  28.88 
 
 
530 aa  145  1e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.366515 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2663  NADH dehydrogenase (quinone)  30.95 
 
 
479 aa  145  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3534  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.01 
 
 
532 aa  145  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.336988 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0980  NADH dehydrogenase (quinone)  29.58 
 
 
502 aa  145  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.723018  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1000  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  28.99 
 
 
507 aa  144  3e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.827251 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3194  NADH dehydrogenase (quinone)  29.39 
 
 
1264 aa  144  3e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.466435 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0790  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.03 
 
 
500 aa  144  3e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3807  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.19 
 
 
506 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.5869 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1673  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  28.89 
 
 
604 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3816  NADH dehydrogenase (quinone)  30.77 
 
 
509 aa  141  3e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.818014  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4506  NADH dehydrogenase (quinone)  26.93 
 
 
1265 aa  141  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.105233 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1001  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.08 
 
 
494 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.629716 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1431  NADH dehydrogenase (quinone)  30.31 
 
 
498 aa  140  6e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.352854  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0812  NADH dehydrogenase (quinone)  31.03 
 
 
503 aa  140  6e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.114491  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3984  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  28.88 
 
 
503 aa  139  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3530  NADH dehydrogenase (quinone)  32.35 
 
 
470 aa  139  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>