More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1287 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1287  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase chain N  100 
 
 
524 aa  1024    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4450  NADH dehydrogenase subunit N  60.83 
 
 
517 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4052  NADH dehydrogenase subunit N  61.21 
 
 
517 aa  597  1e-169  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03290  NADH dehydrogenase subunit N  57.31 
 
 
523 aa  539  9.999999999999999e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0597  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  55.79 
 
 
516 aa  519  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0280  NADH dehydrogenase subunit N  54.83 
 
 
519 aa  517  1.0000000000000001e-145  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6669  NADH dehydrogenase subunit N  54.88 
 
 
527 aa  514  1e-144  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0294  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit N  56.41 
 
 
516 aa  508  1e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4405  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  55.96 
 
 
521 aa  502  1e-141  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6081  NADH dehydrogenase subunit N  52.78 
 
 
525 aa  492  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.110673 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7678  NADH dehydrogenase subunit N  52.01 
 
 
557 aa  484  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0551  NADH dehydrogenase subunit N  53.47 
 
 
511 aa  479  1e-134  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.170778 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1534  NADH dehydrogenase subunit N  50.56 
 
 
524 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1872  NADH dehydrogenase subunit N  51.5 
 
 
523 aa  467  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4494  NADH dehydrogenase subunit N  51.22 
 
 
527 aa  465  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234368  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1564  NADH dehydrogenase subunit N  50 
 
 
524 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1588  NADH dehydrogenase subunit N  50 
 
 
524 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13179  NADH dehydrogenase subunit N  49.72 
 
 
531 aa  456  1e-127  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000788035  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0533  NADH dehydrogenase subunit N  48.71 
 
 
533 aa  458  1e-127  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4545  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  52.54 
 
 
515 aa  440  9.999999999999999e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2682  NADH dehydrogenase subunit N  52.54 
 
 
549 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0389  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  49.22 
 
 
572 aa  432  1e-120  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.655612  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3216  NADH dehydrogenase subunit N  52.3 
 
 
531 aa  434  1e-120  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0912532 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0987  NADH dehydrogenase subunit N  50.93 
 
 
566 aa  423  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5066  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  51.24 
 
 
550 aa  421  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.146495  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0482  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  47.56 
 
 
577 aa  400  9.999999999999999e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0552  NADH dehydrogenase subunit N  45.89 
 
 
595 aa  375  1e-103  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2703  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  52.64 
 
 
565 aa  373  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07510  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  49 
 
 
601 aa  372  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0423349 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3181  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  45.14 
 
 
489 aa  342  9e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4231  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.44 
 
 
487 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0521888  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3342  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.49 
 
 
484 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.572203 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1303  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.42 
 
 
492 aa  275  2.0000000000000002e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.346508  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3997  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.96 
 
 
484 aa  268  1e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000145743 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3211  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  40.6 
 
 
491 aa  269  1e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3913  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.21 
 
 
484 aa  267  4e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00947726  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3125  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.39 
 
 
487 aa  266  8.999999999999999e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0998153  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0351  NADH dehydrogenase I, N subunit  36.55 
 
 
484 aa  263  6e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3382  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.73 
 
 
498 aa  257  4e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1036  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.79 
 
 
489 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.14168  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1531  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.8 
 
 
482 aa  244  3e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0444  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  42.67 
 
 
491 aa  244  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0443  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  42.67 
 
 
491 aa  244  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0415  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  42.67 
 
 
491 aa  243  6e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2230  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.34 
 
 
498 aa  243  7.999999999999999e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3285  NADH dehydrogenase subunit N  41.86 
 
 
479 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.917903  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1215  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.36 
 
 
476 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3622  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.44 
 
 
483 aa  240  5e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149081  normal  0.0891117 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2048  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.38 
 
 
482 aa  237  4e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3201  NADH dehydrogenase subunit N  36.48 
 
 
490 aa  237  4e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0319113  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0852  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.16 
 
 
511 aa  236  8e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00934682  normal  0.437554 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4620  NADH dehydrogenase subunit N  40.29 
 
 
476 aa  235  2.0000000000000002e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0124009 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1356  NADH dehydrogenase subunit N  36.22 
 
 
490 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00252031  normal  0.0117379 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2872  NADH dehydrogenase subunit N  38.1 
 
 
478 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.562187  normal  0.277076 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0830  NADH dehydrogenase subunit N  35.96 
 
 
478 aa  234  3e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2587  NADH dehydrogenase subunit N  35.01 
 
 
478 aa  234  3e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.43534  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2274  NADH dehydrogenase subunit N  36.48 
 
 
488 aa  234  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1296  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.56 
 
 
511 aa  233  7.000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4069  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.2 
 
 
457 aa  233  8.000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.103655  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2153  NADH dehydrogenase subunit N  36.22 
 
 
488 aa  233  9e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.175496  normal  0.239653 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2931  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.79 
 
 
477 aa  232  1e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3213  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.39 
 
 
483 aa  231  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.175572  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1996  NADH dehydrogenase subunit N  36.27 
 
 
492 aa  231  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0638246  normal  0.0907291 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5564  NADH dehydrogenase subunit N  35.97 
 
 
489 aa  231  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.345499 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0376  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.52 
 
 
523 aa  231  2e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1074  NADH dehydrogenase subunit N  36.19 
 
 
485 aa  232  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0810  NADH dehydrogenase subunit N  38.72 
 
 
478 aa  231  2e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1041  NADH dehydrogenase subunit N  35.68 
 
 
491 aa  231  3e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.327315 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2260  NADH dehydrogenase subunit N  35.97 
 
 
488 aa  231  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.664069 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1624  NADH dehydrogenase subunit N  35.97 
 
 
488 aa  231  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2236  NADH dehydrogenase subunit N  35.97 
 
 
488 aa  231  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0815  NADH dehydrogenase subunit N  38.72 
 
 
478 aa  231  4e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.185005  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0724  NADH dehydrogenase subunit N  35.94 
 
 
485 aa  229  6e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.482677  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1312  NADH dehydrogenase subunit N  35.94 
 
 
490 aa  230  6e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1816  NADH dehydrogenase subunit N  35.94 
 
 
490 aa  230  6e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.266253  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4548  NADH dehydrogenase subunit N  40.36 
 
 
475 aa  230  6e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.169916  normal  0.130526 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1449  NADH dehydrogenase subunit N  35.94 
 
 
490 aa  230  6e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1303  NADH dehydrogenase subunit N  35.94 
 
 
490 aa  230  6e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573769  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1143  NADH dehydrogenase subunit N  35.94 
 
 
485 aa  229  6e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271552  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0426  NADH dehydrogenase subunit N  35.94 
 
 
485 aa  229  6e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.3165  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2036  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.82 
 
 
476 aa  229  1e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1874  NADH dehydrogenase subunit N  36.21 
 
 
478 aa  228  2e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.687941  normal  0.163647 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4154  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  44.28 
 
 
489 aa  228  3e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0272141 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0854  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.92 
 
 
511 aa  227  4e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0903  NADH dehydrogenase subunit N  39.51 
 
 
480 aa  227  5.0000000000000005e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2820  NADH dehydrogenase subunit N  37.72 
 
 
485 aa  227  5.0000000000000005e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3896  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.75 
 
 
464 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2207  NADH dehydrogenase subunit N  35.71 
 
 
478 aa  226  6e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1251  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  42.21 
 
 
500 aa  226  8e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.348771  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1466  NADH dehydrogenase subunit N  33.65 
 
 
487 aa  225  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2760  NADH dehydrogenase subunit N  33.65 
 
 
485 aa  225  1e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1729  NADH dehydrogenase subunit N  39.47 
 
 
479 aa  226  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31279  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2500  NADH dehydrogenase subunit N  37.56 
 
 
485 aa  226  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2662  NADH dehydrogenase subunit N  37.56 
 
 
485 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0819952  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2455  NADH dehydrogenase subunit N  37.56 
 
 
485 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.756479  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2555  NADH dehydrogenase subunit N  37.56 
 
 
485 aa  226  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.968659 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3624  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.96 
 
 
479 aa  225  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1863  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.87 
 
 
513 aa  225  1e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1572  NADH dehydrogenase subunit N  33.65 
 
 
487 aa  225  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2544  NADH dehydrogenase subunit N  37.56 
 
 
485 aa  226  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>