More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_03290 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_03290  NADH dehydrogenase subunit N  100 
 
 		 523 aa  1016    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6669  NADH dehydrogenase subunit N  71.02 
 
 		 527 aa  677    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1287  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase chain N  57.31 
 
 		 524 aa  555  1e-157  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4450  NADH dehydrogenase subunit N  57.17 
 
 		 517 aa  544  1e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4052  NADH dehydrogenase subunit N  57.56 
 
 		 517 aa  538  9.999999999999999e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0280  NADH dehydrogenase subunit N  56.83 
 
 		 519 aa  540  9.999999999999999e-153  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6081  NADH dehydrogenase subunit N  55.95 
 
 		 525 aa  532  1e-150  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.110673 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4405  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  58.4 
 
 		 521 aa  530  1e-149  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0597  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  55.86 
 
 		 516 aa  526  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7678  NADH dehydrogenase subunit N  55.85 
 
 		 557 aa  520  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0294  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit N  55.98 
 
 		 516 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0551  NADH dehydrogenase subunit N  56.04 
 
 		 511 aa  516  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.170778 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4545  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  61.34 
 
 		 515 aa  496  1e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1534  NADH dehydrogenase subunit N  53.88 
 
 		 524 aa  491  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1564  NADH dehydrogenase subunit N  53.49 
 
 		 524 aa  489  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1588  NADH dehydrogenase subunit N  53.49 
 
 		 524 aa  489  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1872  NADH dehydrogenase subunit N  53.97 
 
 		 523 aa  488  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13179  NADH dehydrogenase subunit N  50.67 
 
 		 531 aa  479  1e-134  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000788035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0533  NADH dehydrogenase subunit N  51.24 
 
 		 533 aa  480  1e-134  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4494  NADH dehydrogenase subunit N  53.59 
 
 		 527 aa  478  1e-133  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0987  NADH dehydrogenase subunit N  56.14 
 
 		 566 aa  474  1e-132  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2682  NADH dehydrogenase subunit N  52.08 
 
 		 549 aa  463  1e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5066  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  52.55 
 
 		 550 aa  444  1e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.146495  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3216  NADH dehydrogenase subunit N  53.43 
 
 		 531 aa  437  1e-121  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0912532 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0389  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  47.93 
 
 		 572 aa  423  1e-117  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.655612  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0482  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  49.9 
 
 		 577 aa  417  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2703  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  52.33 
 
 		 565 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07510  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  51.52 
 
 		 601 aa  390  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0423349 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0552  NADH dehydrogenase subunit N  46.04 
 
 		 595 aa  385  1e-106  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3181  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  52.53 
 
 		 489 aa  341  2e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4231  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.86 
 
 		 487 aa  329  8e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0521888  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0351  NADH dehydrogenase I, N subunit  40.55 
 
 		 484 aa  322  8e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3913  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.77 
 
 		 484 aa  318  1e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00947726  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3125  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.33 
 
 		 487 aa  317  3e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0998153  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3997  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.38 
 
 		 484 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000145743 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3342  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.35 
 
 		 484 aa  311  1e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.572203 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3211  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  43.86 
 
 		 491 aa  295  1e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1303  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.7 
 
 		 492 aa  288  2e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.346508  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1036  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.08 
 
 		 489 aa  277  3e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.14168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2931  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  44.44 
 
 		 477 aa  270  4e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0559  NADH dehydrogenase subunit N  34.92 
 
 		 482 aa  264  2e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1604  NADH dehydrogenase subunit N  34.72 
 
 		 482 aa  263  4e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1215  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  41.51 
 
 		 476 aa  263  4e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3382  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.43 
 
 		 498 aa  264  4e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0721  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.76 
 
 		 482 aa  261  3e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.733777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1874  NADH dehydrogenase subunit N  46.27 
 
 		 478 aa  260  4e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.687941  normal  0.163647 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0810  NADH dehydrogenase subunit N  43.81 
 
 		 478 aa  260  4e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3213  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  42.54 
 
 		 483 aa  260  5.0000000000000005e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.175572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4620  NADH dehydrogenase subunit N  42.4 
 
 		 476 aa  260  5.0000000000000005e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0124009 
 
 
-
 
NC_004310  BR0815  NADH dehydrogenase subunit N  43.5 
 
 		 478 aa  258  2e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.185005  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0830  NADH dehydrogenase subunit N  36.51 
 
 		 478 aa  257  4e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2207  NADH dehydrogenase subunit N  44.85 
 
 		 478 aa  257  4e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3285  NADH dehydrogenase subunit N  45.43 
 
 		 479 aa  257  4e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.917903  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2587  NADH dehydrogenase subunit N  41.51 
 
 		 478 aa  256  6e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.43534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2872  NADH dehydrogenase subunit N  44.82 
 
 		 478 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.562187  normal  0.277076 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4069  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.3 
 
 		 457 aa  253  6e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.103655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1957  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.67 
 
 		 488 aa  253  8.000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0608114 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1155  NADH dehydrogenase subunit N  43.32 
 
 		 483 aa  252  1e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.410866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4548  NADH dehydrogenase subunit N  44.65 
 
 		 475 aa  251  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.169916  normal  0.130526 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3896  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.64 
 
 		 464 aa  251  3e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2230  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.74 
 
 		 498 aa  250  5e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2048  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.59 
 
 		 482 aa  250  5e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0999  NADH dehydrogenase subunit N  35.91 
 
 		 480 aa  249  7e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0903  NADH dehydrogenase subunit N  40.88 
 
 		 480 aa  249  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2036  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.63 
 
 		 476 aa  249  1e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1996  NADH dehydrogenase subunit N  35.13 
 
 		 492 aa  248  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0638246  normal  0.0907291 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2573  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  38.8 
 
 		 517 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.263369 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1251  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  43.82 
 
 		 500 aa  248  2e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.348771  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3541  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  38.8 
 
 		 517 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1296  NADH dehydrogenase subunit N  42.18 
 
 		 476 aa  246  6e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.740418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3622  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  40.16 
 
 		 483 aa  246  6e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149081  normal  0.0891117 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0934  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  43.58 
 
 		 478 aa  246  8e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1568  NADH dehydrogenase subunit N  42.47 
 
 		 487 aa  246  9e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.328427  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2274  NADH dehydrogenase subunit N  38.14 
 
 		 488 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2385  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  41.21 
 
 		 477 aa  245  1.9999999999999999e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.644113  normal  0.998345 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1729  NADH dehydrogenase subunit N  40.47 
 
 		 479 aa  244  3e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31279  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2153  NADH dehydrogenase subunit N  35.65 
 
 		 488 aa  244  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.175496  normal  0.239653 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0962  NADH dehydrogenase subunit N  39.13 
 
 		 494 aa  244  3e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0470739  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5564  NADH dehydrogenase subunit N  37.98 
 
 		 489 aa  244  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.345499 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1624  NADH dehydrogenase subunit N  37.89 
 
 		 488 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2260  NADH dehydrogenase subunit N  37.98 
 
 		 488 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.664069 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2236  NADH dehydrogenase subunit N  37.89 
 
 		 488 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1416  NADH dehydrogenase subunit N  39.79 
 
 		 494 aa  243  6e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.557478  normal  0.0209663 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1074  NADH dehydrogenase subunit N  38.08 
 
 		 485 aa  243  7e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5946  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  40.1 
 
 		 467 aa  243  7.999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1303  NADH dehydrogenase subunit N  39.62 
 
 		 490 aa  242  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573769  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1816  NADH dehydrogenase subunit N  39.62 
 
 		 490 aa  242  1e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.266253  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1449  NADH dehydrogenase subunit N  39.62 
 
 		 490 aa  242  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0724  NADH dehydrogenase subunit N  38.34 
 
 		 485 aa  242  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.482677  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1312  NADH dehydrogenase subunit N  39.62 
 
 		 490 aa  242  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3201  NADH dehydrogenase subunit N  39.52 
 
 		 490 aa  242  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0319113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0426  NADH dehydrogenase subunit N  38.34 
 
 		 485 aa  242  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.3165  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1143  NADH dehydrogenase subunit N  38.34 
 
 		 485 aa  242  1e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271552  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1356  NADH dehydrogenase subunit N  39.78 
 
 		 490 aa  241  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00252031  normal  0.0117379 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2692  NADH dehydrogenase subunit N  39.05 
 
 		 480 aa  241  2e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2417  NADH dehydrogenase subunit N  40.51 
 
 		 478 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.150272  normal  0.0107759 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1041  NADH dehydrogenase subunit N  37.09 
 
 		 491 aa  240  4e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.327315 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2823  NADH dehydrogenase subunit N  38.52 
 
 		 479 aa  240  5e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1655  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.85 
 
 		 505 aa  240  5e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5167  NADH dehydrogenase subunit N  39.53 
 
 		 497 aa  239  5.999999999999999e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>