More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4052 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_4052  NADH dehydrogenase subunit N  100 
 
 
517 aa  996    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4450  NADH dehydrogenase subunit N  95.55 
 
 
517 aa  935    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1287  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase chain N  61.21 
 
 
524 aa  612  9.999999999999999e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03290  NADH dehydrogenase subunit N  57.56 
 
 
523 aa  538  9.999999999999999e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6081  NADH dehydrogenase subunit N  57.42 
 
 
525 aa  535  1e-151  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.110673 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0280  NADH dehydrogenase subunit N  57.06 
 
 
519 aa  525  1e-148  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0294  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit N  57.52 
 
 
516 aa  519  1e-146  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0551  NADH dehydrogenase subunit N  57.59 
 
 
511 aa  521  1e-146  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.170778 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6669  NADH dehydrogenase subunit N  55.79 
 
 
527 aa  519  1e-146  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0597  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  55.53 
 
 
516 aa  516  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7678  NADH dehydrogenase subunit N  56.55 
 
 
557 aa  514  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4405  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  58.22 
 
 
521 aa  513  1e-144  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1534  NADH dehydrogenase subunit N  55.6 
 
 
524 aa  508  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1564  NADH dehydrogenase subunit N  55.03 
 
 
524 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1588  NADH dehydrogenase subunit N  55.03 
 
 
524 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1872  NADH dehydrogenase subunit N  53.31 
 
 
523 aa  488  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4494  NADH dehydrogenase subunit N  53.77 
 
 
527 aa  483  1e-135  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234368  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0533  NADH dehydrogenase subunit N  52.52 
 
 
533 aa  483  1e-135  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4545  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  57.54 
 
 
515 aa  480  1e-134  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13179  NADH dehydrogenase subunit N  52.04 
 
 
531 aa  473  1e-132  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000788035  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3216  NADH dehydrogenase subunit N  54.41 
 
 
531 aa  458  9.999999999999999e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0912532 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2682  NADH dehydrogenase subunit N  53.89 
 
 
549 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5066  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  55.23 
 
 
550 aa  439  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.146495  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0987  NADH dehydrogenase subunit N  48.89 
 
 
566 aa  436  1e-121  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0389  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  47.96 
 
 
572 aa  417  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.655612  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0482  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  46.35 
 
 
577 aa  409  1e-113  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2703  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  51.65 
 
 
565 aa  388  1e-106  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3181  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  49.8 
 
 
489 aa  382  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0552  NADH dehydrogenase subunit N  47.38 
 
 
595 aa  381  1e-104  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07510  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  48.99 
 
 
601 aa  375  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0423349 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3997  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.55 
 
 
484 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000145743 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3913  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.31 
 
 
484 aa  312  1e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00947726  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4231  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.69 
 
 
487 aa  306  7e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0521888  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0351  NADH dehydrogenase I, N subunit  39.01 
 
 
484 aa  301  2e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3342  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.27 
 
 
484 aa  299  8e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.572203 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3125  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.55 
 
 
487 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0998153  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3211  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  42.59 
 
 
491 aa  278  2e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1303  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.15 
 
 
492 aa  277  3e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.346508  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1162  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  41.23 
 
 
530 aa  271  2.9999999999999997e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3382  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.85 
 
 
498 aa  269  8.999999999999999e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2036  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  40.58 
 
 
476 aa  262  1e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1036  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.19 
 
 
489 aa  262  1e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.14168  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1215  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.27 
 
 
476 aa  261  2e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2230  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.92 
 
 
498 aa  251  2e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1041  NADH dehydrogenase subunit N  37.66 
 
 
491 aa  250  4e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.327315 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2260  NADH dehydrogenase subunit N  38.23 
 
 
488 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.664069 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1624  NADH dehydrogenase subunit N  38.23 
 
 
488 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2236  NADH dehydrogenase subunit N  38.23 
 
 
488 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5564  NADH dehydrogenase subunit N  37.97 
 
 
489 aa  248  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.345499 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2274  NADH dehydrogenase subunit N  37.97 
 
 
488 aa  247  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2153  NADH dehydrogenase subunit N  37.72 
 
 
488 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.175496  normal  0.239653 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1996  NADH dehydrogenase subunit N  37.41 
 
 
492 aa  244  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0638246  normal  0.0907291 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1251  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  44.41 
 
 
500 aa  244  3.9999999999999997e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.348771  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3213  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.87 
 
 
483 aa  243  5e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.175572  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4620  NADH dehydrogenase subunit N  36.7 
 
 
476 aa  243  5e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0124009 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3285  NADH dehydrogenase subunit N  36.25 
 
 
479 aa  243  7e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.917903  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3201  NADH dehydrogenase subunit N  38.04 
 
 
490 aa  243  7e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0319113  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0830  NADH dehydrogenase subunit N  36.32 
 
 
478 aa  243  7.999999999999999e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1074  NADH dehydrogenase subunit N  37.66 
 
 
485 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1874  NADH dehydrogenase subunit N  37.23 
 
 
478 aa  242  1e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.687941  normal  0.163647 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0903  NADH dehydrogenase subunit N  42.99 
 
 
480 aa  241  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1531  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.44 
 
 
482 aa  241  2e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2048  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  40 
 
 
482 aa  241  2e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4069  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.69 
 
 
457 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.103655  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0426  NADH dehydrogenase subunit N  37.66 
 
 
485 aa  240  4e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.3165  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1312  NADH dehydrogenase subunit N  37.66 
 
 
490 aa  240  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1816  NADH dehydrogenase subunit N  37.66 
 
 
490 aa  240  4e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.266253  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1143  NADH dehydrogenase subunit N  37.66 
 
 
485 aa  240  4e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271552  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1449  NADH dehydrogenase subunit N  37.66 
 
 
490 aa  240  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1303  NADH dehydrogenase subunit N  37.66 
 
 
490 aa  240  4e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573769  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0724  NADH dehydrogenase subunit N  37.66 
 
 
485 aa  240  4e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.482677  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1356  NADH dehydrogenase subunit N  37.78 
 
 
490 aa  240  4e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00252031  normal  0.0117379 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2207  NADH dehydrogenase subunit N  35.33 
 
 
478 aa  239  9e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2587  NADH dehydrogenase subunit N  35 
 
 
478 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.43534  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2872  NADH dehydrogenase subunit N  35.6 
 
 
478 aa  239  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.562187  normal  0.277076 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2931  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.79 
 
 
477 aa  238  2e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1604  NADH dehydrogenase subunit N  32.73 
 
 
482 aa  236  6e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0810  NADH dehydrogenase subunit N  38.31 
 
 
478 aa  236  7e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0815  NADH dehydrogenase subunit N  38.31 
 
 
478 aa  236  1.0000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.185005  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0559  NADH dehydrogenase subunit N  32.73 
 
 
482 aa  235  2.0000000000000002e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0987  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.07 
 
 
476 aa  234  3e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.740525 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1729  NADH dehydrogenase subunit N  40.98 
 
 
479 aa  234  4.0000000000000004e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31279  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4403  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  41.21 
 
 
482 aa  233  5e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.511362 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0282  NADH dehydrogenase subunit N  34.44 
 
 
485 aa  233  5e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2244  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.12 
 
 
481 aa  233  7.000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.384307  hitchhiker  0.00132093 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2617  NADH-quinone oxidoreductase, N subunit  39.12 
 
 
481 aa  233  7.000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.769901  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0253  NADH dehydrogenase subunit N  34.44 
 
 
485 aa  232  1e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0376  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.19 
 
 
523 aa  232  1e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3615  NADH dehydrogenase subunit N  39.27 
 
 
487 aa  232  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.23886  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1274  NADH dehydrogenase subunit N  42.51 
 
 
481 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1514  NADH dehydrogenase subunit N  35.32 
 
 
493 aa  231  2e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0500388 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4548  NADH dehydrogenase subunit N  40.66 
 
 
475 aa  232  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.169916  normal  0.130526 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1366  NADH dehydrogenase subunit N  42.2 
 
 
481 aa  230  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3624  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.24 
 
 
479 aa  228  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3622  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  40.29 
 
 
483 aa  229  1e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149081  normal  0.0891117 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0962  NADH dehydrogenase subunit N  36.8 
 
 
494 aa  227  3e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0470739  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3401  F420H2 dehydrogenase subunit N  32.68 
 
 
481 aa  227  4e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.280357  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2046  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  40.53 
 
 
481 aa  227  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.435365  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4131  NADH dehydrogenase subunit N  37.77 
 
 
489 aa  226  6e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1951  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.58 
 
 
481 aa  226  6e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.172883  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>