More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3615 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4131  NADH dehydrogenase subunit N  87.42 
 
 
489 aa  813    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2557  NADH dehydrogenase subunit N  77.21 
 
 
486 aa  728    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.794152  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3377  NADH dehydrogenase I, N subunit  84.54 
 
 
489 aa  804    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3209  NADH dehydrogenase subunit N  85.15 
 
 
489 aa  806    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.156976  normal  0.364595 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3615  NADH dehydrogenase subunit N  100 
 
 
487 aa  949    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.23886  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1861  NADH dehydrogenase subunit N  87.42 
 
 
489 aa  837    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.490828  normal  0.0339146 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28560  NADH dehydrogenase subunit N  79.06 
 
 
490 aa  728    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221247  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2424  NADH dehydrogenase subunit N  78.6 
 
 
494 aa  713    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.713557 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1734  NADH dehydrogenase subunit N  87.42 
 
 
489 aa  812    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0116065  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29850  NADH dehydrogenase subunit N  77 
 
 
486 aa  706    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0182151  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3703  NADH dehydrogenase subunit N  88.04 
 
 
489 aa  841    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404917  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1572  NADH dehydrogenase subunit N  59.96 
 
 
487 aa  575  1.0000000000000001e-163  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1466  NADH dehydrogenase subunit N  59.96 
 
 
487 aa  575  1.0000000000000001e-163  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1804  NADH dehydrogenase subunit N  59.96 
 
 
487 aa  575  1.0000000000000001e-163  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0242179 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3296  NADH dehydrogenase subunit N  59.18 
 
 
485 aa  565  1e-160  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.175095 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2538  NADH dehydrogenase subunit N  60.04 
 
 
485 aa  565  1e-160  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2760  NADH dehydrogenase subunit N  59.42 
 
 
485 aa  566  1e-160  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1504  NADH dehydrogenase subunit N  59.42 
 
 
485 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3120  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  62.89 
 
 
476 aa  562  1.0000000000000001e-159  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.545903  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1381  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  58.59 
 
 
485 aa  556  1e-157  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2430  NADH dehydrogenase subunit N  58.59 
 
 
485 aa  556  1e-157  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2425  NADH dehydrogenase subunit N  58.59 
 
 
485 aa  556  1e-157  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2820  NADH dehydrogenase subunit N  57.73 
 
 
485 aa  556  1e-157  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2662  NADH dehydrogenase subunit N  58.59 
 
 
485 aa  555  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0819952  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3415  NADH dehydrogenase subunit N  58.59 
 
 
485 aa  556  1e-157  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.684658  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1376  NADH dehydrogenase subunit N  58.59 
 
 
485 aa  557  1e-157  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.94237 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2569  NADH dehydrogenase subunit N  58.59 
 
 
485 aa  556  1e-157  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2652  NADH dehydrogenase subunit N  58.59 
 
 
485 aa  555  1e-157  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2544  NADH dehydrogenase subunit N  58.59 
 
 
485 aa  554  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2455  NADH dehydrogenase subunit N  58.59 
 
 
485 aa  554  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.756479  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2555  NADH dehydrogenase subunit N  58.59 
 
 
485 aa  554  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.968659 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2500  NADH dehydrogenase subunit N  58.59 
 
 
485 aa  554  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1406  NADH dehydrogenase subunit N  59.42 
 
 
485 aa  538  9.999999999999999e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.614408  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1009  NADH dehydrogenase subunit N  59.47 
 
 
487 aa  519  1e-146  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02201  NADH dehydrogenase subunit N  59.57 
 
 
425 aa  504  1e-141  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02161  hypothetical protein  59.57 
 
 
425 aa  504  1e-141  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0596  NADH dehydrogenase I, subunit N  48.57 
 
 
492 aa  429  1e-119  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0585149  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0585  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  47.95 
 
 
492 aa  425  1e-118  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0369  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  47.05 
 
 
484 aa  405  1e-111  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1687  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  47.28 
 
 
491 aa  397  1e-109  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.527467  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1025  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  43.22 
 
 
507 aa  362  7.0000000000000005e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.225352  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1347  NADH dehydrogenase I, N subunit  49.22 
 
 
493 aa  361  1e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.465517  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1115  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  47.4 
 
 
481 aa  362  1e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1108  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  49.03 
 
 
486 aa  353  2.9999999999999997e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3813  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  44.44 
 
 
479 aa  341  1e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2036  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.25 
 
 
476 aa  261  2e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2872  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.63 
 
 
473 aa  258  2e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0359336 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1215  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.71 
 
 
476 aa  257  3e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4231  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.63 
 
 
487 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0521888  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0351  NADH dehydrogenase I, N subunit  34.76 
 
 
484 aa  254  3e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3125  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.08 
 
 
487 aa  250  4e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0998153  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3342  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.01 
 
 
484 aa  250  5e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.572203 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3382  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.83 
 
 
498 aa  249  9e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3997  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.17 
 
 
484 aa  246  6e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000145743 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3913  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.1 
 
 
484 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00947726  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0706  NADH dehydrogenase (quinone)  38.32 
 
 
493 aa  239  5.999999999999999e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0875  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.31 
 
 
489 aa  239  9e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000367374  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4069  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.02 
 
 
457 aa  239  9e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.103655  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4403  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.86 
 
 
482 aa  239  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.511362 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0934  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.01 
 
 
478 aa  239  1e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0559  NADH dehydrogenase subunit N  33.89 
 
 
482 aa  238  2e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1604  NADH dehydrogenase subunit N  33.68 
 
 
482 aa  236  7e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0903  NADH dehydrogenase subunit N  38.87 
 
 
480 aa  236  7e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0987  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.55 
 
 
476 aa  235  1.0000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.740525 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4450  NADH dehydrogenase subunit N  39.27 
 
 
517 aa  235  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1874  NADH dehydrogenase subunit N  37.77 
 
 
478 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.687941  normal  0.163647 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1303  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.52 
 
 
492 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.346508  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1729  NADH dehydrogenase subunit N  39.89 
 
 
479 aa  234  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31279  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6669  NADH dehydrogenase subunit N  40.53 
 
 
527 aa  233  4.0000000000000004e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5946  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.27 
 
 
467 aa  233  4.0000000000000004e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4052  NADH dehydrogenase subunit N  39.27 
 
 
517 aa  232  1e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3213  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.48 
 
 
483 aa  232  1e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.175572  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4494  NADH dehydrogenase subunit N  37.92 
 
 
527 aa  232  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234368  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2385  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.37 
 
 
477 aa  231  2e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.644113  normal  0.998345 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2048  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.52 
 
 
482 aa  231  2e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1296  NADH dehydrogenase subunit N  38.5 
 
 
476 aa  231  2e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.740418  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3211  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.43 
 
 
491 aa  231  3e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2230  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.81 
 
 
498 aa  230  3e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1162  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  45.4 
 
 
530 aa  229  7e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1036  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.85 
 
 
489 aa  229  8e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.14168  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1755  NADH dehydrogenase subunit N  33.94 
 
 
489 aa  229  9e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.97062  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1201  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.13 
 
 
479 aa  229  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1072  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.13 
 
 
479 aa  229  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.343955 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1006  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.74 
 
 
479 aa  229  1e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0667642  normal  0.237402 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2207  NADH dehydrogenase subunit N  37.26 
 
 
478 aa  228  2e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4620  NADH dehydrogenase subunit N  35.68 
 
 
476 aa  228  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0124009 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0533  NADH dehydrogenase subunit N  36.46 
 
 
533 aa  227  4e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0415  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.64 
 
 
491 aa  226  6e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4139  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  40.93 
 
 
482 aa  226  6e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3541  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  34.82 
 
 
517 aa  226  7e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0389  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.08 
 
 
572 aa  226  8e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.655612  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3622  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.48 
 
 
483 aa  226  8e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149081  normal  0.0891117 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3741  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.55 
 
 
496 aa  226  9e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2931  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36 
 
 
477 aa  225  1e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2573  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  34.59 
 
 
517 aa  225  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.263369 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0962  NADH dehydrogenase subunit N  37.4 
 
 
494 aa  224  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0470739  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0444  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.55 
 
 
491 aa  225  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0443  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.55 
 
 
491 aa  225  2e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2417  NADH dehydrogenase subunit N  36.65 
 
 
478 aa  224  4e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.150272  normal  0.0107759 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3896  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.97 
 
 
464 aa  223  6e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>