More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1711 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_1638  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  88.94 
 
 
452 aa  796    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1711  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  100 
 
 
452 aa  882    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4787  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  37.8 
 
 
475 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1615  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  37.29 
 
 
485 aa  233  4.0000000000000004e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.619005  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3341  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  34.94 
 
 
484 aa  226  8e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.115126  normal  0.467258 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2761  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  34.64 
 
 
484 aa  225  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1473  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  34.35 
 
 
480 aa  221  1.9999999999999999e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.38482 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3543  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  33.12 
 
 
480 aa  217  4e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.229766  normal  0.874469 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2571  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  36.98 
 
 
483 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0805  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  36.05 
 
 
401 aa  179  8e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0580  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.97 
 
 
476 aa  153  7e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.817185  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1163  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter MnhD subunit-like  30.32 
 
 
507 aa  144  3e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.63442  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1635  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.09 
 
 
502 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.193581  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0121  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  34.77 
 
 
491 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0135  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  29.41 
 
 
513 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.501467  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1107  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.98 
 
 
488 aa  122  1.9999999999999998e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.980044  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0706  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase family protein  31.23 
 
 
458 aa  119  7.999999999999999e-26  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.409683  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0179  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.92 
 
 
491 aa  119  9.999999999999999e-26  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.490475  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0589  NADH dehydrogenase (quinone)  32.52 
 
 
473 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2286  NADH dehydrogenase (quinone)  29.63 
 
 
437 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2525  NADH dehydrogenase (quinone)  30.79 
 
 
505 aa  114  5e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0107  NADH dehydrogenase (quinone)  25.65 
 
 
500 aa  112  9e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000249004 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1281  NADH dehydrogenase (quinone)  31.42 
 
 
493 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2663  NADH dehydrogenase (quinone)  31.75 
 
 
479 aa  108  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0320  NADH dehydrogenase (quinone)  31.64 
 
 
531 aa  107  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0844  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  30 
 
 
548 aa  106  7e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.639175  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2967  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.27 
 
 
501 aa  106  9e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.37012 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3948  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  27.13 
 
 
545 aa  105  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.147624 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3953  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  29.32 
 
 
492 aa  105  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3284  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  29.37 
 
 
492 aa  105  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.141551  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0574  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  28.11 
 
 
535 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0584  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  27.81 
 
 
535 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0596  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  27.81 
 
 
535 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.395006 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0890  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  29.37 
 
 
507 aa  104  4e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.50733  normal  0.143167 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3658  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  28.79 
 
 
562 aa  102  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0742  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  29.13 
 
 
538 aa  102  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.778742 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3530  NADH dehydrogenase (quinone)  29.76 
 
 
470 aa  101  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12060  NADH dehydrogenase I subunit L  27.59 
 
 
506 aa  102  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000252399  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2161  NADH dehydrogenase (quinone)  31.21 
 
 
501 aa  102  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0164  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  28.83 
 
 
538 aa  101  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0875  hydrogenase subunit F  29.06 
 
 
482 aa  101  3e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00115046 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0669  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  28.62 
 
 
538 aa  100  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1397  NADH dehydrogenase (quinone)  31.9 
 
 
501 aa  100  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3716  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  29.45 
 
 
559 aa  100  5e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3871  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  28.48 
 
 
539 aa  100  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3447  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  29.52 
 
 
541 aa  100  7e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.209361  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1607  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  29.76 
 
 
466 aa  100  7e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.410462  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3666  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  29.7 
 
 
492 aa  99.8  9e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.752681  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1001  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.07 
 
 
494 aa  99.8  9e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.629716 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0563  NADH dehydrogenase (quinone)  30.66 
 
 
539 aa  99.4  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.850315  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2099  NADH dehydrogenase (quinone)  27.93 
 
 
498 aa  99.4  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.805314  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1781  hydrogenase subunit F  28.57 
 
 
482 aa  99  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18950  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  27.55 
 
 
543 aa  98.6  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0508  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  25.87 
 
 
499 aa  98.2  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000163951  hitchhiker  0.000000287422 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1772  Na(+)/H(+) antiporter subunit D  28.57 
 
 
499 aa  97.8  3e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0380  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  28.16 
 
 
472 aa  97.8  3e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000595488  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2456  NADH dehydrogenase (quinone)  28.86 
 
 
662 aa  97.8  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0192367  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0918  NADH dehydrogenase (quinone)  29.48 
 
 
559 aa  97.8  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0751  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  29.19 
 
 
501 aa  97.4  5e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00659406  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3221  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  29.09 
 
 
500 aa  97.1  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3692  NADH dehydrogenase (quinone)  29.61 
 
 
500 aa  97.1  6e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1042  hydrogenase subunit F  28.54 
 
 
482 aa  97.1  6e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0877  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.07 
 
 
517 aa  96.3  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0349434  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0916  hydrogenase 4 subunit B  27.35 
 
 
674 aa  95.9  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2093  NADH dehydrogenase (quinone)  27.59 
 
 
501 aa  95.9  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.156897  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2863  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.67 
 
 
498 aa  96.3  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.845476  normal  0.745609 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1138  NADH dehydrogenase (quinone)  27.2 
 
 
470 aa  95.5  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1123  putative NADH dehydrogenase  30.4 
 
 
498 aa  95.5  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0103051  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0610  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  34.85 
 
 
520 aa  95.1  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1136  NADH dehydrogenase (quinone)  25.62 
 
 
476 aa  95.5  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0077  NADH dehydrogenase (quinone)  27.78 
 
 
500 aa  95.1  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4834  NADH dehydrogenase (quinone)  27.57 
 
 
585 aa  94.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0937  hydrogenase subunit F  28.3 
 
 
482 aa  94.7  3e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0980  NADH dehydrogenase (quinone)  30 
 
 
502 aa  94.7  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.723018  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2858  NADH dehydrogenase (quinone)  27.94 
 
 
504 aa  94.7  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.356875  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1771  NADH dehydrogenase (quinone)  26.01 
 
 
500 aa  94.7  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0486  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  26.5 
 
 
535 aa  94.4  4e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4285  NADH dehydrogenase (quinone)  28.78 
 
 
499 aa  94.4  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.14859  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0179  hydrogenase 4 subunit B  29.29 
 
 
669 aa  94  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.987712  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5153  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  28.7 
 
 
548 aa  93.6  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.939463  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6065  hydrogenase 4 subunit B  28.61 
 
 
669 aa  93.6  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388772  hitchhiker  0.000500664 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1688  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  28.79 
 
 
495 aa  93.6  7e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.565022  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1003  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  29.62 
 
 
517 aa  93.6  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00150473  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2851  NADH dehydrogenase (quinone)  27.45 
 
 
505 aa  93.2  9e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7678  NADH dehydrogenase subunit N  31.86 
 
 
557 aa  92.8  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0403  sodium/proton antiporter protein  26.75 
 
 
499 aa  92.8  1e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1742  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  28.85 
 
 
457 aa  92.8  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0509  NADH dehydrogenase (quinone)  27.09 
 
 
748 aa  92.8  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000352419  hitchhiker  0.0000000405513 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1261  hydrogenase 4 subunit B  30.47 
 
 
668 aa  91.7  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0703  NADH dehydrogenase (quinone)  31.75 
 
 
662 aa  92  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.20305  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4668  hydrogenase 4 subunit F  26.17 
 
 
484 aa  92  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.423781  normal  0.195535 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1205  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  27.87 
 
 
471 aa  92  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.425489  normal  0.0100074 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2032  NADH dehydrogenase (quinone)  27.16 
 
 
504 aa  91.7  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0044  NADH dehydrogenase (quinone)  25.23 
 
 
525 aa  91.7  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.33239 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1160  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  27.33 
 
 
495 aa  91.3  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1263  hydrogenase 4 subunit F  31.07 
 
 
483 aa  91.3  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0336263 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0917  NADH dehydrogenase (quinone)  27.41 
 
 
486 aa  91.3  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.958268  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3852  hydrogenase 4 subunit F  32.04 
 
 
483 aa  91.3  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0294681  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4405  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  31.37 
 
 
521 aa  91.3  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0671  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  27.86 
 
 
525 aa  90.9  4e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>