More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7678 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7678  NADH dehydrogenase subunit N  100 
 
 
557 aa  1079    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4405  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  62.52 
 
 
521 aa  591  1e-167  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0280  NADH dehydrogenase subunit N  58.44 
 
 
519 aa  583  1.0000000000000001e-165  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6081  NADH dehydrogenase subunit N  58.54 
 
 
525 aa  565  1e-160  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.110673 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13179  NADH dehydrogenase subunit N  56.51 
 
 
531 aa  565  1e-160  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000788035  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0597  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  57.91 
 
 
516 aa  561  1e-158  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1534  NADH dehydrogenase subunit N  59.63 
 
 
524 aa  561  1e-158  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1564  NADH dehydrogenase subunit N  59.07 
 
 
524 aa  557  1e-157  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1588  NADH dehydrogenase subunit N  59.07 
 
 
524 aa  557  1e-157  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1872  NADH dehydrogenase subunit N  59.85 
 
 
523 aa  555  1e-157  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4494  NADH dehydrogenase subunit N  59.45 
 
 
527 aa  548  1e-155  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234368  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0551  NADH dehydrogenase subunit N  57.84 
 
 
511 aa  546  1e-154  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.170778 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0294  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit N  58.02 
 
 
516 aa  547  1e-154  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03290  NADH dehydrogenase subunit N  55.85 
 
 
523 aa  530  1e-149  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4052  NADH dehydrogenase subunit N  56.74 
 
 
517 aa  521  1e-146  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4450  NADH dehydrogenase subunit N  56.18 
 
 
517 aa  519  1e-146  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3216  NADH dehydrogenase subunit N  56.17 
 
 
531 aa  513  1e-144  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0912532 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1287  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase chain N  52.75 
 
 
524 aa  503  1e-141  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0533  NADH dehydrogenase subunit N  52.8 
 
 
533 aa  502  1e-141  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0389  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  53.53 
 
 
572 aa  494  9.999999999999999e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.655612  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6669  NADH dehydrogenase subunit N  53.11 
 
 
527 aa  494  9.999999999999999e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2682  NADH dehydrogenase subunit N  54.53 
 
 
549 aa  482  1e-135  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4545  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  58.13 
 
 
515 aa  476  1e-133  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2703  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  55.71 
 
 
565 aa  473  1e-132  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5066  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  53.75 
 
 
550 aa  468  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.146495  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0482  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  47.41 
 
 
577 aa  453  1.0000000000000001e-126  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07510  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  50.48 
 
 
601 aa  427  1e-118  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0423349 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0987  NADH dehydrogenase subunit N  52.47 
 
 
566 aa  426  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0552  NADH dehydrogenase subunit N  47.98 
 
 
595 aa  417  9.999999999999999e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3181  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  48.19 
 
 
489 aa  392  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3913  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.46 
 
 
484 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00947726  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3997  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.9 
 
 
484 aa  337  5e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000145743 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3125  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  40.61 
 
 
487 aa  332  7.000000000000001e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0998153  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4231  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.78 
 
 
487 aa  325  1e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0521888  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3342  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.99 
 
 
484 aa  320  5e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.572203 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0351  NADH dehydrogenase I, N subunit  37.63 
 
 
484 aa  311  2e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1303  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.34 
 
 
492 aa  300  6e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.346508  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1036  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.72 
 
 
489 aa  295  2e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.14168  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3211  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  42.68 
 
 
491 aa  289  1e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3382  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.28 
 
 
498 aa  273  5.000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1215  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.74 
 
 
476 aa  271  2e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2230  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.75 
 
 
498 aa  264  3e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0444  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  45.55 
 
 
491 aa  262  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0443  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  45.55 
 
 
491 aa  262  1e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0415  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  45.55 
 
 
491 aa  262  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0815  NADH dehydrogenase subunit N  41.38 
 
 
478 aa  261  2e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.185005  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0810  NADH dehydrogenase subunit N  41.38 
 
 
478 aa  258  2e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3285  NADH dehydrogenase subunit N  39.84 
 
 
479 aa  257  4e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.917903  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2036  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.14 
 
 
476 aa  256  8e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4069  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.34 
 
 
457 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.103655  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3213  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.91 
 
 
483 aa  254  4.0000000000000004e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.175572  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1531  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.61 
 
 
482 aa  254  4.0000000000000004e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1655  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  40.3 
 
 
505 aa  254  4.0000000000000004e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1251  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  44.48 
 
 
500 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.348771  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2931  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.96 
 
 
477 aa  252  2e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2872  NADH dehydrogenase subunit N  39.3 
 
 
478 aa  252  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.562187  normal  0.277076 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0903  NADH dehydrogenase subunit N  40.91 
 
 
480 aa  251  3e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4403  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.97 
 
 
482 aa  251  3e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.511362 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0376  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.61 
 
 
523 aa  249  8e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4548  NADH dehydrogenase subunit N  39.94 
 
 
475 aa  249  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.169916  normal  0.130526 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4620  NADH dehydrogenase subunit N  41.47 
 
 
476 aa  247  4.9999999999999997e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0124009 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1874  NADH dehydrogenase subunit N  39.34 
 
 
478 aa  246  6e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.687941  normal  0.163647 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2587  NADH dehydrogenase subunit N  38.48 
 
 
478 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.43534  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4139  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  40.41 
 
 
482 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1074  NADH dehydrogenase subunit N  38.38 
 
 
485 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2207  NADH dehydrogenase subunit N  39.62 
 
 
478 aa  245  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3541  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  38.56 
 
 
517 aa  243  5e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4154  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  46.2 
 
 
489 aa  243  5e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0272141 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3624  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.76 
 
 
479 aa  243  6e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1996  NADH dehydrogenase subunit N  37.68 
 
 
492 aa  243  6e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0638246  normal  0.0907291 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1296  NADH dehydrogenase subunit N  40.77 
 
 
476 aa  243  6e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.740418  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5946  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.32 
 
 
467 aa  243  7e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1041  NADH dehydrogenase subunit N  38.29 
 
 
491 aa  243  9e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.327315 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0724  NADH dehydrogenase subunit N  37.88 
 
 
485 aa  242  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.482677  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2573  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  38.3 
 
 
517 aa  242  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.263369 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1729  NADH dehydrogenase subunit N  38.19 
 
 
479 aa  242  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31279  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1816  NADH dehydrogenase subunit N  37.88 
 
 
490 aa  242  1e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.266253  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1449  NADH dehydrogenase subunit N  37.88 
 
 
490 aa  242  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1303  NADH dehydrogenase subunit N  37.88 
 
 
490 aa  242  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573769  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1312  NADH dehydrogenase subunit N  37.88 
 
 
490 aa  242  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1143  NADH dehydrogenase subunit N  37.88 
 
 
485 aa  242  1e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271552  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2410  NADH dehydrogenase subunit N  41.38 
 
 
478 aa  242  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0625167  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0426  NADH dehydrogenase subunit N  37.88 
 
 
485 aa  242  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.3165  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5564  NADH dehydrogenase subunit N  40.06 
 
 
489 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.345499 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0830  NADH dehydrogenase subunit N  36.27 
 
 
478 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0559  NADH dehydrogenase subunit N  36.27 
 
 
482 aa  240  5e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3896  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.31 
 
 
464 aa  240  5e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3622  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39 
 
 
483 aa  239  6.999999999999999e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149081  normal  0.0891117 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0852  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  33.12 
 
 
511 aa  239  8e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00934682  normal  0.437554 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1162  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.54 
 
 
530 aa  239  9e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1604  NADH dehydrogenase subunit N  35.73 
 
 
482 aa  239  1e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1624  NADH dehydrogenase subunit N  40.06 
 
 
488 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2274  NADH dehydrogenase subunit N  40.06 
 
 
488 aa  239  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2236  NADH dehydrogenase subunit N  40.06 
 
 
488 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2260  NADH dehydrogenase subunit N  40.06 
 
 
488 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.664069 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2153  NADH dehydrogenase subunit N  40.06 
 
 
488 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.175496  normal  0.239653 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1274  NADH dehydrogenase subunit N  39.78 
 
 
481 aa  238  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1296  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.35 
 
 
511 aa  238  3e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1568  NADH dehydrogenase subunit N  40.2 
 
 
487 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.328427  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1276  NADH dehydrogenase subunit N  37.05 
 
 
497 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.22261  normal  0.209914 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>