More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A1804 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02201  NADH dehydrogenase subunit N  79.63 
 
 		 425 aa  689    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1381  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  80.08 
 
 		 485 aa  787    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2652  NADH dehydrogenase subunit N  80.08 
 
 		 485 aa  785    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02161  hypothetical protein  79.63 
 
 		 425 aa  689    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1466  NADH dehydrogenase subunit N  99.79 
 
 		 487 aa  944    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2425  NADH dehydrogenase subunit N  80.08 
 
 		 485 aa  787    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2430  NADH dehydrogenase subunit N  80.08 
 
 		 485 aa  787    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1572  NADH dehydrogenase subunit N  99.79 
 
 		 487 aa  944    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1804  NADH dehydrogenase subunit N  100 
 
 		 487 aa  947    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0242179 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2820  NADH dehydrogenase subunit N  81.72 
 
 		 485 aa  801    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1406  NADH dehydrogenase subunit N  83.98 
 
 		 485 aa  776    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.614408  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2555  NADH dehydrogenase subunit N  79.88 
 
 		 485 aa  784    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.968659 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3415  NADH dehydrogenase subunit N  80.08 
 
 		 485 aa  787    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.684658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2500  NADH dehydrogenase subunit N  79.88 
 
 		 485 aa  784    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2538  NADH dehydrogenase subunit N  83.37 
 
 		 485 aa  792    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2760  NADH dehydrogenase subunit N  84.19 
 
 		 485 aa  825    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2662  NADH dehydrogenase subunit N  80.08 
 
 		 485 aa  786    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0819952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1504  NADH dehydrogenase subunit N  84.39 
 
 		 485 aa  826    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3296  NADH dehydrogenase subunit N  90.12 
 
 		 485 aa  871    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.175095 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2455  NADH dehydrogenase subunit N  79.88 
 
 		 485 aa  784    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.756479  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2544  NADH dehydrogenase subunit N  79.88 
 
 		 485 aa  784    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2569  NADH dehydrogenase subunit N  80.08 
 
 		 485 aa  787    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1376  NADH dehydrogenase subunit N  79.88 
 
 		 485 aa  785    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.94237 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2557  NADH dehydrogenase subunit N  62.45 
 
 		 486 aa  586  1e-166  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.794152  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3615  NADH dehydrogenase subunit N  59.96 
 
 		 487 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.23886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29850  NADH dehydrogenase subunit N  62.66 
 
 		 486 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0182151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3703  NADH dehydrogenase subunit N  59.55 
 
 		 489 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1861  NADH dehydrogenase subunit N  59.34 
 
 		 489 aa  561  1e-158  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.490828  normal  0.0339146 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1009  NADH dehydrogenase subunit N  62.86 
 
 		 487 aa  552  1e-156  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3377  NADH dehydrogenase I, N subunit  59.71 
 
 		 489 aa  554  1e-156  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3209  NADH dehydrogenase subunit N  59.71 
 
 		 489 aa  551  1e-156  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.156976  normal  0.364595 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4131  NADH dehydrogenase subunit N  59.34 
 
 		 489 aa  548  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1734  NADH dehydrogenase subunit N  59.34 
 
 		 489 aa  548  1e-155  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0116065  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28560  NADH dehydrogenase subunit N  58.49 
 
 		 490 aa  543  1e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221247  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2424  NADH dehydrogenase subunit N  58.14 
 
 		 494 aa  518  1e-146  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.713557 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0369  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  57.65 
 
 		 484 aa  515  1.0000000000000001e-145  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3120  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  56.42 
 
 		 476 aa  506  9.999999999999999e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.545903  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0585  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  44.49 
 
 		 492 aa  415  1e-114  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0596  NADH dehydrogenase I, subunit N  43.66 
 
 		 492 aa  411  1e-113  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0585149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1687  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  44.82 
 
 		 491 aa  396  1e-109  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.527467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1115  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  47.05 
 
 		 481 aa  370  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1347  NADH dehydrogenase I, N subunit  48.15 
 
 		 493 aa  363  5.0000000000000005e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.465517  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3813  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  41.91 
 
 		 479 aa  344  2e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1108  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  46.37 
 
 		 486 aa  340  2.9999999999999998e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1025  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  43.18 
 
 		 507 aa  333  4e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.225352  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3382  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.68 
 
 		 498 aa  261  2e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2036  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.8 
 
 		 476 aa  259  7e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2872  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  42.05 
 
 		 473 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0359336 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1215  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.87 
 
 		 476 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0533  NADH dehydrogenase subunit N  35.69 
 
 		 533 aa  251  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2230  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.21 
 
 		 498 aa  249  8e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0706  NADH dehydrogenase (quinone)  38.33 
 
 		 493 aa  245  9.999999999999999e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6669  NADH dehydrogenase subunit N  39.1 
 
 		 527 aa  239  1e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3997  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.8 
 
 		 484 aa  236  7e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000145743 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3913  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.56 
 
 		 484 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00947726  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3211  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.27 
 
 		 491 aa  234  2.0000000000000002e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1755  NADH dehydrogenase subunit N  36.78 
 
 		 489 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.97062  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0559  NADH dehydrogenase subunit N  38 
 
 		 482 aa  235  2.0000000000000002e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3342  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.53 
 
 		 484 aa  234  3e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.572203 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4231  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.29 
 
 		 487 aa  233  5e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0521888  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1604  NADH dehydrogenase subunit N  36.91 
 
 		 482 aa  233  7.000000000000001e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0962  NADH dehydrogenase subunit N  37.82 
 
 		 494 aa  232  1e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0470739  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1303  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.45 
 
 		 492 aa  229  6e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.346508  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4069  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  33.73 
 
 		 457 aa  229  8e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.103655  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0351  NADH dehydrogenase I, N subunit  36.27 
 
 		 484 aa  229  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0389  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.58 
 
 		 572 aa  228  1e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.655612  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0415  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.79 
 
 		 491 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2048  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.18 
 
 		 482 aa  228  2e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13179  NADH dehydrogenase subunit N  35.95 
 
 		 531 aa  228  2e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000788035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0444  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.53 
 
 		 491 aa  228  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0443  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.53 
 
 		 491 aa  228  3e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4405  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.86 
 
 		 521 aa  227  5.0000000000000005e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1036  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  33.33 
 
 		 489 aa  226  6e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.14168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3896  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.75 
 
 		 464 aa  226  9e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4620  NADH dehydrogenase subunit N  32.57 
 
 		 476 aa  226  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0124009 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1287  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase chain N  33.65 
 
 		 524 aa  225  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4494  NADH dehydrogenase subunit N  36.39 
 
 		 527 aa  225  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1729  NADH dehydrogenase subunit N  37.05 
 
 		 479 aa  225  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31279  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0724  NADH dehydrogenase subunit N  34.37 
 
 		 485 aa  224  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.482677  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1312  NADH dehydrogenase subunit N  34.37 
 
 		 490 aa  224  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1816  NADH dehydrogenase subunit N  34.37 
 
 		 490 aa  224  3e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.266253  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1449  NADH dehydrogenase subunit N  34.37 
 
 		 490 aa  224  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1143  NADH dehydrogenase subunit N  34.37 
 
 		 485 aa  224  3e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271552  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0426  NADH dehydrogenase subunit N  34.37 
 
 		 485 aa  224  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.3165  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3125  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.99 
 
 		 487 aa  224  3e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0998153  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1303  NADH dehydrogenase subunit N  34.37 
 
 		 490 aa  224  3e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573769  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0597  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.67 
 
 		 516 aa  223  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2385  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  33.68 
 
 		 477 aa  223  8e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.644113  normal  0.998345 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1534  NADH dehydrogenase subunit N  36.53 
 
 		 524 aa  223  9e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0852  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  33.33 
 
 		 511 aa  222  9e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00934682  normal  0.437554 
 
 
-
 
NC_002936  DET0933  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, N subunit  35.54 
 
 		 481 aa  222  9.999999999999999e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0190823  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0294  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit N  37.56 
 
 		 516 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0815  NADH dehydrogenase subunit N  35.92 
 
 		 478 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.185005  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3401  F420H2 dehydrogenase subunit N  33.57 
 
 		 481 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.280357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0810  NADH dehydrogenase subunit N  35.92 
 
 		 478 aa  221  3e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0987  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.65 
 
 		 476 aa  221  3e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.740525 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2682  NADH dehydrogenase subunit N  36.67 
 
 		 549 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3213  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  33.74 
 
 		 483 aa  220  3.9999999999999997e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.175572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1074  NADH dehydrogenase subunit N  33.65 
 
 		 485 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0551  NADH dehydrogenase subunit N  36.36 
 
 		 511 aa  220  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.170778 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>